Table 3.
Patterns | Groups | Types | No. | PBP3 substitutions for typing according to previous references 13 and 16 | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
D350 | S357 | M377 | S385 | I449 | G490 | A502 | R517 | N526 | A530 | T532 | V547 | N569 | ||||
01 | II | F | 1 | K | ||||||||||||
02 | II | O | 2 | T | K | I | S | |||||||||
03 | II | ChC | 1 | E | K | S | ||||||||||
04 | II | ChA | 6 | E | T | K | I | S | ||||||||
05 | II | ChD | 1 | V | K | |||||||||||
06 | II | B | 2 | V | K | I | S | |||||||||
07 | III‐like | 1 | I | T | H | S | I | S | ||||||||
08 | II | ChE | 1 | N | T | K | ||||||||||
09 | II | D | 3 | N | E | K | S | |||||||||
10 | II | ChB | 2 | N | N | K | ||||||||||
11 | I | 1 | N | N | I | H | I | S | ||||||||
12 | III | 8 | N | N | I | T | K | I | S | |||||||
13 | III | 1 | N | N | I | T | K | S | I | S | ||||||
14 | III‐like | 1 | N | N | I | T | H | I | ||||||||
15 | III‐like | 1 | N | N | I | T | H | I | S | |||||||
16 | III‐like | 1 | N | N | I | T | H | S | I | S | ||||||
17 | III | 1 | N | N | I | T | T | K | I | S | ||||||
18 | III | 1 | N | N | I | T | V | K | ||||||||
19 | III | 1 | N | N | I | T | E | K | S |
Patterns | Groups | Types | No. | Other PBP3 substitutions found only in the present study | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
L389 | G489 | T512 | A520 | G555 | Y557 | Y558 | V562 | N568 | A586 | A587 | ||||
01 | II | F | 1 | L | ||||||||||
02 | II | O | 1 | E | ||||||||||
07 | III‐like | 1 | F | X | H | |||||||||
08 | II | ChE | 1 | T | ||||||||||
10 | II | ChB | 2 | L | ||||||||||
11 | I | 1 | F | S | H | |||||||||
12‐1 | III | 7 | F | L | ||||||||||
12‐2 | III | 1 | F | L | S | S | ||||||||
13 | III | 1 | F | E | H | S | ||||||||
14 | III‐like | 1 | F | E | H | |||||||||
15 | III‐like | 1 | F | H | ||||||||||
16 | III‐like | 1 | F | T | ||||||||||
17 | III | 1 | F | |||||||||||
18 | III | 1 | F | |||||||||||
19 | III | 1 | F |