Skip to main content
. 2020 Jan 21;10:3099. doi: 10.3389/fmicb.2019.03099

TABLE 1.

Specific primers for genes encoding antifungal peptides.

Peptide Gene Primer name Primers (5′–3′) Tm (°C) bp
Surfactin srfAA srfAA-F TCGGGACAGGAAGACATCAT 60 201
srfAA-R CCACTCAAACGGATAATCCTGA
Fengycin fenB fenB-F CTATAGTTTGTTGACGGCTC 55 1400
fenB-R CAGCACTGGTTCTTGTCGCA
fenD fenD-F GGCCCGTTCTCTAAATCCAT 60 269
fenD-R GTCATGCTGACGAGAGCAAA
Iturin ITUDI ITUDI-F GATGCGATCTCCTTGGATGT 59 650
ITUDI-R ATCGTCATGTGCTGCTTGAG
ituD ituD-F TTGAAYGTCAGYGCSCCTTT 58 482
ituD-R TGCGMAAATAATGGSGTCGT
ituA ituA-F ATGAAAATTTACGGAGTATATATG 53 1150
ituA-R TTATAACAGCTCTTCATACGTT
ituC ituC-F GGCTGCTGCAGATGCTTTAT 60 423
ituC-R TCGCAGATAATCGCAGTGAG
Mycosubtilin mycB mycB-F ATGTCGGTGTTTAAAAATCAAGTAACG 60 2024
mycB-R TTAGGACGCCAGCAGTTCTTCTATTGA
Bacillomycin bmyB bmyB-F GAATCCCGTTGTTCTCCAAA 60 370
bmyB-R GCGGGTATTGAATGCTTGTT
bmyD bmyD-F TTGAAYGTCAGYGCSCCTTT 51 482
bmyD-R TGCGMAAATAATGGSGTCGT
Bacilysin BACD BACD-F AAAAACAGTATTGGTYATCGCTGA 52 749
BACD-R CCATGATGCCTTCKATRCTGAT
BACAB BACAB-F CTTCTCCAAGGGGTGAACAG 61 815
BACAB-R TGTAGGTTTCACCGGCTTTC
BAC BAC-F CAGCTCATGGGAATGCTTTT 60 498
BAC-R CTCGGTCCTGAAGGGACAAG
Flagellin hag hag-F ATGAGAATCAACCACAATATCGC 54 1210
hag-R TTAACCTTTAAGCAATTGAAGAA
Antimicrobial component tasA tasA-F ATGGGTATGAAAAAGAAATTAAG 52 786
tasA-R TTAGTTTTTATCCTCACTGTGA