Table 3. Dispersal patterns of select mutations according to country and year: Comparison of patterns of emergence of select persistent mutations in the NS3 gene.
Nt | Codon | Gene | Residue | AA | Year | N/Year | Thail | Cambo | Indon | Phili | FrPol | Haiti | Brazi | FrGui | Surin | Colom | Panam | Hondu | Guate | Mexic | PuRic |
5810 | CAT | NS3 | 400 | H | 2006 | 1 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 11 | 2 | - | - | - | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 13 | 1 | - | 1 | - | 4 | 7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 67 | 1 | - | - | - | - | - | 20 | 1 | 1 | 30 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | |||||
2016 | 290 | 4 | - | - | - | - | 3 | 53 | - | 2 | 20 | 1 | 20 | 3 | 50 | 2 | |||||
2017 | 10 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
6026 | CTA | NS3 | 472 | L | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2016 | 11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6 | - | - | - | |||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
6026 | CTG | NS3 | 472 | L | 2006 | 1 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 1 | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 12 | 3 | - | - | - | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 13 | 1 | - | 1 | - | 4 | 7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 67 | 1 | - | - | - | - | - | 20 | 1 | 1 | 30 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | |||||
2016 | 278 | 4 | - | - | 2 | - | 3 | 52 | - | 2 | 20 | 1 | 14 | 3 | 49 | 2 | |||||
2017 | 10 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
6326 | CTG | NS3 | 572 | L | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 2 | 3 | - | |||||
2016 | 94 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 20 | 3 | 49 | - | |||||
2017 | 4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
6362 | CAC | NS3 | 584 | H | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2013 | 9 | - | - | - | - | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2014 | 12 | 1 | - | - | - | 4 | 7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |||||
2015 | 66 | 1 | - | - | - | - | - | 19 | 1 | 1 | 30 | 3 | 1 | 2 | 3 | 4 | |||||
2016 | 280 | 1 | - | - | - | - | 3 | 52 | - | 2 | 19 | 1 | 20 | 3 | 50 | 2 | |||||
2017 | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | |||||
Nt | Codon | Gene | Residue | AA | Year | N/Year | Venez | Ecuad | Peru | Nicar | Guade | DoRep | USA | Jamai | Marti | Cuba | Fiji | Samoa | Tonga | Impor | |
5810 | CAT | NS3 | 400 | H | 2006 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 290 | 10 | 3 | 2 | 20 | 1 | 30 | 50 | 3 | 1 | - | 4 | 4 | 1 | 3 | ||||||
2017 | 10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8 | - | - | - | - | ||||||
6026 | CTA | NS3 | 472 | L | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 11 | - | - | - | 5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
6026 | CTG | NS3 | 472 | L | 2006 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 278 | 10 | 3 | 2 | 14 | 1 | 28 | 52 | 3 | 1 | - | 4 | 4 | 1 | 3 | ||||||
2017 | 10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8 | - | - | - | - | ||||||
6326 | CTG | NS3 | 572 | L | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 94 | - | - | - | 19 | - | - | 3 | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2017 | 4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | - | - | - | - | ||||||
6362 | CAC | NS3 | 584 | H | 2006 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
2010 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2012 | 0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2013 | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2014 | 12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | ||||||
2015 | 66 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | ||||||
2016 | 280 | 10 | 3 | 2 | 17 | 1 | 28 | 50 | 3 | 1 | - | 4 | 4 | 1 | 3 | ||||||
2017 | 9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8 | - | - | - | - |