Table 1.
Polymorphism | Sequence 5′ to 3′ | Annealing temperature (°C) | PCR product (bp) | Restriction enzyme | Wild type | Heterozygote | Mutant |
---|---|---|---|---|---|---|---|
miR-146a C > G |
F 5′-CATGGGTTGTGTCAGTGTCAGAGC-3′ R 5′-TGCCTTCTGTCTCCAGTCTTCCA-3′ |
62 | 147 | SacI | 147 | 147/122/25 | 122/25 |
miR-149 T > C |
F 5′-TGTCTTCACTCCCGTGCTTGTCC-3′ R 5′-TGAGGCCCGAAACACCCGTA-3′ |
65 | 254 | PvuII | 254 | 254/194/60 | 194/60 |
miR-196a2 T > C |
F 5′-CCCCTTCCCTTCTCCTCCAGATA-3′ R 5′-CGAAAACCGACTGATGTAACTCCG-3′ |
63 | 149 | MspI | 149 | 149/125/24 | 125/24 |
miR-499 A > G |
F 5′-CAAAGTCTTCACTTCCCTGCC-3′ R 5′-ATGTTTAACTCCTCTCCACGTGATC-3′ |
65 | 145 | BclI | 145 | 145/120/25 | 120/25 |