. 2020 Feb 14;11:67. doi: 10.3389/fphar.2020.00067

Table 2.

Drug structure-based model performance.

DILI subtype	Feature	Support vector machine																Random forest																Applicability domain analysis
		Five fold cross validation					0.632 estimator (100 sampling)					External test set (Y-rand.)						Five fold cross validation					0.632 estimator (100 sampling)					External test set (Y-rand.)
		SE	SP	ACC	MCC	AUC	SE	SP	ACC	MCC	AUC	SE	SP	ACC	MCC	AUC	Z	SE	SP	ACC	MCC	AUC	SE	SP	ACC	MCC	AUC	SE	SP	ACC	MCC	AUC	Z	OD/total	ratio
Cholestasis	2D descriptor	0.79 ± 0.07	0.69 ± 0.12	0.74 ± 0.08	0.48 ± 0.15	0.48 ± 0.15	0.82 ± 0.09	0.74 ± 0.08	0.78 ± 0.05	0.55 ± 0.09	0.55 ± 0.09	0.75	0.68	0.69	0.33	0.75	3.64	0.66 ± 0.19	0.8 ± 0.17	0.69 ± 0.08	0.46 ± 0.15	0.46 ± 0.15	0.71 ± 0.07	0.85 ± 0.08	0.78 ± 0.05	0.57 ± 0.1	0.57 ± 0.1	0.75	0.76	0.76	0.41	0.85	2.98	1/70	0.014
	Atompair FP	0.97 ± 0.08	0.94 ± 0.06	0.95 ± 0.06	0.89 ± 0.12	0.89 ± 0.12	0.93 ± 0.04	0.98 ± 0.04	0.95 ± 0.03	0.91 ± 0.05	0.91 ± 0.05	0.92	0.99	0.98	0.90	0.96	10.32	0.94 ± 0.08	0.96 ± 0.05	0.95 ± 0.05	0.89 ± 0.1	0.89 ± 0.1	0.95 ± 0.03	0.99 ± 0.02	0.97 ± 0.02	0.93 ± 0.03	0.93 ± 0.03	0.92	0.98	0.97	0.9	0.95	13.06	3/70	0.043
	Avalon count FP	0.8 ± 0.08	0.73 ± 0.11	0.78 ± 0.08	0.53 ± 0.15	0.53 ± 0.15	0.8 ± 0.07	0.78 ± 0.08	0.79 ± 0.04	0.57 ± 0.08	0.57 ± 0.08	0.67	0.78	0.76	0.37	0.79	2.91	0.69 ± 0.14	0.71 ± 0.14	0.67 ± 0.07	0.39 ± 0.14	0.39 ± 0.14	0.73 ± 0.08	0.85 ± 0.07	0.79 ± 0.04	0.58 ± 0.08	0.58 ± 0.08	0.75	0.74	0.74	0.39	0.75	4.76	2/70	0.029
	Avalon FP	0.75 ± 0.12	0.79 ± 0.17	0.77 ± 0.11	0.53 ± 0.22	0.53 ± 0.22	0.78 ± 0.06	0.8 ± 0.08	0.79 ± 0.04	0.58 ± 0.08	0.58 ± 0.08	0.67	0.71	0.70	0.30	0.74	3.45	0.65 ± 0.19	0.74 ± 0.15	0.68 ± 0.09	0.4 ± 0.2	0.4 ± 0.2	0.7 ± 0.08	0.8 ± 0.07	0.75 ± 0.04	0.51 ± 0.08	0.51 ± 0.08	0.58	0.74	0.71	0.26	0.73	3.82	0/70	0.000
