Table 4.1.
Estimates of Evolutionary Divergence between the 18S rRNA sequence isolated in this study and other Sarcocystis spp. sequences deposited in GenBank. The number of base substitutions per site between sequences are shown. Analyses were conducted using the Tamura-Nei model (Tamura and Nei, 1993); evolutionary analyses were conducted in MEGA7 (Kumar et al., 2016). The bold sequence indicates our isolate.
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | KT901144.1_S._bovini_isolate_B4.15 | |||||||||||||||||
| 2 | KT901150.1_S. _bovini_isolate_B7.2 | 0,000 | ||||||||||||||||
| 3 | KT901136.1_S. _bovifelis_isolate_B4.8 | 0,008 | 0,008 | |||||||||||||||
| 4 | KC209743.1_S. _bovifelis_isolate_B3.1 | 0,008 | 0,008 | 0,000 | ||||||||||||||
| 5 | KT901123.1_S. _bovifelis_isolate_B1.13 | 0,008 | 0,008 | 0,000 | 0,000 | |||||||||||||
| 6 | KT901165.1_S. _hirsuta_isolate_B10.5 | 0,063 | 0,063 | 0,070 | 0,070 | 0,070 | ||||||||||||
| 7 | KT901163.1_S._hirsuta_isolate_B9.1 | 0,063 | 0,063 | 0,070 | 0,070 | 0,070 | 0,000 | |||||||||||
| 8 | KT901166.1_S. _hirsuta_isolate_B12.1 | 0,071 | 0,071 | 0,079 | 0,079 | 0,079 | 0,007 | 0,007 | ||||||||||
| 9 | KX057996.1_S. _heydorni_isolate_1 | 0,038 | 0,038 | 0,030 | 0,030 | 0,030 | 0,085 | 0,085 | 0,093 | |||||||||
| 10 | KX057997.1_S. _heydorni_isolate_2 | 0,038 | 0,038 | 0,030 | 0,030 | 0,030 | 0,085 | 0,085 | 0,093 | 0,000 | ||||||||
| 11 | KT901169.1_S. _cruzi_isolate_B2.1 | 0,039 | 0,039 | 0,031 | 0,031 | 0,031 | 0,079 | 0,079 | 0,088 | 0,000 | 0,000 | |||||||
| 12 | KT901173.1_S._cruzi_isolate_B11.1 | 0,039 | 0,039 | 0,031 | 0,031 | 0,031 | 0,079 | 0,079 | 0,088 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | ||||||
| 13 | KT901167.1_S._cruzi_isolate_B1.6 | 0,039 | 0,039 | 0,031 | 0,031 | 0,031 | 0,079 | 0,079 | 0,088 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | |||||
| 14 | AF176944.1_S._hominis_strain_2730ho | 0,000 | 0,000 | 0,008 | 0,008 | 0,008 | 0,063 | 0,063 | 0,071 | 0,038 | 0,038 | 0,039 | 0,039 | 0,039 | ||||
| 15 | JX679470.1_S._hominis_clone_1B_HRF93A | 0,000 | 0,000 | 0,008 | 0,008 | 0,008 | 0,063 | 0,063 | 0,071 | 0,038 | 0,038 | 0,039 | 0,039 | 0,039 | 0,000 | |||
| 16 | AF176945.1_S._hominis_strain_28h7ho | 0,000 | 0,000 | 0,008 | 0,008 | 0,008 | 0,063 | 0,063 | 0,071 | 0,038 | 0,038 | 0,039 | 0,039 | 0,039 | 0,000 | 0,000 | ||
| 17 | Sarcocystis_hominis_human_stool_sample | 0,000 | 0,000 | 0,008 | 0,008 | 0,008 | 0,063 | 0,063 | 0,071 | 0,038 | 0,038 | 0,039 | 0,039 | 0,039 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | |