Table 4.
Linear and discontinuous B cell epitopes of the designed vaccine constructs
| Construct | Epitope | Score* |
|---|---|---|
| Linear B cell epitopes | ||
| E5 | VFIYIPLFVIHTHASF | 0.718 |
| E7 | FAAYSSAD | 0.720 |
| GQAEPDRAHY | 0.716 | |
| EPDTSNYNIVT | 0.638 | |
| LHLEPQNELDP | 0.577 | |
| Construct | Epitope | Score |
|---|---|---|
| Discontinuous B Cell epitopes | ||
| E5 | A:S1, A:A2, A:F3 | 0.789 |
| A:A27, A:A28, A:V73, A:F76, A:A77, A:L79, A:L80, A:V81, A:F82 | 0.774 | |
| A:V13, A:Y47, A:V50, A:F51, A:I52, A:I54, A:P55, A:L56, A:F57, A:V58, A:I59, A:H60, A:T61, A:H62, A:A63 | 0.706 | |
| A:S30, A:P31, A:A32, A:T33 | 0.646 | |
| E7 | A:F15, A:A16, A:A17, A:Y18, A:S19, A:S20, A:A21, A:D22 | 0.720 |
| A:G1, A:Q2, A:A3, A:E4, A:P5, A:D6, A:R7, A:A8, A:H9, A:Y10 | 0.716 | |
| A:Y53, A:E57, A:L60, A:H61 | 0.703 | |
| A:E63, A:P64, A:Q65, A:E67, A:L68, A:D69, A:P70 | 0.608 | |
| A:Q37, A:A38, A:E39, A:P40, A:D41, A:T42, A:S43, A:N44, A:Y45, A:N46, A:I47, A:V48, A:T49 | 0.583 | |
*Higher rates show better quality of epitope identification