Table 2.
The primer sequences
Name | Primer sequence | Amplicon location |
---|---|---|
Outer primers 11 | F: 5′-GCATCGTTGACTATGGTGTCCGATTCT | SARS-CoV orf 1a |
B: 5′-ACATCACAGCTTCTACACCCGTTAAGGT | ||
Inner primers 11 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGAGCCGCTTGT | SARS-CoV orf 1a |
CACAATGCCAATT | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCATCACCAA | ||
GCTCGCCAACAGTT | ||
Outer primers 24 | F: 5′-GCTGCATTGGTTTGTTATATCGTTATGC | SARS-CoV orf 1a |
B: 5′-ATACAGAATACATAGATTGCTGTTATCC | ||
Inner primers 24 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTAGCCAGCGT | SARS-CoV orf 1a |
GGTGGTTCATACAA | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCTCCCGGCA | ||
GAAAGCTGTAAGCT | ||
Outer primers 40 | F: 5′-CCTCGAGGCCAGGGCGTTCC | SARS-CoV orf N |
B: 5′-CACGTCTCCCAAATGCTTGAGTGACG | ||
Inner primers 40 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTCCTCATCACG | SARS-CoV orf N |
TAGTCGCGGTAATTC | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTGGCTTTTTAG | ||
ATGCCTCAGCAGCA | ||
Outer primers 44 | F: 5′-TTAAATGCACCGGCCACGGTTTG | SARS-CoV orf S |
B: 5′-CCAGCTCCAATAGGAATGTCGCACTC | ||
Inner primers 44 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATGCACCGGC | SARS-CoV orf S |
CACGGTTTGTG | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTATGCGCCAA | ||
GCTGGTGTGAGTTGA | ||
Outer primers IC | F: 5′-ATGGGGAAGGTGAAGGTCGG | Human GAPDH gene |
B: 5′- TGGTGAAGACGCCAGTGGAC | ||
Inner primers IC | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGCGTATTGGGC | |
GCCTGGTCAC | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCCAGCATCG | ||
CCCCACTTGAT | ||
EC primers | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATCCAAAGAT | Arbidopsis thaliana |
CAATCCGCAG | ||
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCACATCAAAA | ||
GTGTGGTCGG | ||
Universal primers | F: 5′-TAMRA-TCACTTGCTTCCGTTGAGG | |
B: 5′-TAMRA-GGTTTCGGATGTTACAGCGT |