Table 3.

Association of amino acid residues in HLA-B with susceptibility to ankylosing spondylitis (P < 10⁻¹⁰⁰ in unconditional analysis)

Position	AA	FRQ	OR	P	P_con_B27	P_con_B27_B40
114	H	0.24	232.78	7.24 × 10−241	1.86 × 10−8	1.18 × 10−8
70	K	0.25	312.90	1.49 × 10−237	1.22 × 10−40	1.35 × 10−38
97	N	0.24	255.79	2.51 × 10−237	1.08 × 10−13	3.49 × 10−13
67	C	0.30	62.52	8.05 × 10−232	6.91 × 10−17	6.89 × 10−18
116	D	0.29	57.93	2.38 × 10−221	0.15	0.061
80	T	0.31	42.93	1.99 × 10−220	2.82 × 10−20	1.27 × 10−21
113	Y	0.32	25.09	5.03 × 10−194	0.33	0.12
9	H	0.39	16.96	2.20 × 10−154	1.00 × 10−11	3.64 × 10−14
45	E	0.39	14.84	5.35 × 10−153	2.41 × 10−9	3.46 × 10−11
9	Y	0.39	16.08	1.75 × 10−151	3.24 × 10−11	2.68 × 10−12
69	A	0.40	11.19	1.81 × 10−146	8.20 × 10−7	1.13 × 10−8
11	S	0.41	13.63	4.25 × 10−145	8.62 × 10−14	1.66 × 10−11
83	R	0.42	13.77	8.00 × 10−145	1.76 × 10−14	7.46 × 10−18
12	V	0.41	12.47	9.64 × 10−143	6.01 × 10−13	9.44 × 10−11
82	L	0.44	10.47	2.64 × 10−140	8.24 × 10−12	3.80 × 10−15
32	L	0.41	11.00	7.76 × 10−137	3.06 × 10−7	1.38 × 10−4
80	N	0.45	8.89	3.98 × 10−135	8.83 × 10−13	1.49 × 10−16
24	T	0.44	9.12	2.58 × 10−134	3.08 × 10−9	8.53 × 10−7
77	D	0.14	27.62	5.68 × 10−128	0.39	0.39
74	D	0.43	7.41	6.83 × 10−126	7.02 × 10−3	2.97 × 10−4
163	E	0.46	6.58	1.53 × 10−121	2.06 × 10−3	0.38
69	T	0.46	5.72	4.97 × 10−117	5.01 × 10−4	5.62 × 10−6
− 16	L	0.48	5.77	4.58 × 10−116	1.76 × 10−6	1.28 × 10−5
− 16	V	0.48	5.69	2.93 × 10−115	1.66 × 10−6	1.17 × 10−5
71	A	0.47	5.49	5.24 × 10−114	1.94 × 10−3	3.15 × 10−5
70	N	0.47	5.48	5.55 × 10−114	1.96 × 10−3	3.19 × 10−5
97	R	0.54	5.13	9.25 × 10−109	7.34 × 10−7	2.13 × 10−6
24	A	0.43	0.23	6.90 × 10−103	3.58 × 10−8	1.14 × 10−5

OR odds ratio in unconditional analysis, P P value in unconditional analysis, P_con_B27 P value in conditional analysis controlling HLA-B*27, P_con_B27_B40 P value in conditional analysis controlling HLA-B*27 and HLA-B*40. NS = P > 0.05