Table 2.
Ligands | 3CLpro | ACE2 | PLpro | RBD | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
H-bond Donor/acceptor | H-bond Interactions (Interacting residues) | H-bond Donor/acceptor | H-bond Interactions (Interacting residues) | H-bond Donor/acceptor | H-bond Interactions (Interacting residues) | H-bond Donor/acceptor | H-bond Interactions (Interacting residues) | |
Glecaprevir | 2 | His 80 | 2 | Thr 78 | 3 | Asn 1552 | 5 | Arg 457 |
Ser 81 | His 818 | Arg 454 | ||||||
Ile468 | ||||||||
Simeprevir | – | – | 2 | Thr 196 | 1 | Glu 819 | 3 | Arg 454 |
Gln 98 | Glu 471 | |||||||
Ledipasvir | 2 | Thr 26 | 6 | Gln 98 | 3 | Ser 20 | 1 | Lys 458 |
Ser 46 | Asn 194 | Gln 168 | ||||||
Tyr 19 | Glu 815 | |||||||
Ser 105 | ||||||||
Tyr 202 | ||||||||
Asp 350 | ||||||||
Paritaprevir | 1 | Lys 5 | 1 | Lys 94 | 2 |
Lys 945 Asn 1552 |
1 | Phe 490 |
Glycyrrhizic acid | 7 | Gln 189 | 14 | Thr 196 | 7 | Glu 487 | 11 | Arg 457 |
His 164 | Glu 208 | Ser 925 | Asp 467 | |||||
Glu 166 | Glu 87 | Ser 1560 | Ile 488 | |||||
His 163 | Asn 194 | Asp 924 | Cys 480 | |||||
Ser 144 | Gln 101 | Arg 1546 | Gly 482 | |||||
Asn 142 | Glu 87 | Thr 1456 | Ser 469 | |||||
Asn 119 | Asn 397 | Glu 411 | ||||||
Glu 402 | Arg 454 | |||||||
His 401 | ||||||||
Asp 382 | ||||||||
Ala 348 | ||||||||
Ser 47 | ||||||||
Ser 43 | ||||||||
Gly 395 | ||||||||
Hesperidin | 6 | Gln 110 | 19 | Gln 208 | 6 | Gln 168 | 9 | Phe 456 |
Thr 111 | Gly 205 | Glu 177 | Ile 472 | |||||
Arg 105 | Gln 98 | Gln 180 | Arg 454 | |||||
Asp 295 | ||||||||
Asn 194 | Asn 79 | Arg 457 | ||||||
Asn 103 | Asp 467 | |||||||
Gln 101 | Ile 468 | |||||||
His 195 | Gln 474 | |||||||
Thr 196 | Phe 456 | |||||||
Asn 394 | Ile 472 | |||||||
Glu 402 | ||||||||
His 401 | ||||||||
Asp 382 | ||||||||
Ala 348 | ||||||||
Ser 47 | ||||||||
Ser 43 | ||||||||
Gly 395 | ||||||||
TMC-310911 | 2 | Glu 166 | 8 | Gly 205 | 1 | Gln 168 | 4 | Lys 458 |
Thr 26 | Lys 562 | Gln 474 | ||||||
Gln 98 | Arg 457 | |||||||
Asp 382 | Asp 467 | |||||||
His 401 | ||||||||
Asn 394 | ||||||||
Gly 395 | ||||||||
Tyr 385 | ||||||||
Phe 390 |