Table III.
List of All Antigen Binding Residues in Fabs of Our Study
| Number | PDB ID | L1 | L2 | L3 | H1 | H2 | H3 | Non-CDR | |||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1FE8 | D28 | G30 | Y49 | Y50 | R53 | G91 | G92 | T93 | T30 | T31 | Y32 | W52 | G53 | D54 | N56 | Y96 | Y97 | S67 (LC) | ||||||||||||
| N31 | Y32 | N94 | W96 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 2 | 1FNS | N30 | Y32 | E92 | L94 | W96 | M50 | W52 | D54 | A97 | D98 | Y99 | G100 | ||||||||||||||||||
| S56 | T57 | D58 | N100A | Y100B | Y100D | ||||||||||||||||||||||||||
| 3 | 1H0D | N27D | Y28 | S91 | K92 | E93 | T33 | T50 | S52 | S52A | L95 | Y98 | Y100B | ||||||||||||||||||
| F32 | V94 | L96 | G53 | N56 | Y58 | ||||||||||||||||||||||||||
| 4 | 1IQD | S29 | S30 | Y49 | G50 | T53 | G92 | T93 | I96 | Y27 | E31 | L32 | S50 | D52 | E53 | V95 | P96 | D97 | Q1 | V2 (HC) | |||||||||||
| S31 | Y32 | R54 | A55 | T56 | P33 | H35 | E56 | I58 | P98 | D99 | D101 | ||||||||||||||||||||
| 5 | 1JPS | R27 | D28 | Y50 | E56 | H91 | G92 | E93 | K30 | E31 | L50 | D52 | E53 | Q54 | N56 | T96 | A97 | A98 | Y100J | ||||||||||||
| K30 | Y32 | S94 | P95 | W96 | Y32 | Y33 | T57 | I58 | Y59 | Q64 | |||||||||||||||||||||
| 6 | 1KB5 | K27 | Y30 | Y49 | N50 | K52 | H91 | Y92 | G93 | S28 | T30 | Y53 | Y54 | G55 | G56 | I57 | R96 | T97 | D98 | D1 (LC) | |||||||||||
| S31 | Y32 | T53 | E56 | T94 | Y96 | G31 | Y32 | S58 | Y59 | Q61 | K64 | L99 | Y100 | Y100J | |||||||||||||||||
| 7 | 1LK3 | E27 | S28 | K50 | S91 | W92 | N93 | Y33 | Y50 | N52 | N53 | S54 | Y56 | V96 | P97 | G98 | D1 (LC) | ||||||||||||||
| T30 | R32 | G94 | P95 | L96 | T57 | N58 | Y59 | E61 | N99 | N100 | |||||||||||||||||||||
| 8 | 1MLC | N32 | Y50 | S91 | N92 | S93 | S30 | T31 | E50 | L52 | G53 | S54 | G95 | D96 | G98 | ||||||||||||||||
| W94 | R96 | Y32 | W33 | S56 | T57 | Y58 | |||||||||||||||||||||||||
| 9 | 1OSP | Y30 | S31 | R32 | G50 | T52 | S53 | Y91 | W92 | S31 | Y53 | R96 | D97 | Y98 | Y99 | G100 | D66 (LC) | ||||||||||||||
| 10 | 1UJ3 | Q27 | K30 | F32 | Y50 | T52 | H91 | G92 | E93 | K30 | D31 | D52 | A53 | N54 | H56 | D95 | S96 | G97 | Y98 | D1 (LC) | |||||||||||
| S94 | Y96 | Y32 | Y33 | S57 | M58 | Y59 | Q64 | D96 | Y97 | G98 | |||||||||||||||||||||
| 11 | 1WEJ | H30 | N31 | Y32 | N50 | K52 | W92 | K30 | D31 | Y33 | D52 | A53 | S54 | N56 | |||||||||||||||||
| 12 | 1YQV | N31 | Y32 | D50 | W91 | G92 | R93 | S30 | D31 | W33 | E50 | L52 | S54 | G55 | |||||||||||||||||
| S56 | T57 | N58 | G95 | N96 | Y97 | D98 | W47 (HC) | ||||||||||||||||||||||||
| 13 | 1ZTX | S30 | W50 | H91 | Y92 | Y27 | T28 | D31 | L52 | R56 | R58 | R94 | S95 | S97 | |||||||||||||||||
| T93 | T94 | Y32 | W33 | Y98 | G99 | D100 | |||||||||||||||||||||||||
| 14 | 2B2X | Q29 | V30 | Y49 | L50 | S52 | Y53 | W91 | S92 | T28 | S30 | R31 | V50 | S52 | G53 | R94 | F96 | G97 | V2 | W47 (HC) | |||||||||||
| N31 | H32 | L54 | A55 | S56 | N94 | W96 | Y32 | T33 | G54 | H56 | Y58 | D98 | Y100J | D101 | |||||||||||||||||
