Table 6.
MHC class-II allele binding epitopes predicted using Propred-I.
| Sr# | Peptide | Allels | Vaxijen score |
|---|---|---|---|
| 1 | WVIILFQRTFSIPL | HLA-DRB1_0101, HLA-DRB1_0102, HLA-DRB1_0301, HLA-DRB1_0305, HLA-DRB1_0306, HLA-DRB1_0307, HLA-DRB1_0308, HLA-DRB1_0309, HLA-DRB1_0311, HLA-DRB1_0401, HLA-DRB1_0402, HLA-DRB1_0404, HLA-DRB1_0405, HLA-DRB1_0408, HLA-DRB1_0410, HLA-DRB1_0421, HLA-DRB1_0423, HLA-DRB1_0426, HLA-DRB1_0701, HLA-DRB1_0703, HLA-DRB1_1107, HLA-DRB1_1114, HLA-DRB1_1120, HLA-DRB1_1121, HLA-DRB1_1128, HLA-DRB1_1301, HLA-DRB1_1302, HLA-DRB1_1304, HLA-DRB1_1305, HLA-DRB1_1307, HLA-DRB1_1311, HLA-DRB1_1321, HLA-DRB1_1322, HLA-DRB1_1323, HLA-DRB1_1327, HLA-DRB1_1328, HLA-DRB1_1501, HLA-DRB1_1502, HLA-DRB1_1506, HLA-DRB5_0101, HLA-DRB5_0105 | 0.6682 |
| 2 | IRGFPRCRY | HLA-DRB1_0801, HLA-DRB1_0802, HLA- DRB1_0804, HLA-DRB1_0806, HLA-DRB1_0813, HLA-DRB1_0817, HLA-DRB1_1101, HLA-DRB1_1102, HLA-DRB1_1104, HLA-DRB1_1106, HLA-DRB1_1114, HLA-DRB1_1120, HLA-DRB1_1121, HLA-DRB1_1128, HLA- DRB1_1301, HLA-DRB1_1302, HLA-DRB1_1304, HLA-DRB1_1305, HLA-DRB1_1307, HLA-DRB1_1311, HLA-DRB1_1321, HLA-DRB1_1322, HLA-DRB1_1323, HLA-DRB1_1327, HLA-DRB1_1328, HLA-DRB1_1501, HLA-DRB1_1502, HLA-DRB1_1506 | 0.7901 |
| 3 | VVAFLILPQ | HLA-DRB1_0306, HLA-DRB1_0307, HLA- DRB1_0308, HLA-DRB1_0311, HLA-DRB1_0402, HLA-DRB1_0404, HLA-DRB1_0405, HLA-DRB1_0408, HLA-DRB1_0410, HLA-DRB1_0423, HLA-DRB1_0801, HLA-DRB1_0802, HLA-DRB1_0804, HLA-DRB1_0806, HLA-DRB1_0813, HLA-DRB1_0817, HLA-DRB1_1101, HLA-DRB1_1102, HLA-DRB1_1104, HLA-DRB1_1106, HLA- DRB1_1107, HLA-DRB1_1114, HLA-DRB1_1120, HLA-DRB1_1121, HLA-DRB1_1128, HLA-DRB1_1301, HLA-DRB1_1302, HLA-DRB1_1304, HLA-DRB1_1305, HLA-DRB1_1307, HLA-DRB1_1311, HLA-DRB1_1321, HLA-DRB1_1322, HLA-DRB1_1323, HLA-DRB1_1327, HLA-DRB1_1328, HLA-DRB1_1501, HLA-DRB1_1502, HLA-DRB1_1506 | 0.6924 |
| 4 | DKLVCRDKLSS | HLA-DRB1_0301, HLA-DRB1_0305, HLA-DRB1_0306, HLA-DRB1_0307, HLA-DRB1_0308, HLA-DRB1_0309, HLA-DRB1_0311, HLA-DRB1_0402, HLA-DRB1_0801, HLA-DRB1_0802, HLA-DRB1_0804, HLA-DRB1_0806, HLA-DRB1_0813, HLA-DRB1_0817, HLA- DRB1_1101, HLA- DRB1_1102, HLA- DRB1_1104, HLA- DRB1_1106, HLA- DRB1_1107, HLA- DRB1_1121, HLA- DRB1_1311, HLA- DRB1_1321, HLA- DRB1_1322, HLA- DRB1_1501, HLA- DRB1_1502 | 0.7714 |
| 5 | LQLFLRATTELR | HLA- DRB1_0309, HLA- DRB1_0401, HLA- DRB1_0402, HLA- DRB1_0408, HLA- DRB1_0421, HLA- DRB1_0426, HLA- DRB1_0801, HLA- DRB1_0802, HLA- DRB1_0804, HLA- DRB1_0806, HLA- DRB1_0813, HLA- DRB1_1101, HLA- DRB1_1102, HLA- DRB1_1104, HLA- DRB1_1106, HLA- DRB1_1121, HLA- DRB1_1304, HLA- DRB1_1321, HLA- DRB1_1322, HLA- DRB1_1501, HLA- DRB1_1506 | 0.6327 |