Table 3.
PKC isoform binding site amino acids and corresponding interactions.
| Compounds | PKC Isoform | |||
|---|---|---|---|---|
| α | β I | ι | θ | |
| DeRoy (1) | Met 417 (L), Ala 480 (L), Met 470 (L), Lys 368 (H), Val 353 (L), Leu 345 (L) | Met 473 (L), Ala 483 (L), Phe 485 (L), Leu 394 (L), Phe 353 (L), Val 356 (L), Lys 371 (L), Phe 418 (L), Met 420 (L), Ala 369 (L), Leu 348 (L) | Leu 376 (L), Thr 386 (R), Val 307 (L), Phe 297 (L), Ile 323 (L), Lys 274 (L), Val 259 (L), Ile 251 (L) | Leu 511 (L), Ala 521 (L), Met 458 (L), Lys 409 (H), Val 394 (H), Phe 391 (R) |
| Roy (2) | Val 420 (H), Lys 368 (L), Ala 366 (L), Met 417 (L), Val 353 (L), Leu 345 (H, L) | Met 473 (L), Ala 483 (L), Phe 353 (L), Met 420 (L), Lys 371 (L), Val 356 (L) | Asp 373 (H), Ile 323 (L) | Leu 511 (L), Asn 509 (L), Ala 521 (L), Met 458 (L), Lys 409 (L), Val 394 (L), Leu 386 (L) |
| ParvD (3) | Met 470 (L), Val 353 (L), Ala 366 (L), Leu 345 (L), Met 417 (R, L), Lys 368 (L), Leu 391 (L), Ala 480 (L) | Met 473 (L), Tyr 422 (L), Leu 348 (L), Val 356 (L), Ala 483 (L), Ala 369 (L), Asn 471 (H), Phe 485 (L), Leu 394 (L), Lys 371 (L) | Ile 251 (L), Val 259 (L), Leu 376 (L), Tyr 325 (H), Val 259 (L), Thr 386 (L), Lys 274 (L), Ile 323 (L), Val 307 (L), Phe 297 (L) | Leu 511 (L), Ala 521 (L), Met 458 (L), Ala 407 (L), Val 394 (L), Phe 391 (L) |
| RoyBz (4) | Asp 424 (H), Ala 366 (L), Val 353 (L), Met 417 (L), Lys 368 (L), Ala 480 (L) | Leu 348 (L), Met 473 (L), Val 356 (L), Phe 353 (L), Lys 371 (L), Met 420 (L), Ala 483 (L) | Phe 333 (L, R), Asp 330 (H), Ile 251 (L), Leu 376 (L), Val 259 (L), Thr 386 (R), Ala 272 (L), Ile 323 (L), Val 307 (L) | Gly 464 (L), Phe 391 (L), Val 394 (L), Ala 407 (L), Met 458 (L), Ala 521 (L), Asp 522 (L), Lys 409 (H) |
| RoyBzCl (5) | Asp 424 (H), Gly 423 (L), Met 343 (R, L), Val 353 (L), Phe 350 (L), Lys 368 (L), Met 417 (L), Ala 480 (L) | Met 473 (L), Ala (483), Leu 394 (L), Met 420 (R, L), Lys 371 (L), Val 356 (L), Phe 353 (L), Leu 348 (L) | Phe 333 (R), Asp 330 (H), Thr 386 (R), Val 307 (L), Ile 323 (R), Ala 272 (R), Val 259 (R, L), Ile 251 (L), Arg 253 (R, L) | Leu 511 (L), Ala 521 (L), Lys 506 (L), Phe 391 (R), Val 394 (L), Leu 386 (R), Tyr 460 (L) |
| RoyPr2 (6) | Asp 424 (H), Met 470 (L), Val 420 (L), Met 417 (L), Ala 366 (L), Val 353 (L) | Ala 483 (L), Phe 383 (L), Lys 371 (L), Val 356 (L), Leu 348 (L) | Thr 386 (H), Leu 376 (L), Ile 251 (L), Val 259 (L), Ala 257 (L) | Leu 511 (L), Ala 521 (L), Met 458 (L), Lys 409 (H, L), Ala 407 (L), Val 394 (L), Phe 391 (L) |
| DihydroxyRoy (7) | Met 470 (L), Val 420 (H), Met 417 (L), Lys 368 (L), Leu 345 (H, L) | Phe 353 (L), Leu 348 (L), Val 356 (L), Lys 371 (L), Met 420 (R, L), Leu 394 (L), Phe 485 (L), Ala 483 (L) | Asp 373, Val 259, Lys 274, Ala 272, Ile 323 | Leu 511 (L), Ala 521 (L), Phe 523 (L), Leu 432 (L), Met 458 (L), Lys 409 (L), Val 394 (L), Leu 386 (L), Phe 391 (R) |
H—Hydrophobic interaction; L—Hydrophilic interaction; R—aromatic interaction.