	Morgan (lv2) FP	0.72 ± 0.17	0.79 ± 0.15	0.75 ± 0.13	0.5 ± 0.27	0.5 ± 0.27	0.68 ± 0.09	0.79 ± 0.1	0.73 ± 0.04	0.47 ± 0.08	0.47 ± 0.08	0.67	0.81	0.79	0.41	0.86	3.87	0.69 ± 0.18	0.74 ± 0.19	0.7 ± 0.14	0.43 ± 0.26	0.43 ± 0.26	0.75 ± 0.1	0.74 ± 0.08	0.74 ± 0.05	0.49 ± 0.09	0.49 ± 0.09	0.75	0.76	0.76	0.41	0.7	4.49	0/70	0.000
	Morgan (lv3) FP	0.74 ± 0.18	0.6 ± 0.21	0.64 ± 0.06	0.36 ± 0.16	0.36 ± 0.16	0.68 ± 0.15	0.71 ± 0.18	0.69 ± 0.05	0.4 ± 0.1	0.4 ± 0.1	0.59	0.78	0.75	0.30	0.81	1.58	0.65 ± 0.15	0.61 ± 0.08	0.63 ± 0.07	0.27 ± 0.16	0.27 ± 0.16	0.63 ± 0.15	0.72 ± 0.14	0.68 ± 0.04	0.37 ± 0.09	0.37 ± 0.09	0.67	0.78	0.76	0.36	0.78	4.11	2/70	0.029
	Morgan (lv4) FP	0.77 ± 0.17	0.72 ± 0.16	0.74 ± 0.15	0.48 ± 0.31	0.48 ± 0.31	0.77 ± 0.07	0.73 ± 0.08	0.75 ± 0.05	0.5 ± 0.09	0.5 ± 0.09	0.75	0.73	0.73	0.38	0.75	3.31	0.83 ± 0.1	0.73 ± 0.15	0.78 ± 0.11	0.56 ± 0.21	0.56 ± 0.21	0.81 ± 0.08	0.74 ± 0.07	0.77 ± 0.05	0.55 ± 0.1	0.55 ± 0.1	0.75	0.74	0.74	0.39	0.76	2.9	3/70	0.043
	Layer FP	0.64 ± 0.2	0.72 ± 0.12	0.67 ± 0.12	0.35 ± 0.21	0.35 ± 0.21	0.71 ± 0.1	0.76 ± 0.12	0.73 ± 0.05	0.48 ± 0.1	0.48 ± 0.1	0.75	0.68	0.69	0.33	0.77	2.12	0.78 ± 0.12	0.77 ± 0.15	0.77 ± 0.05	0.55 ± 0.1	0.55 ± 0.1	0.72 ± 0.1	0.76 ± 0.09	0.74 ± 0.04	0.48 ± 0.08	0.48 ± 0.08	0.67	0.72	0.71	0.31	0.74	3.55	0/70	0.000
	MACCS FP	0.79 ± 0.17	0.69 ± 0.17	0.72 ± 0.11	0.46 ± 0.21	0.46 ± 0.21	0.73 ± 0.1	0.78 ± 0.12	0.76 ± 0.04	0.52 ± 0.08	0.52 ± 0.08	0.67	0.78	0.76	0.37	0.83	2.61	*0.77 ± 0.11*	*0.65 ± 0.1*	*0.71 ± 0.06*	*0.42 ± 0.14*	*0.42 ± 0.14*	*0.75 ± 0.1*	*0.75 ± 0.07*	*0.75 ± 0.04*	*0.5 ± 0.09*	*0.5 ± 0.09*	*0.8*	*0.7*	*0.7*	*0.3*	*0.8*	*3.14*	*0/70*	*####*
	Torsion FP	0.84 ± 0.12	0.94 ± 0.06	0.9 ± 0.05	0.78 ± 0.11	0.78 ± 0.11	0.85 ± 0.06	0.95 ± 0.03	0.9 ± 0.03	0.8 ± 0.05	0.8 ± 0.05	0.92	0.97	0.96	0.86	0.94	6.75	0.81 ± 0.16	0.94 ± 0.05	0.88 ± 0.08	0.76 ± 0.16	0.76 ± 0.16	0.81 ± 0.07	0.96 ± 0.04	0.88 ± 0.04	0.78 ± 0.07	0.78 ± 0.07	0.92	0.93	0.93	0.78	0.95	6.89	4/70	0.057
