Skip to main content
. 2019 Aug 28;81(10):1400–1408. doi: 10.1292/jvms.19-0214

Table 1. Species identification of tuberculosis positive cattle and buffalo tissue isolates by Mb400 PCR (Region of Difference 4 flanking region), spoligotyping and Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time-of-Flight (MALDI-TOF) mass spectrometry + BiotyperTM, with scores after inclusion of the MycoLyser Mycobacterium bovis and M. tuberculosis Mass Spectra Profiles.

Isolate Mb400 PCR Spoligotyping MALDI-TOF
Biotyper		 Score Isolate Mb400 PCR Spoligotyping MALDI-TOF
Biotyper		 Score
1 M. bovis SB0295 M. bovis 2.19 41 M. bovis SB0121 UN ≤1.59
2 M. bovis SB0295 M. bovis 2.42 42 M. bovis SB0121 M. bovis 1.99
3 M. bovis SB0295 M. bovis 2.48 43 M. bovis SB0121 M. bovis 2.59
4 M. bovis SB0295 M. bovis 2.30 44 M. bovis SB0121 M. bovis 1.90
5 M. bovis SB0295 M. bovis 2.30 44 M. bovis SB0121 M. bovis 2.62
6 M. bovis SB0121 UN ≤1.59 46 M. bovis SB0121 M. bovis 2.68
7 M. bovis SB0295 M. bovis 2.31 47 M. bovis SB0121 M. bovis 2.45
8 M. bovis SB0295 M. bovis 2.61 48 M. bovis SB0121 UN ≤1.59
9 M. bovis SB0121 M. bovis 2.49 49 M. bovis SB0822 UN ≤1.59
10 M. bovis SB0121 M. bovis 2.51 50 M. bovis SB0822 M. bovis 2.59
11 M. bovis SB0121 M. bovis 2.56 51 M. bovis SB0295 M. bovis 2.47
12 M. bovis SB0121 M. bovis 2.34 52 M. bovis SB0295 M. bovis 2.55
13 M. bovis SB0121 M. bovis 2.15 53 M. bovis SB0295 M. bovis 2.61
14 M. bovis SB0121 M. bovis 2.22 54 M. bovis SB0822 M. bovis 2.75
15 M. bovis SB0121 M. bovis 2.54 55 M. bovis SB0822 M. bovis 2.47
16 M. bovis SB0121 M. bovis 2.63 56 M. bovis SB1869 M. bovis 2.65
17 M. bovis SB0295 UN ≤1.59 57 M. bovis SB1869 M. bovis 2.62
18 M. bovis SB0121 M. bovis 2.45 58 M. bovis SB1800 M. bovis 2.47
19 M. bovis SB0121 M. bovis 2.35 59 M. bovis SB0822 M. bovis 2.73
20 M. bovis SB0121 M. bovis 2.39 60 M. bovis SB0822 M. bovis 2.61
21 M. bovis SB0121 M. bovis 2.33 61 M. bovis SB0295 M. bovis 2.43
22 M. bovis SB0121 M. bovis 2.26 62 M. bovis SB0822 M. bovis 2.64
23 M. bovis SB0121 M. bovis 2.46 63 Negative NA Gordonia sputi* 1.98
24 M. bovis SB0121 M. bovis 2.41 64 Negative NA Gordonia sputi* 1.61
25 M. bovis SB0121 M. bovis 2.26 65 M. bovis SB0295 M. bovis 2.61
26 M. bovis SB0121 M. bovis 2.41 66 M. bovis SB0822 M. bovis 2.52
27 M. bovis SB0121 M. bovis 2.14 67 M. bovis SB0822 M. bovis 2.66
28 M. bovis SB0121 M. bovis 2.49 68 M. bovis SB0822 M. bovis 2.72
29 Negative NA M. nonchromogenicuma) 1.89 69 M. bovis SB0121 M. bovis 2.32
30 M. bovis SB0121 M. bovis 2.15 70 M. bovis SB0822 M. bovis 2.48
31 M. bovis SB0121 M. bovis 2.10 71 M. bovis SB0295 M. bovis 2.34
32 M. bovis SB0121 M. bovis 2.11 72 M. bovis SB1869 M. bovis 2.44
33 M. bovis SB0121 M. bovis 2.29 73 M. bovis SB1869 M. bovis 2.62
34 M. bovis SB0121 UN ≤1.59 74 M. bovis SB0295 M. bovis 2.41
35 M. bovis SB0121 M. bovis 2.43 75 M. bovis SB0121 M. bovis 2.62
36 M. bovis SB0121 UN ≤1.59 76 M. bovis SB0822 M. bovis 2.51
37 M. bovis SB0121 M. bovis 2.47 77 M. bovis SB0822 M. bovis 2.53
38 M. bovis SB0121 M. bovis 2.59 78 M. bovis SB0822 M. bovis 2.56
39 M. bovis SB0121 M. bovis 2.22 79 M. bovis SB1608 M. bovis 2.61
40 M. bovis SB0121 M. bovis 2.56 80 M. bovis SB0295 M. bovis 2.35

UN: Unidentified. a) identified by the partial sequencing of the hsp65 gene. NA: Not applicable.