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. 2019 Jun 17;18(1):119–128. doi: 10.1111/pbi.13177

Table 4.

Hd1 haplotype associations with eight agronomic traits

Site Year C316T C495G G614A
Traits P R 2 P R 2 P R 2
HD 2016 LD 0.0495 0.2149 0.0154 0.3543 n.s.
2017 SD n.s. n.s. n.s.
TN 2016 LD n.s. n.s. n.s.
2017 SD n.s. n.s. n.s.
PBN 2016 LD n.s. n.s. n.s.
2017 SD n.s. n.s. n.s.
SBN 2016 LD 0.0275 0.2115 n.s. 0.0403 0.1868
2017 SD n.s. n.s. n.s.
GNPP 2016 LD 0.0146 0.2653 n.s. 0.0132 0.2717
2017 SD n.s. n.s. n.s.
TGW 2016 LD 0.0354 0.2509 n.s. 0.0025 0.4458
2017 SD n.s. n.s. 0.0387 0.2187
GWPP 2016 LD n.s. n.s. n.s.
2017 SD n.s. n.s. n.s.
GWSP 2016 LD 0.0263 0.1733 n.s. 0.0263 0.1733
2017 SD n.s. n.s. n.s.

Result of structure‐based association mapping (< 0.05) of haplotypes 8 and 13–16 by GLM analysis of TASSEL. R 2, the total variation explained by the SNP.