Table 2.
Number of sequences by patterns of cleavage sites on the ORF1-encoding proteins.
| Genotype | NS1/NS2 | NS2/NS3 | NS3/NS4 | NS4/NS5 | NS5/NS6-NS7 | NS6-NS7/VP1 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| E/G | E/A | E/G | E/S | Q/G | Q/A | Q/G | Q/S | E/A | E/G | Q/A | E/A | E/G | E/S | ME/G | |
| GI.1 | 23 | 23 | 23 | 23 | 8 | 8 | 7 | 23 | |||||||
| GI.2 | 11 | 11 | 11 | 10 | 1 | 9 | 2 | 11 | |||||||
| GI.3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||
| GI.4 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
| GI.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
| GI.6 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | |||||||||
| GI.7 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
| GII.1 | 17 | 17 | 17 | 17 | 17 | 17 | |||||||||
| GII.2 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | |||||||||
| GII.3 | 12 | 12 | 12 | 12 | 11 | 12 | |||||||||
| GII.4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | |||||||||
| GII.5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | |||||||||
| GII.6 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||
| GII.7 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
| GII.8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | |||||||||
| GII.NA1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||
| GIV.1 | 27 | 27 | 27 | 27 | 27 | 27 | |||||||||
| GV.1 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | 8 | |||||||||
| GV.2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | |||||||||