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. 2020 May 17;12(5):1267. doi: 10.3390/cancers12051267

Table 3.

Pearson correlation between the expression of CSC transcripts and the transcripts of the key enzymes involved in the ETC in patients’ data curated from TCGA. Red indicates significant positive, blue indicates negative correlations, and black indicates insignificant p-values of either positive or negative correlations.

TCGA
CD44 CD24 CD117 CD133 ALDH1A1 SOX2 4-Oct NANOG NOTCH1
Complex I Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value Pearson R p-Value
NDUFA10 0.04 0.44 0.02 0.72 −0.02 0.72 −0.03 0.52 0.09 0.06 −0.02 0.62 −0.03 0.53 0.00 0.93 0.10 0.05
NDUFA11 −0.02 0.62 0.08 0.10 0.00 0.93 −0.05 0.29 −0.01 0.86 −0.02 0.67 −0.07 0.16 0.05 0.30 −0.15 0.00
NDUFAF4 −0.12 0.01 0.23 1.6e−06 −0.06 0.22 −0.09 0.05 0.03 0.54 −0.02 0.76 0.00 1.00 0.05 0.29 −0.13 0.01
NDUFA2 −0.13 0.01 −0.03 0.48 −0.19 1e−04 −0.11 0.02 −0.02 0.66 −0.02 0.64 −0.09 0.06 0.01 0.83 −0.29 1.7e−09
NDUFB7 −0.12 0.01 −0.02 0.67 −0.15 0.00 −0.09 0.06 −0.05 0.32 −0.04 0.40 −0.07 0.15 0.03 0.49 −0.18 0.00
NDUFS1 0.20 2.8e−05 0.16 0.00 0.14 0.00 0.14 0.00 0.17 0.00 0.02 0.69 0.07 0.14 0.03 0.57 0.39 0.00
NDUFS2 0.18 0.00 0.13 0.01 0.15 0.00 0.13 0.01 0.06 0.23 0.09 0.06 0.15 0.00 0.16 0.00 0.36 1.3e−14
NDUFS3 0.12 0.01 −0.05 0.29 −0.12 0.01 −0.02 0.74 0.00 0.93 0.04 0.39 0.04 0.39 0.02 0.62 −0.10 0.05
NDUFS7 0.15 0.00 −0.02 0.73 −0.18 0.00 −0.08 0.10 −0.03 0.49 −0.01 0.89 −0.01 0.86 −0.02 0.69 −0.11 0.02
NDUFV1 0.05 0.33 −0.02 0.71 −0.13 0.01 −0.01 0.80 −0.04 0.43 0.03 0.51 0.18 0.00 0.03 0.61 0.08 0.11
NDUFV2 −0.02 0.71 0.05 0.29 −0.11 0.02 0.15 0.00 0.02 0.65 0.06 0.18 −1e−04 1.00 0.05 0.35 0.01 0.88
NDUFV3 0.06 0.24 −0.01 0.84 −0.03 0.56 0.07 0.14 0.09 0.07 0.03 0.52 0.10 0.03 0.08 0.10 0.15 0.00
Complex II
SDHA 0.11 0.03 0.03 0.52 −0.04 0.46 0.05 0.35 0.03 0.52 0.11 0.03 0.06 0.20 0.04 0.39 0.16 0.00
SDHB 0.18 0.00 0.09 0.07 −0.05 0.28 0.05 0.29 −0.02 0.76 −0.05 0.29 0.08 0.10 −0.03 0.56 0.03 0.54
SDHC 0.16 0.00 0.11 0.03 0.10 0.04 0.07 0.15 0.21 1.4e−05 0.06 0.23 −0.0029 0.95 0.11 0.03 0.11 0.02
SDHD 0.03 0.59 0.08 0.09 −0.12 0.01 0.02 0.72 0.00 0.96 0.02 0.75 0.04 0.46 −0.04 0.43 −0.03 0.48
Complex III
UQCRB −0.12 0.02 −0.06 0.19 −0.20 2.6e−05 −0.08 0.09 −0.14 0.00 −0.06 0.20 −0.1 0.04 −0.04 0.47 −0.20 2.1e−05
UQCRC1 0.03 0.54 0.08 0.09 0.00 0.94 0.06 0.25 0.08 0.09 0.04 0.39 0.06 0.20 0.13 0.01 0.17 0.00
UQCRC2 0.21 1.3e−05 0.17 0.00 0.05 0.31 0.07 0.17 0.00 0.92 −0.06 0.23 0.15 0.00 0.04 0.37 0.07 0.16
