Table 1.
Virus | Targ et gene | PCR |
Mass Probe extension |
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Forward primer sequence | Reverse primer sequence | Mass Probe sequence | Mass probe mass (Da) | Extension call | Extended Mass Probe mass (Da) | ||
β-actina | – | ACGTTGGATGCAGCAGATGTGGATCAGCAAG | ACGTTGGATGCARGGGTGTGGGTGTTGGTAA | CCTCCATTGTCC | 3532.4 | A-β-actin | 3803.6 |
AIV | M | ACGTTGGATGCTATCRTYCCRTCAGGCCCC | ACGTTGGATGGTCAGAGGTGACARGATTGGT | AAGCCGAGATCG | 3679.4 | C-AIV | 3926.6 |
TMUV | NS5 | ACGTTGGATGCGCAATGGACCCAGGTATGA | ACGTTGGATGCGACCATTCCCCAGTCAGTC | AGAGCTGTGAGCT | 4014.6 | G-TMUV | 4327.8 |
DHAV-1 | VP1 | ACGTTGGATGGGCCAACTCGACCAATTCCT | ACGTTGGATGGCTGGYTTYTTGAGACCCAT | CTGTTCATGTGGAC | 4269.8 | T-DHAV-1 | 4558 |
GPV | VP1 | ACGTTGGATGGTACAAGACGGAGGAGCCAC | ACGTTGGATGATTRCCCACTCCATCGGCACC | CTGTGGCAGCATCTG | 4584 | A-GPV | 4855.2 |
DRV-1 | S4 | ACGTTGGATGGGTBSACATGGTGTTTGACG | ACGTTGGATGCTCGGRRGCAACYGGTATCC | AGCTTCTCTCTGTCGA | 4823.2 | C-DRV-1 | 5070.4 |
DAstV-2 | ORF2 | ACGTTGGATGCTTGTTTGGGCAGCCCTTTG | ACGTTGGATGCATCGATTGTGCGCTGTTGT | AATGGGCACGACAACA | 4908.2 | A-DAstV-2 | 5179.4 |
DAstV-1 | ORF2 | ACGTTGGATGGCCGAGTAGGATCGAGGGTA | ACGTTGGATGTGGTGATTCCAYATGGTCGG | TCCCTAAGCAAAATTGA | 5162.4 | C-DAstV-1 | 5409.6 |
DRV-2 | S1 | ACGTTGGATGTGTATTCACTATTCCGCCAG | ACGTTGGATGGCTATGTCAGCCATAAAGGA | TGCCATTGACGTTGCTAT | 5480.6 | G-DRV-2 | 5793.8 |
DEV | UL6 | ACGTTGGATGTTCGGCTGCTACTTGCCTAC | ACGTTGGATGCGGCATTTACACGATACGGC | TAGCTCTGTCGTTACCACA | 5738.8 | T-DEV | 6027 |
DHAV-3 | VP1 | ACGTTGGATGCTGACCRGGGTCAYGCATCT | ACGTTGGATGGTGCAAYCATRCADGGTGTT | TCTGGAGAAGTGATTCTGA | 5882.8 | C-DHAV-3 | 6130 |
The internal control.