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. 2005 Jan 19;33(2):123–131. doi: 10.1016/j.jcv.2004.10.019

Table 2.

The primer sequences

Name Primer sequence Amplicon location
Outer primers 11 F: 5′-GCATCGTTGACTATGGTGTCCGATTCT SARS-CoV orf 1a
B: 5′-ACATCACAGCTTCTACACCCGTTAAGGT
Inner primers 11 F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGAGCCGCTTGT SARS-CoV orf 1a
CACAATGCCAATT
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCATCACCAA
GCTCGCCAACAGTT
Outer primers 24 F: 5′-GCTGCATTGGTTTGTTATATCGTTATGC SARS-CoV orf 1a
B: 5′-ATACAGAATACATAGATTGCTGTTATCC
Inner primers 24 F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTAGCCAGCGT SARS-CoV orf 1a
GGTGGTTCATACAA
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCTCCCGGCA
GAAAGCTGTAAGCT
Outer primers 40 F: 5′-CCTCGAGGCCAGGGCGTTCC SARS-CoV orf N
B: 5′-CACGTCTCCCAAATGCTTGAGTGACG
Inner primers 40 F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGTCCTCATCACG SARS-CoV orf N
TAGTCGCGGTAATTC
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTGGCTTTTTAG
ATGCCTCAGCAGCA
Outer primers 44 F: 5′-TTAAATGCACCGGCCACGGTTTG SARS-CoV orf S
B: 5′-CCAGCTCCAATAGGAATGTCGCACTC
Inner primers 44 F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATGCACCGGC SARS-CoV orf S
CACGGTTTGTG
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTATGCGCCAA
GCTGGTGTGAGTTGA
Outer primers IC F: 5′-ATGGGGAAGGTGAAGGTCGG Human GAPDH gene
B: 5′- TGGTGAAGACGCCAGTGGAC
Inner primers IC F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGCGTATTGGGC
GCCTGGTCAC
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCCAGCATCG
CCCCACTTGAT
EC primers F: 5′-TCACTTGCTTCCGTTGAGGATCCAAAGAT Arbidopsis thaliana
CAATCCGCAG
B: 5′-GGTTTCGGATGTTACAGCGTCACATCAAAA
GTGTGGTCGG
Universal primers F: 5′-TAMRA-TCACTTGCTTCCGTTGAGG
B: 5′-TAMRA-GGTTTCGGATGTTACAGCGT