Cirrhosis	2D descriptor	0.78 ± 0.14	0.71 ± 0.2	0.72 ± 0.12	0.46 ± 0.22	0.46 ± 0.22	0.72 ± 0.12	0.79 ± 0.07	0.76 ± 0.04	0.51 ± 0.08	0.51 ± 0.08	0.80	0.75	0.75	0.41	0.84	3.07	0.73 ± 0.06	0.82 ± 0.12	0.79 ± 0.08	0.57 ± 0.15	0.57 ± 0.15	0.79 ± 0.09	0.87 ± 0.06	0.83 ± 0.05	0.67 ± 0.09	0.67 ± 0.09	0.6	0.79	0.77	0.32	0.82	3.06	5/73	0.068
	Atompair FP	0.93 ± 0.1	0.99 ± 0.04	0.96 ± 0.05	0.92 ± 0.08	0.92 ± 0.08	0.96 ± 0.04	0.99 ± 0.03	0.98 ± 0.03	0.95 ± 0.05	0.95 ± 0.05	0.90	0.95	0.95	0.79	0.98	8.39	0.87 ± 0.09	0.98 ± 0.04	0.93 ± 0.02	0.86 ± 0.04	0.86 ± 0.04	0.94 ± 0.05	0.98 ± 0.03	0.96 ± 0.02	0.92 ± 0.05	0.92 ± 0.05	0.9	0.93	0.93	0.75	0.99	7.74	3/73	0.041
	Avalon count FP	0.72 ± 0.12	0.9 ± 0.09	0.82 ± 0.1	0.63 ± 0.19	0.63 ± 0.19	0.83 ± 0.09	0.86 ± 0.08	0.85 ± 0.04	0.7 ± 0.07	0.7 ± 0.07	0.60	0.78	0.75	0.30	0.71	3.20	0.84 ± 0.11	0.8 ± 0.18	0.81 ± 0.13	0.62 ± 0.25	0.62 ± 0.25	0.79 ± 0.09	0.89 ± 0.06	0.85 ± 0.05	0.69 ± 0.09	0.69 ± 0.09	0.7	0.88	0.85	0.51	0.81	5.19	1/73	0.014
	Avalon FP	0.71 ± 0.19	0.89 ± 0.14	0.8 ± 0.11	0.62 ± 0.21	0.62 ± 0.21	0.8 ± 0.09	0.85 ± 0.06	0.82 ± 0.04	0.65 ± 0.07	0.65 ± 0.07	0.70	0.90	0.87	0.54	0.86	4.83	0.67 ± 0.15	0.81 ± 0.08	0.74 ± 0.1	0.48 ± 0.18	0.48 ± 0.18	0.74 ± 0.09	0.87 ± 0.07	0.81 ± 0.04	0.63 ± 0.08	0.63 ± 0.08	0.7	0.83	0.81	0.43	0.87	5.81	0/73	0.000
	Morgan (lv2) FP	0.72 ± 0.17	0.84 ± 0.15	0.78 ± 0.1	0.57 ± 0.22	0.57 ± 0.22	0.76 ± 0.08	0.89 ± 0.07	0.83 ± 0.04	0.66 ± 0.07	0.66 ± 0.07	0.70	0.73	0.73	0.32	0.78	2.39	0.74 ± 0.19	0.87 ± 0.1	0.82 ± 0.04	0.64 ± 0.07	0.64 ± 0.07	0.74 ± 0.08	0.89 ± 0.08	0.82 ± 0.04	0.65 ± 0.07	0.65 ± 0.07	0.9	0.91	0.91	0.71	0.91	7.21	3/73	0.041
	Morgan (lv3) FP	0.75 ± 0.19	0.82 ± 0.07	0.78 ± 0.1	0.55 ± 0.23	0.55 ± 0.23	0.69 ± 0.09	0.84 ± 0.07	0.78 ± 0.04	0.54 ± 0.08	0.54 ± 0.08	0.80	0.85	0.84	0.53	0.89	3.99	0.72 ± 0.15	0.87 ± 0.08	0.8 ± 0.1	0.6 ± 0.19	0.6 ± 0.19	0.67 ± 0.1	0.85 ± 0.09	0.77 ± 0.03	0.53 ± 0.07	0.53 ± 0.07	0.7	0.9	0.87	0.54	0.86	5.61	3/73	0.041
	Morgan (lv4) FP	0.76 ± 0.07	0.82 ± 0.14	0.79 ± 0.06	0.58 ± 0.11	0.58 ± 0.11	0.81 ± 0.09	0.87 ± 0.05	0.85 ± 0.04	0.69 ± 0.08	0.69 ± 0.08	0.80	0.80	0.80	0.47	0.82	4.70	0.72 ± 0.14	0.84 ± 0.12	0.79 ± 0.07	0.55 ± 0.12	0.55 ± 0.12	0.74 ± 0.08	0.89 ± 0.07	0.83 ± 0.03	0.65 ± 0.06	0.65 ± 0.06	0.8	0.91	0.9	0.64	0.88	7.06	0/73	0.000
