Table 1.
Ligands/Compounds | Binding affinity | Ki (nMol) | Nature of binding interactions |
---|---|---|---|
3a | −7.3 | 4.397 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3b | −6.7 | 12.118 | Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Tyr204-Ar(π-alkyl), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3c | −6.6 | 14.348 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3d | −6.9 | 8.643 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3e | −6.6 | 14.348 | Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser251(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3f | −6.7 | 12.118 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Tyr204-CH3(π-alkyl), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3g | −6.7 | 12.118 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π). |
3h | −7.4 | 3.713 | Leu168-Ar(π-alkyl), Tyr204-Oxa(H–B), Tyr204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Phe256-Ar(π-π) |
3i | −6.7 | 12.118 | Leu168-Ar(π-alkyl), Trp204-Ar π-π) |
3j | −6.7 | 12.118 | Thr166-R(C–H), Trp204-Ar(π-π), Trp206-Ar(π-π), Ser252-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
3k | −6.5 | 16.989 | Thr166-F(Halogen), Asn208-ONO(H–B), Trp206-Ar(π-π), Ser251-ONO(H–B), Phe256-Ar(π-π) |
Standard (doxorubicin) | −7.4 | 3.713 | Tyr204-OH(H–B), Tyr204-hexanone(π-π), Ser209-ONO(H–B), His121-Ar(π-π), His121-hexanone(π-π) |
H–B = hydrogen bonding.