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. 2020 Apr;190(4):900–915. doi: 10.1016/j.ajpath.2019.12.004

Table 1.

Primer Sequences Used for Real-Time PCR

Primer Forward sequence Reverse sequence
CCR1 5′-CACGGACAAAGTCCCTTGGA-3′ 5′-TGTGGTCGTGTCATAGTCCTCTGT-3′
CCR2 5′-GCCTTTTTCACATAGCTCTTGGC-3′ 5′-AGGAGTCCTTGTGTAGTCACTTT-3′
CCR7 5′-TTCTTCACTGTCCTCCAAGC-3′ 5′-ACATTTCCCTTGTCCTCTCC-3′
CCR8 5′-ATGCCGTGTATGCCCTAAAG-3′ 5′-GCCTTGGTCTTGTTGTGGTT-3′
CXCR1 5′-CTGTTCTGCTACGTGGAGATCC-3′ 5′-CAGGGCGTATTCTAGCTGCTG-3′
CXCR3 5′-CTCTGCTGGACCCCCTATCA-3′ 5′-GTCTCAGACCAGGATGAATC-3′
CXCR4 5′-TATCTGTGACCGCTTCTACC-3′ 5′-GCAGGACAGGATGACAATAC-3′
CXCR7 5′-TGGTCAGTCTCGTGCAGCAC-3′ 5′-GCCAGCAGACAAGGAAGACC-3′
CCL19 5′-ATGTGAATCACTCTGGCCCAGGAA-3′ 5′-AAGCGGCTTTATTGGAAGCTCTGC-3′
CXCL9 5′-TTTTCCTCTTGGGCATCATC-3′ 5′-GAACAGCGACCCTTTCTCAC-3′
CXCL10 5′-GAGCCTACAGCAGAGGAACC-3′ 5′-GAGTCAGAAAGATAAGGCAGC-3′
CXCL11 5′-GCTGTGATATTGTGTGCTACAGT-3′ 5′-GCTTCGATTTGGGATTTAGGCA-3′
GLI1 5′-AGGGCTGCAGTAAAGCCTTCA-3′ 5′-CTTGACATCTTTTCGCAGCG-3′
IL1B 5′-AAACAGATGAAGTGCTCCTTCCAGG-3′ 5′-TGGAGAACACCACTTGTTGCTCCA-3′
IL6 5′-GTAGCCGCCCCACACAGA-3′ 5′-CATGTCTCCTTTCTCAGGGCTG-3′
IL8 5′-GTGCAGTTTTGCCAAGGAGT-3′ 5′-TTATGAATTCTCAGCCCTCTTCAAAAACTTCTC-3′
CCL2 5′-ACTCTCGCCTCCAGCATGAA-3′ 5′-TTGATTGCATCTGGCTGAGC-3′
MMP2 5′-GCTGGCTGCCTTAGAACCTTTC-3′ 5′-GAACCATCACTATGTGGGCTGAGA-3′
MMP7 5′-GGGACATTCCTCTGATCCTAATGC-3′ 5′-GAATTACTTCTCTTTCCATATCGTTTCTGAATGC-3′
MMP9 5′-GCACGACGTCTTCCAGTACC-3′ 5′-GCACTGCAGGATGTCATAGGT-3′
MMP11 5′-CAACATACCTCAATCCTGTCCC-3′ 5′-CAATGGCTTTGGAGGATAGC-3′
MMP12 5′-TTGAATATGACTTCCTACTCCAACG-3′ 5′-GTGGTACACTGAGGACATAGCAAAT-3′
MMP21 5′-AACAATAGGACACGCTATGG-3′ 5′-CATCTCTTTTCCATGTCCAG-3′
PTCH1 5′-TGAGACTGACCACGGCCTG-3′ 5′-ACCCTCAGTTGGAGCTGCTTG-3′
SNAI2 5′-ACATTAGAACTCACACGGGGA-3′ 5′-GTGTGCTACACAGCAGCCAGA-3′
TGFB2 5′-AGTGGACATCAACGGGTTCAG-3′ 5′-CATGAGAAGCAGGAAAGGCC-3′
TWIST1 5′-GGCTCAGCTACGCCTTCTC-3′ 5′-TCCTTCTCTGGAAACAATGACA-3′
TWIST2 5′-AGCGACGAGATGGACAATAAGATGACC-3′ 5′-CGGTCCGGAGGTGGGTGGCG-3′
UBC 5′-AGTCCCTTCTCGGCGATTCT-3′ 5′-GCATTGTCAAGTGACGATCACAGC-3′
VIM1 5′-ACAACCTGGCCGAGGACATC-3′ 5′-AGAGACGCATTGTCAACATCCTG-3′