UQCRH −0.04 0.42 −0.13 0.01 −0.13 0.01 −0.01 0.82 −0.01 0.84 0.00 1.00 −0.03 0.58 −0.08 0.12 −0.17 0.00
UQCRQ −0.05 0.34 −0.06 0.20 −0.17 0.00 −0.06 0.19 −0.03 0.60 −0.02 0.70 −0.01 0.77 −0.04 0.41 −0.31 3.6e−11
UQCR10 0.04 0.43 0.15 0.00 −0.1 0.04 0.03 0.50 0.00 0.97 −0.02 0.70 0.06 0.23 −0.02 0.66 −0.11 0.02
UQCR11 −0.03 0.57 −0.05 0.32 −0.21 9.6e−06 −0.10 0.04 −0.07 0.18 −0.03 0.50 −0.1 0.04 −0.03 0.59 −0.29 8e−10
CYCS 0.09 0.05 0.07 0.18 −0.06 0.20 −0.04 0.43 0.09 0.06 −0.02 0.73 0.02 0.64 0.03 0.60 0.11 0.03
Complex IV
COX4I1 0.01 0.81 0.10 0.05 −0.15 0.00 0.03 0.57 −0.09 0.07 −0.06 0.26 0.03 0.50 −0.06 0.21 −0.19 1e−04
COX4I2 −0.07 0.18 0.06 0.22 0.25 2.2e−07 0.01 0.83 0.17 0.00 −0.01 0.82 −0.08 0.10 0.16 0.00 0.15 0.00
COX5A 0.00 0.95 −0.09 0.08 −0.19 9.3e−05 −0.04 0.42 0.00 0.95 −0.04 0.43 −0.04 0.42 −0.05 0.31 −0.13 0.01
COX5B −0.22 6.6e−06 0.10 0.04 −0.18 0.00 −0.07 0.13 −0.09 0.08 −0.02 0.64 −0.02 0.68 −0.04 0.36 −0.27 1.7e−08
COX6A1 −0.1 0.04 0.03 0.53 −0.11 0.03 −0.06 0.23 0.07 0.13 0.01 0.87 −0.10 0.04 0.06 0.19 −0.12 0.02
COX6A2 −0.13 0.01 0.09 0.06 0.20 3.1e−05 0.00 0.92 0.14 0.00 0.02 0.69 −0.07 0.14 0.24 3.6e−07 0.04 0.39
COX6B1 −0.06 0.21 −0.03 0.61 −0.02 0.73 −0.06 0.23 0.07 0.15 −0.01 0.87 0.01 0.85 0.07 0.15 −0.19 0.00
COX6B2 −0.04 0.38 −0.01 0.77 0.06 0.20 −0.03 0.54 0.00 0.94 −0.03 0.48 0.00 0.96 0.07 0.15 0.23 2.6e−06
COX6C −0.09 0.05 −0.12 0.01 −0.20 5e−05 −0.032 0.51 −0.13 0.01 −0.04 0.39 −0.12 0.01 −0.01 0.91 −0.12 0.01
COX7A1 −0.02 0.64 −0.06 0.24 0.13 0.01 −0.03 0.56 0.08 0.09 −0.04 0.38 −0.06 0.19 0.02 0.67 0.00 0.99
COX7A2 −0.08 0.09 0.09 0.05 −0.04 0.40 −0.09 0.06 0.02 0.74 0.00 0.93 −0.08 0.09 0.01 0.87 −0.19 5.8e−05
COX7B −0.02 0.70 −0.01 0.78 −0.19 1e−04 −0.07 0.14 0.01 0.78 0.00 0.95 −0.07 0.15 0.00 0.98 −0.27 1.1e−08
COX7C −0.21 9.9e−06 0.03 0.55 −0.08 0.09 −0.09 0.08 −0.10 0.04 −0.09 0.06 0.00 0.96 −0.01 0.84 −0.30 2.8e−10
Complex V
ATP5C1 0.03 0.51 0.08 0.11 −0.06 0.24 −0.06 0.22 −0.02 0.62 0.01 0.87 −0.05 0.36 −0.05 0.28 −0.07 0.13
ATP5D −0.02 0.63 −0.01 0.91 −0.22 7.6e−06 −0.11 0.02 −0.15 0.00 −0.06 0.26 0.00 0.93 −0.04 0.38 −0.18 0.00
ATP5E −0.14 0.00 0.00 0.93 −0.05 0.33 −0.03 0.54 0.03 0.52 0.06 0.26 −0.10 0.04 0.02 0.76 −0.19 0.00
ATP5G3 0.07 0.14 −0.04 0.36 −0.16 0.00 −0.08 0.08 −0.01 0.87 −0.06 0.23 −0.05 0.34 −0.07 0.17 −0.13 0.01
ATP5J −0.03 0.52 −0.02 0.65 −0.10 0.05 −0.04 0.44 0.17 0.00 −0.01 0.84 0.01 0.89 0.00 0.97 −0.17 0.00
ATP5O −0.10 0.04 −0.02 0.75 −0.10 0.03 −0.06 0.23 −0.07 0.14 −0.07 0.14 0.06 0.25 0.04 0.46 −0.19 0.00
ATP5S 0.02 0.71 0.00 0.99 0.08 0.10 0.10 0.03 0.14 0.00 −0.01 0.78 0.05 0.32 0.13 0.01 0.10 0.04