	Layer FP	0.84 ± 0.1	0.89 ± 0.12	0.86 ± 0.1	0.72 ± 0.2	0.72 ± 0.2	0.93 ± 0.06	0.88 ± 0.07	0.9 ± 0.04	0.81 ± 0.08	0.81 ± 0.08	0.70	0.88	0.86	0.51	0.91	3.90	*0.68 ± 0.1*	*0.74 ± 0.09*	*0.7 ± 0.07*	*0.41 ± 0.11*	*0.41 ± 0.11*	*0.82 ± 0.08*	*0.92 ± 0.06*	*0.87 ± 0.04*	*0.75 ± 0.08*	*0.75 ± 0.08*	*0.8*	*0.9*	*0.9*	*0.6*	*0.9*	*4.23*	*0/73*	*####*
	MACCS FP	0.78 ± 0.22	0.88 ± 0.14	0.84 ± 0.14	0.64 ± 0.31	0.64 ± 0.31	0.79 ± 0.1	0.84 ± 0.08	0.82 ± 0.05	0.63 ± 0.09	0.63 ± 0.09	0.70	0.88	0.86	0.51	0.85	4.28	0.66 ± 0.17	0.8 ± 0.25	0.73 ± 0.2	0.47 ± 0.38	0.47 ± 0.38	0.79 ± 0.08	0.87 ± 0.09	0.83 ± 0.04	0.67 ± 0.09	0.67 ± 0.09	0.7	0.85	0.82	0.46	0.83	4.83	0/73	0.000
	Torsion FP	0.85 ± 0.15	0.98 ± 0.06	0.93 ± 0.05	0.86 ± 0.1	0.86 ± 0.1	0.88 ± 0.05	0.99 ± 0.02	0.94 ± 0.03	0.88 ± 0.05	0.88 ± 0.05	0.90	0.97	0.96	0.84	1.00	5.26	0.83 ± 0.05	0.97 ± 0.07	0.92 ± 0.03	0.83 ± 0.06	0.83 ± 0.06	0.86 ± 0.07	0.96 ± 0.03	0.91 ± 0.03	0.83 ± 0.06	0.83 ± 0.06	0.9	0.98	0.97	0.88	0.9	7.81	4/73	0.055
Hepatitis	2D descriptor	*0.8 ± 0.11*	*0.7 ± 0.16*	*0.75 ± 0.05*	*0.52 ± 0.1*	*0.52 ± 0.1*	*0.74 ± 0.07*	*0.75 ± 0.05*	*0.75 ± 0.03*	*0.49 ± 0.06*	*0.49 ± 0.06*	*###*	*###*	*0.83*	*0.61*	*0.85*	*5.06*	0.62 ± 0.08	0.71 ± 0.09	0.67 ± 0.06	0.33 ± 0.12	0.33 ± 0.12	0.76 ± 0.06	0.84 ± 0.05	0.8 ± 0.03	0.61 ± 0.07	0.61 ± 0.07	0.67	0.76	0.69	0.37	0.77	9.17	*0/77*	*####*
	Atompair FP	0.99 ± 0.04	0.98 ± 0.04	0.99 ± 0.03	0.97 ± 0.06	0.97 ± 0.06	1 ± 0.02	0.98 ± 0.02	0.99 ± 0.02	0.98 ± 0.03	0.98 ± 0.03	0.99	0.96	0.98	0.94	1.00	10.85	0.99 ± 0.02	0.99 ± 0.03	0.99 ± 0.02	0.98 ± 0.03	0.98 ± 0.03	0.98 ± 0.02	0.99 ± 0.01	0.99 ± 0.01	0.97 ± 0.02	0.97 ± 0.02	0.95	0.95	0.95	0.88	0.98	8.95	7/77	0.091
