TABLE 2.

The sequence alignment of the S. parasanguinis-specific primers with the groEL gene of strains of Streptococcus spp.

Species	Strains	Spa146f (5′ - 3′)	Spa93f (5′ - 3′)	Spa525r(5′ - 3′)
		AACAATGCGATYCCAGTATCRAG	TCCGYCGTGGGATTGAGACC	CTACGACATTAAAGGTACCDCGG
S. parasanguinis	ATCC 15912	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	ATCC 903	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	FW213	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	M44	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	M688	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	F0405	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
	SK236	•••••••••••••••••••••••	••••••••••••••••••••	•••••••••••••••••••••••
S. australis	ATCC 700641	•• T ••C••C•••••••• TG • C • A	•••••••••••••••• AG • A	•••••••••• G •• A •• T ••••• A
	M624	•• T ••C••C•••••••• TG • C • A	•••••••••••••••• AG • A	•••••••••• G ••••• T ••••• A
S. infantis	ATCC 700779	•••••••• A •••••••• T •• T • A	•••••••••••••••• A •• T	• A •• T •• G •• G •• A •• C ••••• A
	SK1076	•••••••• T ••••• T •• TG • C • A	•••••••••••••••• AG • A	• A •• T •• G •• G •• A •• C ••••• A
S. oralis	ATCC 35037	•••••••• C •••••T•• TG • C • A	•••••••••••••••• AG • A	•••••••••• G ••••• T ••••• A
	ATCC 49296	•••••••• C •••••T•• TG • C • A	• T •••••••••••••• AG • T	•••• T •• G •• G ••••• T ••••• A
	CIP 105158	•T• GCC ••A• AG ••• TGT • A •• A	•••••G•• ACCT •• A • TGT •	•••••••••••••••••••••••
	CIP 104985	• T • GCC ••A• AG ••• TGT •A•• A	•••••G•• ACCT •• A • TGT •	•••••••••••••••••••••••
S. oligofermentans	AS 1.3089	G •••C•••••••••G•• T •• T • A	•••••••C•••••••• AG • A	• C •• T ••••• G ••••••••••• A
S. pneumoniae	ATCC 33400	•••••C••C••••• T •• TG • C • A	• T •••••••••••••• A •• A	•••• T •• G •• G ••••• T ••••• A
	ATCC 27336	•••••C••C••••• T •• TG • C • A	• T •••••••••••••• A •• A	•••• T •• G •• G ••••• T ••••• A
S. pseudopneumoniae	SK674	•••••C••C••••• T •• TG • C • A	• T •••••••••••••• AG • A	•••• T •• G •••••••• T ••••• A
	ATCC BAA-960	•••••C••C••••• T •• TG • C • A	• T •••••••••••••• AG • A	•••• T •• G •••••••• T ••••• A
S. mitis	ATCC 9811	•••••••• T ••••• T •• TG • C • A	• T •••••••••••••• A •• A	•••• C •• G •• G ••••• T ••••• A
	ATCC 49456	•••••••• C ••••• T•• TG • C • A	• T •••••••••••••• AG • A	• C •• C ••••• G ••••• T ••••• A
S. acidominimus	NCTC11291	GCG •T•T• ACA ••• G •• T •• TG •	• T •••••••• T ••••• AG • A	• A •••••••• G •• A •••••••• A
S. suis	BM407	GCAC •A••A• G ••• T ••••• C• A	• T ••••• C •••••••• AG ••	• A •• A •• G •• G •• T •••••••• A
	SC84	GCAC •A••A• G ••• T ••••• C• A	• T ••••• C •••••••• AG ••	• A •• A •• G •• G •• T •••••••• A
S. massiliensis	M212	• C ••• CAGTG ••••C•• T •• AG •	• T ••••• C •••••••• AG • A	•••••••••• G •• A •• T ••••••
	4401825	• C ••• CAGTG ••••C•• T •• AG •	• T ••••• C •••••••• AG • A	•••••••••• G •• A •• T ••••••
S. sanguinis	ATCC 29667	TCT ••CT• AG ••••••• T •• T • A	••••••• C •••••••• AG • A	•••••••••••••••• T ••••• A
	ATCC 10556	TCT ••CT• AG ••••••• T •• T • A	••••••• C •••••••• AG • A	•••••••••••••••• T ••••• A
S. gordonii	ATCC 10558	G • A • C •••T••••••••T•• T • A	•••••••••••••••• AG • A	•••• A •• G •• G •• A •• T ••••• A
	M437	G • A • C •••T••••••••T•• T • A	•••••••••••••••• AG • A	•••• A •• G •• G •• A •• C ••••• A
S. salivarius	ATCC 7073	GCT •T••• ACA •••••• TG • T • A	•••••••••••••••• AG • A	• A •••••••• G •• A •• T ••••• A
	JIM8777	GC ••T••• TCA •••••• TG • T • A	•••••••••••••••• AG • A	• A •• A ••••• G •• A •• T ••••• A
S. alactolyticus	CIP 103244	• T • GTC • TA • AG ••• TGC • T •• A	•••• TG •• ACCT •• A • TGT •	•••••••••••••••••••••••
	ATCC 43077	TCA • T ••• ACAA ••••• TG • T • A	• T ••••• C •• T •• C •• AT • T	•••••••••••••••••••••••