. 2019 Nov 8;10:1129. doi: 10.3389/fgene.2019.01129

Table 4.

Haplotype frequencies for the casein cluster CSN1S1-CSN2-CSN1S2-CSN3 for all breeds.

Haplotype	Total	Limousin	Angus	Hereford	Charolais	Simmental	Fleckvieh	Normande	Montbéliarde	Brown Swiss	Gelbvieh	Jersey	Danish Red	Holstein	DSN
N animals	1821	82	276	75	127	217	53	44	54	148	52	66	56	541	30
B-A ² -A-A	0.424	0.419	0.644	0.359	0.331	0.446	0.415	0.100	0.072	0.115	0.490	0.045	0.136	0.531	0.116
B-A ¹ -A-A	0.147	0.071	0.032	0.313	0.041	0.145	0.270	0.046	0.055	0.078	0.091		0.439	0.196	0.717
B-A ² -A-B	0.141	0.196	0.075	0.026	0.286	0.178	0.147	0.081	0.304	0.500	0.133	0.047	0.132	0.056	0.024
B-A ¹ -A-B	0.057	0.105	0.006	0.028	0.163	0.081		0.062	0.014	0.020	0.114	0.124	0.031	0.063	0.093
B-B-A-B	0.051	0.038	0.002	0.238	0.013	0.009		0.221		0.079		0.226	0.017	0.027
C-A ² -A-B	0.048	0.094	0.026	0.007	0.033	0.032		0.284		0.069		0.506	0.002	0.001
B-I-A-B	0.035	0.029	0.007	0.007		0.020		0.162	0.151			0.052		0.061	0.017
B-A ² -A-E	0.020		0.105			0.003							0.028	0.002	0.013
C-A ² -A-A	0.019	0.018	0.020	0.023	0.028	0.049	0.117	0.020	0.034	0.051				0.002
B-B-A-A	0.017				0.065	0.030	0.022		0.359	0.083				0.001
B-A ² -D-B	0.004										0.132		0.054
B-F-A-A	0.005												0.136	0.003
B-A ² -C-A	0.011		0.075
Residual	0.021	0.030	0.007		0.040	0.006	0.030	0.023	0.011	0.005	0.040		0.022	0.057	0.021

Haplotypes with at least 5% in one breed are shown.