Table 3.

Amino acid mutations in partial S proteins of 14 PEDV isolates

Isolate	Amino acid position and change
	11	14	20	28	32	74	77	85	147	159	230	274	285
CH/YF-01		S → A		A → V	H → R	K → N					S → N	P → L
CH/XY-02						K → N
CH/QX-02		S → A		A → V	H → R	K → N					S → N	P → L
CH/KF-01		S → A		A → V	H → R	K → N					S → N	P → L
CH/XIP-01						K → N				K → E
CHLY-09				A → S	H → R		D → Y		T → K
CH/FCH-01				A → S					T → K
CH/LH	T → I			A → S					T → K
CH/FH			F → S			K → N
CH/LSHAN	T → A	S → A		A → V		K → N							T → M
CH/XIP-03				A → S			D → Y	–		K → E
CH/JCH									T → K
CH/ZHZ-04				A → S			D → Y		T → K
CH/HEB				A → S			D → Y		T → K

“–” represents one deletion at position aa 85 in the epitope region of the partial S protein of CH/XIP-03