	Avalon count FP	0.67 ± 0.11	0.85 ± 0.04	0.76 ± 0.07	0.52 ± 0.12	0.52 ± 0.12	0.74 ± 0.07	0.83 ± 0.06	0.79 ± 0.04	0.57 ± 0.08	0.57 ± 0.08	0.66	0.67	0.66	0.28	0.77	4.06	0.6 ± 0.04	0.73 ± 0.15	0.67 ± 0.07	0.34 ± 0.16	0.34 ± 0.16	0.76 ± 0.06	0.82 ± 0.06	0.79 ± 0.04	0.58 ± 0.07	0.58 ± 0.07	0.71	0.62	0.69	0.3	0.68	3.58	5/77	0.065
	Avalon FP	0.71 ± 0.11	0.83 ± 0.12	0.77 ± 0.12	0.53 ± 0.21	0.53 ± 0.21	0.79 ± 0.07	0.8 ± 0.07	0.79 ± 0.03	0.58 ± 0.05	0.58 ± 0.05	0.80	0.81	0.80	0.55	0.81	5.24	0.64 ± 0.13	0.8 ± 0.07	0.73 ± 0.05	0.45 ± 0.11	0.45 ± 0.11	0.75 ± 0.06	0.82 ± 0.06	0.79 ± 0.03	0.58 ± 0.07	0.58 ± 0.07	0.62	0.76	0.66	0.33	0.72	6.21	0/77	0.000
	Morgan (lv2) FP	0.61 ± 0.15	0.8 ± 0.09	0.71 ± 0.11	0.41 ± 0.22	0.41 ± 0.22	0.73 ± 0.09	0.77 ± 0.06	0.75 ± 0.04	0.5 ± 0.07	0.5 ± 0.07	0.70	0.77	0.72	0.41	0.77	4.91	0.71 ± 0.12	0.81 ± 0.09	0.76 ± 0.09	0.51 ± 0.19	0.51 ± 0.19	0.71 ± 0.06	0.81 ± 0.06	0.76 ± 0.03	0.53 ± 0.06	0.53 ± 0.06	0.67	0.81	0.7	0.41	0.82	6.12	8/77	0.104
	Morgan (lv3) FP	0.66 ± 0.14	0.71 ± 0.07	0.69 ± 0.08	0.37 ± 0.15	0.37 ± 0.15	0.74 ± 0.07	0.74 ± 0.09	0.74 ± 0.04	0.48 ± 0.07	0.48 ± 0.07	0.72	0.81	0.74	0.46	0.81	5.03	0.69 ± 0.13	0.76 ± 0.05	0.73 ± 0.08	0.46 ± 0.17	0.46 ± 0.17	0.72 ± 0.07	0.75 ± 0.06	0.73 ± 0.03	0.47 ± 0.07	0.47 ± 0.07	0.76	0.81	0.77	0.51	0.79	4.69	6/77	0.078
	Morgan (lv4) FP	0.7 ± 0.24	0.85 ± 0.07	0.75 ± 0.13	0.54 ± 0.21	0.54 ± 0.21	0.69 ± 0.1	0.78 ± 0.09	0.73 ± 0.04	0.47 ± 0.07	0.47 ± 0.07	0.73	0.72	0.73	0.40	0.73	4.51	0.68 ± 0.13	0.81 ± 0.05	0.75 ± 0.08	0.5 ± 0.15	0.5 ± 0.15	0.76 ± 0.06	0.8 ± 0.06	0.78 ± 0.03	0.55 ± 0.06	0.55 ± 0.06	0.84	0.67	0.8	0.49	0.8	6.33	2/77	0.026
	Layer FP	0.72 ± 0.1	0.86 ± 0.08	0.79 ± 0.06	0.58 ± 0.1	0.58 ± 0.1	0.72 ± 0.06	0.84 ± 0.08	0.78 ± 0.04	0.56 ± 0.06	0.56 ± 0.06	0.73	0.86	0.77	0.52	0.83	3.63	0.69 ± 0.09	0.86 ± 0.06	0.78 ± 0.04	0.56 ± 0.07	0.56 ± 0.07	0.7 ± 0.06	0.86 ± 0.07	0.78 ± 0.03	0.58 ± 0.06	0.58 ± 0.06	0.68	0.67	0.68	0.31	0.67	2.97	0/77	0.000
	MACCS FP	0.67 ± 0.14	0.82 ± 0.06	0.74 ± 0.05	0.49 ± 0.08	0.49 ± 0.08	0.69 ± 0.08	0.8 ± 0.07	0.75 ± 0.04	0.49 ± 0.06	0.49 ± 0.06	0.66	0.77	0.68	0.36	0.77	2.71	0.66 ± 0.16	0.78 ± 0.13	0.73 ± 0.06	0.47 ± 0.08	0.47 ± 0.08	0.71 ± 0.06	0.84 ± 0.06	0.78 ± 0.03	0.56 ± 0.07	0.56 ± 0.07	0.68	0.71	0.69	0.35	0.78	4.13	0/77	0.000
