Table 2.
The primer sequences
| Name | Primer sequence | Amplicon location |
|---|---|---|
| Outer primers 11 | F: 5′-GCATCGTTGACTATGGTGTCCGATTCT | SARS-CoV orf 1a |
| B: 5′-ACATCACAGCTTCTACACCCGTTAAGGT | ||
| Inner primers 11 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGAGCCGCTTGT | SARS-CoV orf 1a |
| CACAATGCCAATT | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCATCACCAA | ||
| GCTCGCCAACAGTT | ||
| Outer primers 24 | F: 5′-GCTGCATTGGTTTGTTATATCGTTATGC | SARS-CoV orf 1a |
| B: 5′-ATACAGAATACATAGATTGCTGTTATCC | ||
| Inner primers 24 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTAGCCAGCGT | SARS-CoV orf 1a |
| GGTGGTTCATACAA | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCTCCCGGCA | ||
| GAAAGCTGTAAGCT | ||
| Outer primers 40 | F: 5′-CCTCGAGGCCAGGGCGTTCC | SARS-CoV orf N |
| B: 5′-CACGTCTCCCAAATGCTTGAGTGACG | ||
| Inner primers 40 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTCCTCATCACG | SARS-CoV orf N |
| TAGTCGCGGTAATTC | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTGGCTTTTTAG | ||
| ATGCCTCAGCAGCA | ||
| Outer primers 44 | F: 5′-TTAAATGCACCGGCCACGGTTTG | SARS-CoV orf S |
| B: 5′-CCAGCTCCAATAGGAATGTCGCACTC | ||
| Inner primers 44 | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATGCACCGGC | SARS-CoV orf S |
| CACGGTTTGTG | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTATGCGCCAA | ||
| GCTGGTGTGAGTTGA | ||
| Outer primers IC | F: 5′-ATGGGGAAGGTGAAGGTCGG | Human GAPDH gene |
| B: 5′- TGGTGAAGACGCCAGTGGAC | ||
| Inner primers IC | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGCGTATTGGGC | |
| GCCTGGTCAC | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCCAGCATCG | ||
| CCCCACTTGAT | ||
| EC primers | F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATCCAAAGAT | Arbidopsis thaliana |
| CAATCCGCAG | ||
| B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCACATCAAAA | ||
| GTGTGGTCGG | ||
| Universal primers | F: 5′-TAMRA-TCACTTGCTTCCGTTGAGG | |
| B: 5′-TAMRA-GGTTTCGGATGTTACAGCGT |