Table 3.

Comparisons of 11 algorithms on the four simulations.

Sim	Metrics	Algorithms
		LiNGAM	ParceLiNGAM	PWLiNGAM	GC	GS	Patel	GES	P-corr	AIAEC	ACOEC	ACOEC-FD
Sim1	PRE	0.57	0.77	0.85	0.61	0.62	0.85	0.69	0.85	0.84 ± 0.06	0.83 ± 0.07	0.85 ± 0.06
	REC	0.62	0.77	0.85	0.85	0.62	0.85	0.69	0.85	0.85 ± 0.06	0.85 ± 0.06	0.87 ± 0.06
	F1	0.59	0.77	0.85	0.71	0.62	0.85	0.69	0.85	0.84 ± 0.06	0.84 ± 0.06	0.86 ± 0.06
	SHD	6	3	2	7	5	2	4	2	2.2 ± 0.72	2.3 ± 0.74	1.8 ± 0.67
Sim2	PRE	0.54	0.69	0.76	0.52	0.58	0.73	0.59	0.54	0.80 ± 0.08	0.80 ± 0.08	0.83 ± 0.07
	REC	0.64	0.73	0.80	0.76	0.65	0.82	0.64	0.56	0.81 ± 0.08	0.82 ± 0.08	0.84 ± 0.07
	F1	0.58	0.71	0.78	0.62	0.62	0.77	0.61	0.55	0.81 ± 0.08	0.81 ± 0.08	0.84 ± 0.07
	SHD	30	18	14	39	26	17	24	26	11.6 ± 4.62	11.3 ± 4.55	8.9 ± 4.02
Sim3	PRE	0.51	0.66	0.71	0.47	0.53	0.69	0.59	0.56	0.76 ± 0.08	0.75 ± 0.08	0.78 ± 0.07
	REC	0.61	0.71	0.76	0.75	0.63	0.78	0.63	0.58	0.80 ± 0.08	0.80 ± 0.07	0.81 ± 0.07
	F1	0.55	0.69	0.73	0.58	0.58	0.73	0.61	0.57	0.78 ± 0.08	0.77 ± 0.07	0.80 ± 0.07
	SHD	61	38	33	88	57	37	45	48	26.4 ± 8.05	26.8 ± 8.08	23.1 ± 6.88
Sim4	PRE	0.50	0.62	0.69	0.48	0.52	0.67	0.56	0.54	0.74 ± 0.08	0.73 ± 0.09	0.77 ± 0.08
	REC	0.59	0.69	0.76	0.67	0.60	0.75	0.60	0.56	0.78 ± 0.08	0.78 ± 0.08	0.79 ± 0.08
	F1	0.54	0.65	0.72	0.56	0.56	0.71	0.58	0.55	0.75 ± 0.08	0.75 ± 0.08	0.78 ± 0.08
	SHD	80	56	46	96	75	50	64	64	39.1 ± 10.16	39.3 ± 10.42	31.8 ± 7.29