Table 3.
Differential nucleotides within the primer region on Cyt b gene among 13 species used in this study.
| Species | n | Forward primer L15123 (5′−3′) | Reverse primer H15240 (5′−3′) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| T | A | C | T | A | C | T | R | A | T | Y | A | C | Y | A | T | A | G | C | C | A | C | T | T | A | T | C | T | A | C | Y | G | A | A | A | A | G | C | C | T | C | C | T | C | ||
| E. maximus | 4 | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | C/T | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| L. africana | 8 | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | C | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C/T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| L. cyclotis | 9 | · | · | · | · | · | · | · | A/G | · | · | C | · | · | C/T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. primigenius | 9 | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | C | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C/T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| H. amphibium | 2 | · | · | · | · | · | · | · | C | · | C | A | · | · | C | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| M. monoceros | 3 | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | A | · | T | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | C | · | · | A | · | · | · | · |
| P. aethiopicus | 3 | · | · | · | · | · | · | · | C | · | C | T | G | T | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | A | · | · | G | · | · | A | · | · | C | · | · | · | · |
| P. catodon | 3 | · | C | · | · | · | A | · | C | · | C | A | G | T | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | G | · | · | A | · | · | G | · | · | · | · |
| O. orca | 2 | · | · | · | · | · | · | · | A | G | C | A | G | T | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | C | · | · | A | · | · | · | · |
| O. rosmarus | 2 | · | · | T | · | · | · | · | C | · | C | T | · | T | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | T | · | · | · | · | · | C | · | · | C | · | · | · | · |
| C. simum | 3 | · | · | · | · | · | T | · | C | · | C | T | C | T | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | G | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · |
| B. Taurus | 3 | · | T | · | · | G | T | · | C | · | C | A | G | T | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | G | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · |
| H. sapiens | 1 | · | C | · | · | G | · | · | T | G | C | A | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | · | C | · | G | · | · | · | · | · | T | · | · | G | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
n is the number of sequences from each species used for examining the differential nucleotides. Nucleotides identical to those in the primer sequences are shown as dots.