Table 2.
Parsimony-informative sites of NA extracted by alignment of nucleotide sequences of all influenza virus clones determined by this study
| Case | Regiona and/ or clone number |
Position number of parsimony-informative site and assigned amino acid of clone 33 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29 | 53 | 80a | 82a | 94 | 142 | 212 | 218 | 221 | 225 | 237 | 275a | 307 | ||
| I | V | V | S | V | D | I | S | N | R | S | H | N | ||
| 1 | R1–R2 | M | P | Y | ||||||||||
| R3 | M | P | A | Y | ||||||||||
| R4–R5 | M | P | Y | |||||||||||
| R6 | M | P | Y | D | ||||||||||
| R7 | M | P | D | Y | ||||||||||
| R8 | A | M | P | Y | ||||||||||
| R9–R11 | M | P | Y | |||||||||||
| R12 | R | M | P | Y | ||||||||||
| L1 | ||||||||||||||
| L2 | M | P | ||||||||||||
| L3 | M | P | ||||||||||||
| L4 | A | S | ||||||||||||
| L5 | G | S | ||||||||||||
| L6 | ||||||||||||||
| L7 | Y | |||||||||||||
| L8–L10 | ||||||||||||||
| L11–L20 | M | P | Y | |||||||||||
| L21 | M | P | F | Y | ||||||||||
| L22 | M | P | Y | |||||||||||
| N1–N8 | M | P | Y | |||||||||||
| N9 | M | P | G | Y | ||||||||||
| N10–N11 | M | P | Y | |||||||||||
| 2 | 1–3 | G | ||||||||||||
| 4 | F | |||||||||||||
| 5–6 | ||||||||||||||
| 7 | G | |||||||||||||
| 8–9 | ||||||||||||||
| 10 | G | M | ||||||||||||
| 11 | ||||||||||||||
| 3 | 12 | A | ||||||||||||
| 13–14 | ||||||||||||||
| 15 | K | |||||||||||||
| 16–21 | ||||||||||||||
| 4 | 22 | R | M | |||||||||||
| 23 | I | |||||||||||||
| 24 | M | D | ||||||||||||
| 25–26 | M | |||||||||||||
| 27 | A | M | ||||||||||||
| 28 | M | |||||||||||||
| 29 | M | D | ||||||||||||
| 30–31 | M | |||||||||||||
| 32–37 | ||||||||||||||
| 38 | K | |||||||||||||
| 39–42 | ||||||||||||||
aKey mutations are designated with bold font