	Torsion FP	0.85 ± 0.07	0.97 ± 0.03	0.91 ± 0.03	0.82 ± 0.05	0.82 ± 0.05	0.89 ± 0.03	0.98 ± 0.02	0.94 ± 0.02	0.87 ± 0.03	0.87 ± 0.03	0.85	0.96	0.87	0.72	0.94	6.21	0.85 ± 0.11	0.98 ± 0.04	0.91 ± 0.06	0.84 ± 0.11	0.84 ± 0.11	0.89 ± 0.03	0.97 ± 0.02	0.93 ± 0.02	0.86 ± 0.04	0.86 ± 0.04	0.86	0.95	0.88	0.74	0.96	6.82	6/77	0.078
Steatosis	2D descriptor	0.71 ± 0.14	0.72 ± 0.22	0.71 ± 0.1	0.43 ± 0.21	0.43 ± 0.21	0.74 ± 0.07	0.8 ± 0.06	0.77 ± 0.04	0.55 ± 0.08	0.55 ± 0.08	0.59	0.78	0.74	0.31	0.72	2.40	0.64 ± 0.16	0.74 ± 0.1	0.7 ± 0.08	0.38 ± 0.17	0.38 ± 0.17	0.65 ± 0.09	0.83 ± 0.06	0.76 ± 0.04	0.49 ± 0.08	0.49 ± 0.08	0.75	0.66	0.68	0.32	0.7	3.01	1/65	0.015
	Atompair FP	0.99 ± 0.04	0.95 ± 0.08	0.96 ± 0.04	0.93 ± 0.07	0.93 ± 0.07	0.93 ± 0.04	0.95 ± 0.04	0.94 ± 0.03	0.88 ± 0.05	0.88 ± 0.05	0.84	0.95	0.93	0.76	0.94	6.86	0.96 ± 0.07	0.97 ± 0.04	0.96 ± 0.04	0.92 ± 0.07	0.92 ± 0.07	0.9 ± 0.04	0.99 ± 0.02	0.95 ± 0.02	0.91 ± 0.04	0.91 ± 0.04	0.92	0.98	0.97	0.9	0.98	8.64	4/65	0.062
	Avalon count FP	0.63 ± 0.13	0.77 ± 0.08	0.69 ± 0.08	0.38 ± 0.15	0.38 ± 0.15	0.69 ± 0.08	0.79 ± 0.08	0.74 ± 0.04	0.48 ± 0.08	0.48 ± 0.08	0.67	0.72	0.71	0.32	0.73	2.66	0.65 ± 0.23	0.73 ± 0.12	0.68 ± 0.12	0.39 ± 0.16	0.39 ± 0.16	0.72 ± 0.08	0.82 ± 0.07	0.77 ± 0.05	0.54 ± 0.09	0.54 ± 0.09	0.67	0.7	0.69	0.29	0.68	2.3	3/65	0.046
	Avalon FP	0.66 ± 0.22	0.8 ± 0.1	0.73 ± 0.08	0.45 ± 0.19	0.45 ± 0.19	0.69 ± 0.09	0.76 ± 0.09	0.73 ± 0.05	0.45 ± 0.09	0.45 ± 0.09	0.75	0.85	0.84	0.53	0.72	3.51	0.68 ± 0.16	0.72 ± 0.17	0.71 ± 0.1	0.41 ± 0.22	0.41 ± 0.22	0.69 ± 0.09	0.83 ± 0.09	0.76 ± 0.05	0.54 ± 0.1	0.54 ± 0.1	0.83	0.74	0.75	0.46	0.81	5.24	0/65	0.000
	Morgan (lv2) FP	0.69 ± 0.1	0.67 ± 0.26	0.67 ± 0.11	0.37 ± 0.21	0.37 ± 0.21	0.65 ± 0.07	0.82 ± 0.08	0.74 ± 0.04	0.48 ± 0.07	0.48 ± 0.07	0.84	0.76	0.77	0.48	0.82	6.00	0.63 ± 0.17	0.71 ± 0.15	0.69 ± 0.09	0.36 ± 0.15	0.36 ± 0.15	0.72 ± 0.07	0.7 ± 0.08	0.71 ± 0.04	0.42 ± 0.08	0.42 ± 0.08	0.67	0.79	0.77	0.39	0.69	2.39	1/65	0.015
