RT-qPCR |
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pncRNA-D
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5′-GGGACCCTCTCATGTAACCA-3′ |
5′-GAGCCGGCATAATTCAGAAC-3′ |
GAPDH
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5′-CATCACCATCTTCCAGGAGCG-3′ |
5′-CACCACCTTCTTGATGTCATA-3′ |
CCND1
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5′-CGTGGCCTCTAAGATGAAGG-3′ |
5′-CTGGCATTTTGGAGAGGAAG-3′ |
METTL3
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5′-CCCTGTCGCAAGCTGCACTT-3′ |
5′-AACTCCATGGCCCTGCCTGT-3′ |
METTL14
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5′-TTCGACCAGGCTGGCTCACA-3′ |
5′-AGCCACCTCTGTGTGCTCCT-3′ |
WTAP
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5′-GCAGCTGCTCCATTGTGCCT-3′ |
5′-TTCCCTGCGTGCAGACTCCT-3′ |
FTO
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5′-ACCGAGTGGCAGAGTGCTCA-3′ |
5′-CGGGCAATTCGTGACTGGCA-3′ |
ALKBH5
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5′-TCGTCAACAGCGCCGTCATC-3′ |
5′-AACACGGAGCTGCTCAGGGA-3′ |
ChIP |
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−3 kb control |
5′-CAGGGAATCTCTGGTGGATT-3′ |
5′-GGCGATTCTAATTCCTCGAC-3′ |
pncRNA-D promoter |
5′-GAGGAATTCACCCTGAAAGGTG-3′ |
5′-CAAACCACCGTACCCTCTTA-3′ |
CCND1 promoter |
5′-AACGTCACACGGACTACAG-3′ |
5′-ACTCTGCTGCTCGCTGCTAC-3′ |
CRISPR guide RNA |
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pncRNA-D 453–476 |
5′-CACCGAAATATTAGTCCCCTCTGCC-3′ |
5′-AAACGGCAGAGGGGACTAATATTTC-3′ |
Luciferase assay |
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pncRNA-D promoter |
5′-ATGGTACCCCTCACGCTCACGAATT-3′ |
5′-ACGAAGCTTGCTCCAGGACTTTGCA-3′ |
Overexpression |
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GFP--TLS |
5′-ACCGCTCGAGATGGCCTCAAACGATTATAC-3′ |
5′-TATACTGCAGCTAATACGGCCTCTCCCTGC-3′ |
Strep-YTHDC1 |
5′-AGAATTCAGCGGCTGACAGTCGGGA-3′ |
5′-GCCCTGCAGTTATCTTCTATATCGA-3′ |