Skip to main content
. 2020 May 26;11:1088. doi: 10.3389/fmicb.2020.01088

TABLE 1.

CRISPR-Cas systems present in B. pseudocatenulatum strains.

Strain Type-subtype Reapeat sequence Repeat length No. repeats cas1 cas2 cas3 cas9
A13 None
A14 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 63 Y Y Y
FAHBZ2M3 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 113 Y Y Y
FAHBZ9L5 None
FAHWH24M2 None
FFJND17M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 6 Y Y Y
FFJND7M3 None
FFJNDD5M3 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 83 Y Y Y
FFJNDD6M2 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 91 Y Y Y
FGSYC11M1 None
FGSYC12M4 None
FGSYC13M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 114 Y Y Y
FGSYC18M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 104 Y Y Y
FGSYC36M3 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 38 Y Y Y
FGSYC39M1 None
FGSYC3M2 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 99 Y Y Y
FGSYC43M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 83 Y Y Y
FGSYC4M2 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 49 Y Y Y
FGSYC5M4 None
FGSYC6M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 59 Y Y Y
FGSYC76M7 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 34 Y Y Y
FGSYC7M5 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 80 Y Y Y
FGSYC87M1 None
FGSYC88M3 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 53 Y Y Y
FGSYC91M2 None
FGSZY20M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 64 Y Y Y
FGSZY50M3 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 32 Y Y Y
FHNFQ13M2 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 23 Y Y Y
FHNFQ3M1 None
FHNXY15M2 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 90 Y Y Y
FHNXY46M4 II-A GTTTCAGATGCCTGTCAGATCAAAGACTTAGACCAC 36 13 Y Y
FHuNMY10M3 None
FHuNMY37M1 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 97 Y Y Y
FJLHD2M3 None
FJLHD33M2 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 31 Y Y Y
FJLHD45M1 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 21 Y Y Y
FJLHD4M2 None
FJSNT36M3 None
FJSNT37M5 None
FNMHLBE12M7 None
FNXHL2M3 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 25 Y Y Y
FNXHL5M2 II-A GTTTCAGATGCCTGTCAGATCAAAGACTTAGACCAC 36 13 Y Y
FNXYCHL12M2 II-A GTTTCAGATGCCTGTCAGATCAAAGACTTAGACCAC 36 31 Y Y
FQHXN112M3 None
FQHXN3M8 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 64 Y Y Y
FQHXN5M4 None
FQHXN6M4 None
FQHXN72M4 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 8 Y Y Y
FQHXN83M4 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 116 Y Y Y
FQHXN8M3 None
FSCPS14M2 I-U ATTCCTGGGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 32 Y Y Y
FSDWF3M4 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 111 Y Y Y
FSHXXA2M9 None
FXJKS15M4 None
FXJWS24M3 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 48 Y Y Y
FXJWS49M33 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 81 Y Y Y
FYNDL22M6 I-C GTCACTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 16 Y Y Y
FYNLJ23M6 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 76 Y Y Y
FZJHZ1M1 I-E GTGTTCCCCGCATACGCGGGGATGATCCC 29 168 Y Y Y
FZJHZD11M4 None
HuNa38 None
HuNan_2016 II-A GTTTCAGATGCCTGTCAGATCAAAGACTTAGACCAC 36 47 Y Y
NT17 I-U ATTCCTGAGCTAATCAGCTCAGGACTTCATTGAGGA 36 41 Y Y Y
U2 I-C GTCGCTCTCCTCATGGAGAGCGTGGATTGAAAT 33 60 Y Y Y
V6 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 22 Y Y Y
XZ28R1 I-C GTCGCTCCCCGCAAGGGGAGTGTGGATTGAAAT 33 16 Y Y Y