Tableau 15.6.
Séquence des amorces nucléotidiques utilisées pour la recherche de toxines produites par les principaux pathovars d'Escherichia coli.
| Nom | Acronymes français (anglais) | Cibles | Séquences des amorces | Taille du produit | Référence |
|---|---|---|---|---|---|
|
E. coli entérotoxinogène |
ECET (ETEC) | ST (est) | TCT GTA TTG TCT TTT TCA CC | 186 | Frankel 1989 |
| TTA ATA GCA CCC GGT ACA AGC | |||||
| LT (elt) | GGC GAC AGA TTA TAC CGT GC | 750 | |||
| CCG AAT TCT GTT ATA TAT GTC | |||||
| E. coli entéro-invasif | ECEI (EIEC) | Locus ial | TGG AAA AAC TCA GTG CCT CT | 422 | Lüscher 1994 |
| CCA GTC CGT AAA TTC ATT CT | |||||
| E. coli entéro-aggrégatif | ECEAg (EAggEC) | Plasmide pAA |
CTG GCG AAA GAC TGT ATC AT | 630 | Schmidt 1995 |
| CAA TGT ATA GAA ATC CGC TGT T | |||||
| E. coli entéropathogène | ECEP (EPEC) | eae | TTA ACG GCT ATT TCC GCA TGA G | 249 | CNR |
| (et E. coli entérohémorragique) | TCG TCA CCA GAG GAA TCG GAG T | ||||
| E. coli entérohémorragique | ECEH (EHEC, STEC) | stx1 | GGA AGA GTC CGT GGG ATT AC | 135 | CNR |
| GAA AGC GAT GCA GCT ATT AAT AAT G | |||||
| stx2 | CAA CGG TTT CCA TGA CAA CG | 184 | |||
| GTG ACA GTG ACA AAA CGCA G |