Table 1.

Comparison of putative TRSs based on genomic sequence data in TCoV and GfCoV/Fr/2011

Accession numbers of viruses studied are shown in Table S1.

Virus	ORF 1a/b	S	3a/b	E	M	4b/c	5a/b	N	6b
Fr-TCoV	CUUAACAA	CUGAACAA	CUGAACAA	UUCAACAA	CUUAACAA	GUGACCAA	CUUAACAA	CUUAACAA	AGGAACAA
TCoV-MG10	––––––––	––––––––	UAU–––––	––––G–––	––––––––	––––––––	–G––––––	––––––––	––––––––
TCoV-VA-74	––––––––	––––––––	UAU–––––	––––G–––	––––––––	––––––––	––––––––	––A–––––	––––––––
TCoV-TX-98	––––––––	––––––––	UAU–––––	––––G–––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––
TCoV-TX-GL	––––––––	––––––––	UAU–––––	––––A–––	––––––––	––––––––	–––––A––	––––––––	––––––––
TCoV-IN	––––––––	––––––––	UAU–––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––
TCoV-540	––––––––	––––––––	A–––––––	––––––––	––––––––	–U––U–––	––––––––	––––––––	––––––––
TCoV-ATCC	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––––––
Gf-TCoV		––––––––	––––––––	––––––––	y–––––––	––––––––	––––––––	––––––––	––––C–––