Table 5. Ion ligand binding prediction using the IonCom (Zheng et al., 2019; Hu et al., 2016) analysis, by aligning deep neural-network based contact maps based on the PDB data of human FAHD1 (6FOH). Potential binding sites have been predicted for Zn2+, Ca2+, Mg2+, Na+, K+, PO43-, No binding sites have been predicted for Cu2+, Fe2+/3+, Mn2+, CO3 2-, NO2’, SO4 2-.
Zn2+ | Ca2+ | Mg2+ | Na+ | K+ | PO4 3- | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|
G17 | |||||||
K18 | |||||||
C22 | |||||||
V23 | |||||||
G24 | |||||||
R25 | |||||||
S36 | |||||||
F45 | |||||||
S49 | |||||||
E55 | |||||||
H69 | |||||||
E71 | |||||||
E73 | |||||||
C82 | |||||||
V85 | |||||||
Y97 | |||||||
L1Ol | |||||||
D102 | |||||||
M103 | |||||||
R106 | |||||||
D107 | |||||||
Q109 | |||||||
C112 | |||||||
W119 | |||||||
K123 | |||||||
F125 | |||||||
T126 | |||||||
C129 | |||||||
S132 | |||||||
L150 | |||||||
N153 | |||||||
E155 | |||||||
E159 | |||||||
D186 | |||||||
G191 | |||||||
T192 | |||||||
D203 | |||||||
E204 | |||||||
1205 | |||||||
A207 | |||||||
S214 | |||||||
E223 |