Tableau 2.
Investigations bactériologiques minimales actuellement disponibles en fonction du type de pneumopathie.
| Caractéristiques de la pneumopathie | Investigations bactériologiques d’embléea, b | Investigations bactériologiques secondairesa, b |
|---|---|---|
| PAC non hospitalisées | Aucune | |
| PAC sévères hospitalisées (hors réanimation) | Hémoculture (avant antibiothérapie si possible) Expectoration pour examen direct et culture (avant antibiothérapie si possible) Urines pour antigénurie légionelle si contexte évocateur Réévaluation à 48–72 h |
Si pas d’étiologie à ce stade et évolution insuffisamment favorable Antigénurie pneumocoque PCR M. pneumoniae et C. pneumoniae, voire Legionella |
| PAC sévères hospitalisées en réanimation | Hémoculture (avant antibiothérapie si possible) Sécrétions bronchiques (aspiration endotrachéale ou PBDP) pour examen direct et culture (avant antibiothérapie si possible) + PCR, M. pneumoniae, C. pneumoniae, voire L. pneumophila et Legionella sp. Urines pour antigénurie légionelle et pneumocoque |
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| Pneumopathies aiguës associées aux soins | Priorité à la bactériologie traditionnelle (culture), car germes faciles à cultiver et potentiellement multirésistants Hémoculture Expectoration, PBDP Voire prélèvements plus invasifs (brosse, LBA) |
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| Pneumopathies aiguës sous ventilation mécanique | Priorité à la bactériologie traditionnelle (culture), car germes faciles à cultiver et potentiellement multirésistants Hémoculture Aspiration sécrétions hautes (trachéales), PBDP Voire prélèvements plus invasifs (brosse, LBA) Selon disponibilité : PCR S. aureus et gène mec sur prélèvement respiratoire (type Gene Xpert®) |
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| Pneumopathies aiguës de l’immunodéprimé | Hémoculture (avant antibiothérapie si possible) Expectoration (ou sécrétions bronchiques si intubation) possible, mais le LBA est le prélèvement de référence pour examen direct et culture (avant antibiothérapie si possible) + PCR, M. pneumoniae, C. pneumoniae, voire L. pneumophila et Legionella sp. + recherche de mycobactéries Urines pour antigénurie légionelle et pneumocoque |
Si épanchement pleural ponctionnable, grande valeur pour PCR pneumocoque et surtout PCR « universelle » (ADNr16S) |
a
Ne sont présentées ici que les investigations bactériologiques ; les aspects virologiques et parasitomycologiques font l’objet d’autres chapitres.
b
Discussion bactériologiste/clinicien pour tout cas « atypique ».