Skip to main content
. 2019 Dec 27;20(Suppl 23):656. doi: 10.1186/s12859-019-3300-9

Table 2.

Average AUC value for different methods with different settings on Binary data (B) and Continuous Data (C)

Pheno n σ k LSTM DMM LMM UT LASSO AL PL MAPIT
C 500 5 10 0.68 0.73 0.57 0.58 0.50 0.50 0.50 0.56
C 500 5 50 0.54 0.58 0.51 0.55 0.50 0.50 0.50 0.51
C 500 10 10 0.62 0.66 0.54 0.54 0.50 0.50 0.50 0.54
C 500 10 50 0.54 0.58 0.51 0.54 0.50 0.50 0.50 0.51
C 1000 5 10 0.77 0.80 0.68 0.67 0.50 0.50 0.50 0.53
C 1000 5 50 0.56 0.58 0.51 0.52 0.50 0.50 0.50 0.52
C 1000 10 10 0.68 0.71 0.63 0.57 0.50 0.50 0.50 0.51
C 1000 10 50 0.52 0.53 0.51 0.51 0.50 0.50 0.50 0.53
B 500 5 10 0.59 0.60 0.51 0.52 0.50 0.50 0.50 0.51
B 500 5 50 0.55 0.55 0.51 0.52 0.50 0.50 0.50 0.50
B 500 10 10 0.65 0.66 0.52 0.57 0.50 0.50 0.50 0.51
B 500 10 50 0.53 0.54 0.51 0.52 0.50 0.50 0.50 0.50
B 1000 5 10 0.59 0.58 0.51 0.53 0.50 0.50 0.50 0.51
B 1000 5 50 0.55 0.54 0.51 0.52 0.50 0.50 0.50 0.51
B 1000 10 10 0.66 0.65 0.51 0.54 0.50 0.50 0.50 0.51
B 1000 10 50 0.52 0.52 0.50 0.51 0.50 0.50 0.50 0.50