Table 7.
Results of Bond Type, Atom in Function Groups, Amino Acid Residues Binding, Distance of Bonds Between SUR1 Receptors and Ligands Using Software Discovery Studio Visualizer
| Ligands | Bond Type | Atomic in Functional Groups Binding | Amino Acid Residues Binding | The distance of Bond (Å) | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Glibenclamide | Hydrophobic Interaction | Atomic C in Benzen (D) | Ile651 (A) | 4.65 |
| Atom C in Benzene (D) | Ile616 (A) | 3.94 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Met648 (A) | 4.75 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Val548 (A) | 4.36 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Ile658 (A) | 4.94 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Ile659 (A) | 4.81 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Ile628 (A) | 5.19 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Val547 (A) | 4.81 | |||
| Atom C in Benzene (D) | Lys513 (A) | 5.00 | |||
| Cl1 (D) | Val547 (A) | 3.98 | |||
| Cl1 (A) | Phe518 (D) | 3.73 | |||
| Interactions Hydrogen | Atom H20 (D) -OCH3 | Asp630 (A) | 2.8 | ||
| Atom H28 (D) -CONH- | Ser509 (A) | 1.22 | |||
| 2 | β-carotene 5,6α-epoxide | Hydrophobic interactions | Atom C7 (D) | Val547 (A) | 4.15 |
| Atom C9 (A) | Ala566 (D) | 3.86 | |||
| Atom C13 (A) | Ala619 (D) | 3.49 | |||
| Atom C13 (D) | Val547 (A) | 2.86 | |||
| Atom C23 (D) | Val667 (A) | 2.57 | |||
| Atom C23 (D) | Ile659 (A) | 5.16 | |||
| Atom C24 (A) | Ala661 (D) | 4.11 | |||
| Atom C27 (A) | Ala670 (D) | 2.65 | |||
| Atom C27 (D) | Ile673 (A) | 4.26 | |||
| Atom C27 (D) | Val667 (A) | 2.81 | |||
| Atom C33 (D) | Ile660 (A) | 3.93 | |||
| A tom C33 (D) | Ile500 (A) | 4.06 | |||
| Atom C33 (D) | Ile659 (A) | 4.47 | |||
| Atom C40 (D) | Ile660 (A) | 4.59 | |||
| Atom C in Benzene (A) | Ala661 (D) | 4.13 | |||
| Atom C in Benzene (A) | Ile673 (D) | 4.54 | |||
| Atom C in Benzene (A) | Ala670 (D) | 4.68 |
* Description: (A) is a compound that acts as an acceptor and (D) is a compound that acts as a donor.