	Morgan (lv3) FP	0.78 ± 0.17	0.81 ± 0.16	0.77 ± 0.13	0.57 ± 0.24	0.57 ± 0.24	0.73 ± 0.12	0.79 ± 0.1	0.76 ± 0.06	0.53 ± 0.1	0.53 ± 0.1	0.75	0.78	0.77	0.44	0.76	5.25	0.81 ± 0.06	0.68 ± 0.1	0.75 ± 0.06	0.49 ± 0.13	0.49 ± 0.13	0.78 ± 0.08	0.75 ± 0.07	0.76 ± 0.04	0.53 ± 0.08	0.53 ± 0.08	0.75	0.74	0.74	0.39	0.78	4.59	0/65	0.000
	Morgan (lv4) FP	0.7 ± 0.22	0.87 ± 0.06	0.77 ± 0.1	0.57 ± 0.17	0.57 ± 0.17	0.66 ± 0.11	0.86 ± 0.08	0.76 ± 0.05	0.53 ± 0.09	0.53 ± 0.09	0.92	0.80	0.82	0.59	0.87	5.28	0.75 ± 0.18	0.66 ± 0.12	0.71 ± 0.07	0.42 ± 0.17	0.42 ± 0.17	0.81 ± 0.08	0.8 ± 0.08	0.8 ± 0.04	0.61 ± 0.08	0.61 ± 0.08	0.67	0.79	0.77	0.39	0.78	6.92	3/65	0.046
	Layer FP	*0.77 ± 0.15*	*0.85 ± 0.06*	*0.8 ± 0.09*	*0.62 ± 0.16*	*0.62 ± 0.16*	*0.75 ± 0.08*	*0.83 ± 0.06*	*0.79 ± 0.04*	*0.58 ± 0.08*	*0.58 ± 0.08*	*###*	*###*	*0.85*	*0.60*	*0.92*	*5.10*	0.74 ± 0.15	0.8 ± 0.1	0.77 ± 0.09	0.55 ± 0.18	0.55 ± 0.18	0.77 ± 0.06	0.85 ± 0.06	0.81 ± 0.04	0.63 ± 0.07	0.63 ± 0.07	0.67	0.79	0.77	0.39	0.73	3.27	*0/65*	*####*
	MACCS FP	0.75 ± 0.18	0.72 ± 0.13	0.72 ± 0.13	0.46 ± 0.26	0.46 ± 0.26	0.76 ± 0.09	0.76 ± 0.09	0.76 ± 0.04	0.52 ± 0.08	0.52 ± 0.08	0.75	0.78	0.77	0.44	0.80	3.89	0.65 ± 0.12	0.78 ± 0.11	0.72 ± 0.08	0.44 ± 0.16	0.44 ± 0.16	0.7 ± 0.09	0.79 ± 0.07	0.75 ± 0.04	0.5 ± 0.08	0.5 ± 0.08	0.83	0.68	0.71	0.4	0.81	2.95	0/65	0.000
	Torsion FP	0.84 ± 0.1	0.99 ± 0.04	0.91 ± 0.06	0.83 ± 0.11	0.83 ± 0.11	0.82 ± 0.06	0.98 ± 0.03	0.9 ± 0.03	0.8 ± 0.06	0.8 ± 0.06	0.84	0.99	0.96	0.85	0.96	7.38	0.83 ± 0.09	0.97 ± 0.04	0.9 ± 0.05	0.8 ± 0.09	0.8 ± 0.09	0.84 ± 0.06	0.99 ± 0.02	0.92 ± 0.03	0.84 ± 0.05	0.84 ± 0.05	0.92	0.98	0.97	0.9	0.95	8.8	3/65	0.046

*SE, sensitivity; SP, specificity; ACC, accuracy; MCC, Matthew's correlation coefficient; AUC, area under the ROC curve; OD, out-of-domain. Bolded and italic texts highlighted best performance among models.