Table 2. Dispersal patterns of select mutations according to country and year: Comparison of patterns of emergence of select persistent mutations in the NS1 gene.
Nt | Codon | Gene | Residue | AA | Year | N/Year | Thail | Cambo | Indon | Phili | FrPol | Haiti | Brazi | FrGui | Surin | Colom | Panam | Hondu | Guate | Mexic | PuRic |
2786 | GCT | NS1 | 100 | A | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 2 | 3 | - | |||||
2016 | 88 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 20 | 3 | 43 | - | |||||
2017 | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
3050 | GTC | NS1 | 188 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 1 | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2016 | 5 | - | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | - | |||||
2017 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
3050 | GTT | NS1 | 188 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 12 | 3 | - | - | - | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 12 | 1 | - | - | - | 4 | 7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 67 | 1 | - | - | - | - | - | 20 | 1 | 1 | 30 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | |||||
2016 | 285 | 4 | - | - | - | - | 3 | 53 | - | 2 | 19 | 1 | 20 | 3 | 47 | 2 | |||||
2017 | 9 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
3278 | ATG | NS1 | 264 | M | 2006 | 1 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 1 | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 12 | 3 | - | - | - | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 13 | 1 | - | 1 | - | 4 | 7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 67 | 1 | - | - | - | - | - | 20 | 1 | 1 | 30 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | |||||
2016 | 288 | 4 | - | - | 2 | - | 3 | 52 | - | 2 | 19 | 1 | 20 | 3 | 48 | 1 | |||||
2017 | 10 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
3458 | CAG | NS1 | 324 | Q | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2016 | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
3458 | TGG | NS1 | 324 | W | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 35 | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | 30 | 3 | - | - | - | - | |||||
2016 | 27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 17 | 1 | - | - | 2 | - | |||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
3533 | GTG | NS1 | 349 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 6 | - | - | - | - | - | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 5 | - | - | - | - | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2016 | 85 | - | - | - | - | - | 2 | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2017 | 4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
Nt | Codon | Gene | Residue | AA | Year | N/Year | Venez | Ecuad | Peru | Nicar | Guade | DoRep | USA | Jamai | Marti | Cuba | Fiji | Samoa | Tonga | Impor | |
2786 | GCT | NS1 | 100 | A | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 88 | - | - | - | 19 | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | - | - | - | - | ||||||
3050 | GTC | NS1 | 188 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 5 | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
3050 | GTT | NS1 | 188 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 285 | 10 | 3 | 2 | 19 | 1 | 30 | 49 | 4 | 1 | - | 4 | 4 | 1 | 3 | ||||||
2017 | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8 | - | - | - | - | ||||||
3278 | ATG | NS1 | 264 | M | 2006 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 288 | 10 | 3 | 2 | 18 | 1 | 29 | 53 | 4 | 1 | - | 4 | 4 | 1 | 3 | ||||||
2017 | 10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8 | - | - | - | - | ||||||
3458 | CAG | NS1 | 324 | Q | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 9 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | 4 | - | 1 | ||||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
3458 | TGG | NS1 | 324 | W | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 35 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 27 | 2 | - | 2 | - | - | 1 | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
3533 | GTG | NS1 | 349 | V | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 85 | - | 3 | - | - | 1 | 27 | 45 | 2 | - | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | - | - | - | - |