Skip to main content
. 2004 Dec 18;109(2):109–124. doi: 10.1016/j.virusres.2004.11.014

Table 1.

Sequences of oligonucleotides and primers

Oligo number Oligonucleotide sequencea,b
O1 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGCTAAGGACTAACTGGTATATACCATAATTAAATGCATTGCA-3′
O2 5′-ATGCATTTAATTATGGTATATACCAGTTAGTCCTTA GCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′
O3 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGCCTTCCCTAGGCTAAGGACTAACTGGTATATACCATGCATTGCA-3′
O4 5′-ATGCATGGTATATACCAGTTAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′
O5 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAATTATGCATTGCA-3′
O6 5′-ATGCATAATTACCCATATGAACCATATAATCAGTGTCTGGCCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′
O7 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGGGTAATTACCTTCCCTAGGCTAAGGAC TAATGCATTGCA-3′
O8 5′-ATGCATTAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCCCCTATAGTGAGTCGTATTA-3′
O9 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTCCTTCCCCCGGCTAAGGACTGG-3′
O10 5′-TTTAATTATGGTGGATA CCAGTCCTTAGCCGGGGGAAGGACCC-3′
O11 5′-AGTCGACTAATACGAC TCACTATAGGATGGTTCATATGGGTCC-3′
O12 5′-ATGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGACCCATATGAACCATCCTATA-3′
O13 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAAT TACCTAAAAGGCTAAGGAC-3′
O14 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTTAG TCCTTAGCCTTTTAGGTAATTACCC-3′
O15 5′-GCCAGACACTGATTATATGGTTCATATGGGTAATTACCTTCCCTAGGCTAAGGACTG-3′
O16 5′-TTTAATTA TGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCC-3′
Primer number Primer sequencea
P1 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTTAGTCC-3′
P2 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATATGGTTC-3′
P3 5′-AAGTCGACAATAATACGACTCACTATAGGAATCAATTTTGCTGCTATCATC-3′
P4 5′-ACCCATATGAACCATATAATCAGTGTC-3′
P5 5′-AGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGCCAGACACTGATTATA-3′
P6 5′-TTTAATTATGGTGGATACCAGTCCTTAGC-3′
P7 5′-AGTCGACTAATACGACTCAC-3′
P8 5′-ATGGTATATACCAGTCCTTAG-3′
P9 5′-AATTTAATACGACTCACTATAGGGAGATCTTCTGCTCTGCACAACC-3′
P10 5′-AGTATCCTGTGTTCTCGCAC-3′
P11 5′-GAGCGGCCGCCAGTGTG-3′
P12 5′-TTTAATTATGGTATATACCAGTCCTTAGCCTAGGGAAGGTAATTACCC-3′
P13 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGACGTGGATATTCTCCTGTG-3′
P14 5′-TTTGGTTCCTGGGTGGCTAAT-3′
P15 5′-AAAAGTCGACTAATACGACTCACTATAGGGTTTGACAGTCAGGTGAATGG-3′
P16 5′-TTTAATTTCGGTCACATGG-3′
a

The T7 promoter sequence is underlined.

b

The NsiI restriction site is in boldface type and the overhangs are italicized.