Table 1.
Sequences of oligonucleotides and primers
| Oligo number | Oligonucleotide sequencea,b |
|---|---|
| O1 | 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGCTAAGGACTAACTGGTATATACCATAATTAAATGCATTGCA-3′ |
| O2 | 5′-ATGCATTTAATTATGGTATATACCAGTTAGTCCTTA GCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′ |
| O3 | 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGCCTTCCCTAGGCTAAGGACTAACTGGTATATACCATGCATTGCA-3′ |
| O4 | 5′-ATGCATGGTATATACCAGTTAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′ |
| O5 | 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAATTATGCATTGCA-3′ |
| O6 | 5′-ATGCATAATTACCCATATGAACCATATAATCAGTGTCTGGCCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′ |
| O7 | 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGGGTAATTACCTTCCCTAGGCTAAGGAC TAATGCATTGCA-3′ |
| O8 | 5′-ATGCATTAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCCCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′ |
| O9 | 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTCCTTCCCCCGGCTAAGGACTGG-3′ |
| O10 | 5′-TTTAATTATGGTGGATA CCAGTCCTTAGCCGGGGGAAGGACCC-3′ |
| O11 | 5′-AGTCGACTAATACGAC TCACTATAGGATGGTTCATATGGGTCC-3′ |
| O12 | 5′-ATGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGACCCATATGAACCATCCTATA-3′ |
| O13 | 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAAT TACCTAAAAGGCTAAGGAC-3′ |
| O14 | 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTTAG TCCTTAGCCTTTTAGGTAATTACCC-3′ |
| O15 | 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAATTACCTTCCCTAGGCTAAGGACTG-3′ |
| O16 | 5′-TTTAATTA TGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCC-3′ |
| Primer number | Primer sequencea |
|---|---|
| P1 | 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTTAGTCC-3′ |
| P2 | 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATATGGTTC-3′ |
| P3 | 5′-AAGTCGACAATAATACGACTCACTATAGGAATCAATTTTGCTGCTATCATC-3′ |
| P4 | 5′-ACCCATATGAACCATATAATCAGTGTC-3′ |
| P5 | 5′-AGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATA-3′ |
| P6 | 5′-TTTAATTATGGTGGATACCAGTCCTTAGC-3′ |
| P7 | 5′-AGTCGACTAATACGACTCAC-3′ |
| P8 | 5′-ATGGTATATACCAGTCCTTAG-3′ |
| P9 | 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGAGATCTTCTGCTCTGCACAACC-3′ |
| P10 | 5′-AGTATCCTGTGTTCTCGCAC-3′ |
| P11 | 5′-GAGCGGCCGCCAGTGTG-3′ |
| P12 | 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCC-3′ |
| P13 | 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGACGTGGATATTCTCCTGTG-3′ |
| P14 | 5′-TTTGGTTCCTGGGTGGCTAAT-3′ |
| P15 | 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGTTTGACAGTCAGGTGAATGG-3′ |
| P16 | 5′-TTTAATTTCGGTCACATGG-3′ |
The T7 promoter sequence is underlined.
The NsiI restriction site is in boldface type and the overhangs are italicized.