Table 1.
Amino Acid Sequence (Position on Top) Comparison Around the Proteolytic Cleavage Site of the Fusion Protein Between the Dutch Clinical Isolate (hPPMV-1/NL/579/2003) and Representative Avian Paramyxovirus Type 1 Strains Used for Differentiation of Sublineages
| Strain | Accession No.a | Geno-type | Sub- lineage | 8 | 11 | 13 | 14 | 19 | 20 | 22 | 27 | 28 | 49 | 50 | 60 | 63 | 90 | 111 | 112 | 113 | 114 | 115 | 117 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chicken/NL/152608/93 | JN986837 | VII | R | V | L | M | I | M | I | C | L | A | V | S | V | T | G | R | R | Q | K | F | |
| Iraq’78 | AY150092 | VIb/1 | IQ | … | … | … | … | … | T | … | … | P | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| IT-227/1982 | AY150093* | VIb/1 | EU/ea1 | … | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | G | … | … | … | … |
| SE-2/83 | AY150100 | VIb/1 | EU/ea1 | … | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | G | … | … | … | … |
| DE-209/83 | AY150095 | VIb/1 | EU/ea1 | … | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | G | … | … | … | … |
| HU-491/87 | AY150114 | VIb/1 | EU/ea2 | M | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | G | … | … | … | … |
| HU-655/89 | AY150120 | VIb/1 | EU/ea2 | M | … | … | T | T | … | L | … | P | … | … | … | … | … | … | G | … | … | … | … |
| USA/NY/1984 | FJ410145* | VIb/1 | M | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| USA/ML/1984 | FJ410147* | VIb/1 | M | … | … | T | T | … | … | … | P | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| US-17/87 | AY150116 | VIb/1 | NA 1 | … | … | P | … | … | … | … | … | Q | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| CA-24/88 | AY150117 | VIb/1 | NA 1 | … | … | P | … | … | … | … | … | Q | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| MX-11/98 | AY150152 | VIb/1 | NA 1 | … | … | P | … | … | V | … | … | Q | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| HU-61/83 | AY150099 | VIb/1 | NA 2 | … | … | P | … | … | … | … | … | P | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| DE-47/87 | AY150110 | VIb/1 | NA 2 | … | … | P | … | … | … | … | … | P | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| DK-12/93 | AY150138 | VIb/1 | NA 2 | … | … | P | … | … | … | … | … | P | … | I | … | … | … | E | … | … | … | … | … |
| ES-3/92 | AY150132 | VIb/1 | EU/re1 | K | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … |
| DE-48/92 | AY150129 | VIb/1 | EU/re1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … |
| DE-51/93 | AY150133 | VIb/1 | EU/re1 | … | A | … | … | V | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … |
| DE-57/95 | AY150143 | VIb/1 | EU/re1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … |
| DE-2653/98 | AY150149 | VIb/1 | EU/re1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | … | … | … | K | … | … |
| IE/AV324/1996 | GQ429292* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … | |
| USA/0607/2006 | KC013033* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … | |
| USA/0704/2007 | KC013034* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | … | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … | |
| IT/2736/2000 | GQ429293* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | T | … | … | V | I | … | … | … | V | … | … | K | … | … | |
| HU-1G/00 | AY150155 | VIb/1 | EU/re2 | … | A | … | … | … | T | … | … | P | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| YU(Vo)-595/01 | AY150164 | VIb/1 | EU/re2 | … | A | … | … | … | T | … | … | P | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| IT-125/87 | AY150115 | VIb/1 | EU/re2 | … | A | … | … | … | T | … | … | P | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| DE-95/92 | AY150130 | VIb/1 | EU/re2 | … | T | … | … | … | T | … | … | P | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| hPPMV-1/NL/579/2003 | KJ544861* | VIb/1 | … | A | P | … | … | T | V | … | P | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| CH/SDLC/2011 | JQ979176* | VIb/1 | … | A | P | T | … | T | V | … | S | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| Be/11-08304/2011 | JX901123* | VIb/1 | … | A | … | T | … | I | V | … | S | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| DE-690/00 | AY150154 | VIb/1 | EU/re2 | M | A | … | … | … | T | V | … | … | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … |
| Be/98–248/1998 | JX901110* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | V | … | … | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| Be/07-04943/2007 | JX901121* | VIb/1 | … | A | … | … | … | T | V | … | … | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| CH/LGD/110947 | JX486556* | VIb/1 | G | A | P | … | … | T | V | R | … | … | I | … | … | … | … | … | … | … | … | … | |
| HR-65/95 e | AY150144 | Vib/2 | … | A | … | I | … | T | … | R | … | … | … | L | I | A | … | K | … | … | … | … | |
| HR-111/01 | AY150162 | Vib/2 | … | A | … | … | … | T | … | R | … | … | … | L | I | A | … | K | … | … | … | … | |
| HR-3/02 | AY150165 | Vib/2 | … | A | … | … | … | T | … | R | … | … | … | L | I | A | … | K | … | … | … | … |