Table 3.
Gene | Position | Mutation | Ga1 | Ga2 | Ga3 | Ga4 | Ga5 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
qmcA ← / → fetA | 515, 859 | C→G | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
fepD ← / → entS | 622, 244 | IS5 (–) +4 bp | 0.351 | 0.000 | 0.639 | 0.000 | 0.000 |
nhaB ← | 1, 234, 632 | A→G | 0.000 | 0.190 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
ydfE → | 1, 650, 461 | C→A | 0.000 | 0.000 | 0.452 | 0.000 | 0.000 |
yedN ← | 2, 011, 665 | G→T | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
yfgF ← / → yfgG | 2, 629, 042 | IS5 (+) +4 bp | 0.000 | 0.000 | 0.500 | 0.000 | 0.000 |
ypjC ← / ← ileY | 2, 785, 563 | G→A | 0.193 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
rpoS ← | 2, 866, 695 | IS1 (+) +9 bp | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.273 |
prlF → | 3, 277, 273 | (TTCAACA)2→3 | 0.184 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
agaI → / → yraH | 3, 287, 319 | C→T | 0.161 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
dcuB ← / ← dcuR | 4, 349, 066 | T→A | 0.147 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
insI1 ← | 4, 507, 739 | G→T | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 |
fecE ← | 4, 510, 928 | A→T | 0.514 | 0.000 | 0.574 | 0.000 | 0.000 |
fecB ← | 4, 514, 119 | C→T | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.479 | 1.000 |
fecA ← | 4, 515, 480 | C→T | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.000 | 1.000 |
fecA ← | 4, 516, 171 | G→C | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
Color coding: yellow, fixation; green, major variant; blue, minor variant.