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. 2020 Jan 14;13:28. doi: 10.1186/s13071-020-3899-4

Table 3.

MLST allelic and WSP profiles of Wolbachia subjected for phylogenetic analyses

ID Supergroup Host species ST gatB coxA hcpA ftsZ fbpA wsp HVR1 HVR2 HVR3 HVR4
1 A Drosophila melanogaster 1 1 1 1 1 1 31 1 12 21 24
12 A Aedes albopictus 2 3 2 2 10 3 1 1 1 1 1
496 A Aedes bromeliae 304 182 160 187 148 232
114 A Notoncus sp. 53 46 42 23 6 17 49 9 9 12 9
120 A Camponotus leonardi 57 49 44 53 42 49 52 41 42 45 42
167 A Agelenopsis aperta 67 35 35 22 33 39 43 31 32 35 34
294 A Asobara japonica 370 87 111 103 70 186 530 188 213 15 25
399 A Apanteles chilonis 260 172 150 7 137 8 592 209 15 17 14
1682 A Syrphophilus asperatus 433 234 84 257 200 120 689 11 9 267 302
56 A Rhagoletis cerasi 13 1 1 1 3 1 23 1 12 21 11
2 A Solenopsis invicta 29 19 20 22 17 20 28 21 21 25 21
61 A Rhagoletis cerasi 159 53 84 85 70 79 113 67 77 12 9
68 A Agelenopsis aperta 65 32 33 38 30 37 38 28 29 33 32
88 A Drosophila testacea 99 10 72 11 14 11 13 1 11 21 11
107 A Wasmannia Peru 47 43 20 46 38 46 28 21 21 25 21
96 A Aganaspis alujai 164 54 52 62 82 62 75 11 9 15 25
129 A Dorymyrmex elegans 63 19 21 55 46 53 51 42 43 47 25
325 A Ephestia kuehniella 92 54 59 68 3 67 83 51 55 15 57
413 A Chelonus munakatae 19 7 6 7 3 8 599 2 191 192 248
29 B Culex pipiens 9 4 3 3 22 4 10 10 8 10 8
499 B Mansonia africana 305 9 38 189 36 4
19 B Chelymorpha alternans 7 9 14 15 12 14 8 7 7 8 7
22 B Acraea encedon 3 9 11 12 11 12 2 2 2 2 2
27 B Drosophila simulans 16 5 4 4 4 5 15 10 8 11 13
34 B Nasonia vitripennis 26 9 8 9 7 9 25 18 16 23 16
99 B Horaga onyx 39 12 14 13 2 41 65 34 36 3 23
118 B Pheidole sciophila 56 48 43 52 41 6 60 40 41 43 41
408 B Apanteles chilonis 271 9 150 7 142 4 593 18 79 237 16
269 B Diaphorina Diaphorina citri 175 109 86 88 126 27 160 2 17 3 23
39 B Lycaeides idas 36 9 36 40 7 9 61 18 16 23 16
73 B Lycaeides melissa 162 108 73 40 80 9 294 125 141 127 102
70 B Rhagoletis cerasi 160 101 85 40 22 4 116 69 17 3 23
40 B Hypolimnas bolina 125 4 14 40 73 4 10 10 8 10 8
87 B Drosophila innubila 98 79 71 88 69 27 82 2 35 98 23
97 B Anthene emolus 37 9 9 6 8 10 63 19 17 24 33
200 B Eurema mandarina 40 38 38 29 35 42 64 35 35 38 44
311 B Sogatella furcifera 213 106 11 13 105 162 463 2 191 192 22
315 B Macrosteles fascifrons 217 135 120 141 108 197 536 191 220 23 16
37 D Brugia malayi 35 28 29 33 26 30 34 24 24 27 26
36 F Cimex lectularius 8 26 27 31 24 28 7 6 6 7 6