| 15 | 2CMR | Y30 | H31 | K50 | Y91 | S92 | S30 | S31 | I52 | I53 | F54 | G55 | D95 | N96 | P97 | E73 (HC) | |||||||||||||||
| W32 | N93 | Y94 | Y32 | A33 | T56 | A57 | N58 | Y59 | T98 | L100 | |||||||||||||||||||||
| 16 | 2DD8 | N27 | S30 | W91 | S93 | S94 | S31 | Y32 | T33 | T52 | I53 | L54 | D95 | T96 | V97 | M98 | |||||||||||||||
| D95A | Y96 | I56 | N58 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 17 | 2FD6 | S31 | Y32 | K53 | W91 | N92 | N31 | Y33 | W50 | F52 | D55 | N56 | W95 | H98 | W99 | ||||||||||||||||
| Y93 | F95 | T57 | E58 | Y59 | |||||||||||||||||||||||||||
| 18 | 2NXY | W94 | P95 | I52 | I53 | L54 | E99 | E100B | G100C | E100D | |||||||||||||||||||||
| V56 | H58 | Y100E | D100F | N100G | |||||||||||||||||||||||||||
| 19 | 2Q8B | D32 | V34 | Y49 | Y50 | I53 | G91 | R96 | S25 | G26 | F27 | K28 | R50 | D52 | A53 | L95 | S96 | H101 | F102 | E1 | V2 | Q3 | L4 | S74 | |||||||
| R54 | Y55 | T56 | D31 | T32 | S33 | S75 | N76 (HC) | ||||||||||||||||||||||||
| 20 | 2QQN | Y28 | S30 | L92 | E96 | Y99 | Y100 | S67 | G68 (LC) | ||||||||||||||||||||||
| S31 | Y32 | R100A | M100B | ||||||||||||||||||||||||||||
| 21 | 2R0L | D28 | S30 | S91 | Y92 | T93 | N31 | S32 | H35 | W50 | Y52 | T53 | G54 | G55 | R94 | F95 | W96 | ||||||||||||||
| T31 | T94 | P96 | A56 | T57 | D58 | K64 | W97 | R98 | |||||||||||||||||||||||
| 22 | 2VDR | S30 | N32 | Y49 | Y50 | Y91 | A92 | D31 | T32 | Y33 | R50 | D52 | N54 | Y97 | D98 | Y99 | Y100 | ||||||||||||||
| N53 | D56 | Q93 | L94 | Y56 | K58 | ||||||||||||||||||||||||||
| 23 | 3D85 | Y32 | Y50 | G91 | H92 | S93 | T30 | S31 | N32 | Y50 | N52 | Y53 | N95 | W96 | D97 | V98 | |||||||||||||||
| F94 | F96 | V33 | H35 | N54 | T57 | K58 | |||||||||||||||||||||||||
| 24 | 3D9A | G30 | N31 | K49 | Y50 | S91 | N92 | S93 | D27 | T30 | S31 | Y50 | Y53 | S54 | W96 | D97 | |||||||||||||||
| N32 | Q53 | W94 | Y96 | D32 | Y33 | S56 | Y58 | ||||||||||||||||||||||||
| 25 | Y91 | S92 | W50 | N52 | Y53 | T54 | Y95 | P96 | H97 | Y98 | Y99 | G100 | |||||||||||||||||||
| 1BJ1 | Y32 | V94 | W96 | N31 | Y32 | G33 | E56 | P57 | T58 | S100A | S100B | W100D | |||||||||||||||||||
| 26 | H91 | 192 | S93 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 1CE1 | Y32 | Y49 | N50 | R94 | R96 | Y33 | F50 | R52 | K53 | E95 | G96 | H97 | A100 | ||||||||||||||||||
| 27 | D28 | N30 | Y49 | S50 | F53 | G26 | F27 | D31 | R50 | Y56 | R94 | W95 | G96 | G97 | D98 | R66(LC) | V2(HC) | ||||||||||||||
| 1N8Z | T31 | A32 | Y55 | S56 | H91 | Y92 | T94 | T32 | Y33 | T57 | R58 | G99 | F100 | Y100A | Y102 | ||||||||||||||||
| 28 | W91 | S92 | T28 | T30 | Y50 | N52 | S53 | ||||||||||||||||||||||||
| 1SY6 | S31 | Y32 | D50 | S93 | N94 | R31 | T33 | R54 | Y56 | N58 | D97 | D98 | Y100 | ||||||||||||||||||
| 29 | Q27 | S28 | N91 | N92 | N93 | W52 | S53 | G54 | G55 | T97 | Y98 | Y99 | |||||||||||||||||||
| 1YY9 | N32 | Y50 | W94 | T96 | T30 | N31 | N56 | T57 | D58 | D100 | Y100A | D1 | (LC) | ||||||||||||||||||