Skip to main content
. 2020 Jun 11;20:272. doi: 10.1186/s12870-020-02440-1

Table 1.

bHLH genes in Cucumber

CsbHLH Gene ID Location Gene length Amino acid length pI
001 CsaV3_1G005290 Chr1:3503806–3,504,411 1909 84 5.04
002 CsaV3_1G011300 Chr1:6972358–6,976,069 4167 236 5.78
003 CsaV3_3G022420 Chr3:19737551–19,739,874 958 502 5.7
004 CsaV3_3G049150 Chr3:40071324–40,074,834 1400 689 5.11
005 CsaV3_3G001710 Chr3:1295970–1,297,898 5601 643 6.21
006 CsaV3_3G000850 Chr3:656062–658,628 6057 448 8.65
007 CsaV3_1G039580 Chr1:24945063–24,953,384 1684 319 5.78
008 CsaV3_2G007370 Chr2:3725743–3,731,272 605 707 6.09
009 CsaV3_4G032110 Chr4:22635255–22,641,052 3486 551 6.25
010 CsaV3_1G043790 Chr1:28804330–28,811,620 6167 960 6.4
011 CsaV3_2G015700 Chr2:13017831–13,023,291 1802 336 5.64
012 CsaV3_6G000530 Chr6:351129–356,108 2050 645 5.51
013 CsaV3_3G007980 Chr3:6919411–6,921,670 2306 650 5.83
014 CsaV3_2G010120 Chr2:6877325–6,878,870 2524 323 6.02
015 CsaV3_7G025510 Chr7:14980031–14,984,292 3589 533 6.06
016 CsaV3_6G009090 Chr6:7311297–7,315,687 3711 486 6.35
017 CsaV3_2G028950 Chr2:18953613–18,956,324 3528 348 8.3
018 CsaV3_7G007460 Chr7:4647975–4,650,800 3316 335 6.64
019 CsaV3_6G044570 Chr6:26373287–26,375,739 3723 330 5.3
020 CsaV3_6G044560 Chr6:26366139–26,368,813 11,538 309 5.81
021 CsaV3_5G026500 Chr5:21650877–21,655,135 2678 624 5.04
022 CsaV3_6G044730 Chr6:26485325–26,487,050 1415 342 4.86
023 CsaV3_2G030090 Chr2:19685080–19,689,447 4059 363 4.57
024 CsaV3_6G043370 Chr6:25541506–25,544,586 8321 416 5.2
025 CsaV3_6G044580 Chr6:26382822–26,384,588 3478 276 6.05
026 CsaV3_2G035250 Chr2:23586273–23,591,605 3855 239 6.77
027 CsaV3_2G008770 Chr2:5179234–5,186,154 7290 246 4.92
028 CsaV3_6G008940 Chr6:7177946–7,179,613 5695 432 5.42
029 CsaV3_6G014370 Chr6:10430376–10,432,021 6113 308 4.98
030 CsaV3_5G033960 Chr5:27092009–27,094,880 4184 372 5.77
031 CsaV3_6G036080 Chr6:20032486–20,036,831 1493 242 9.03
032 CsaV3_1G033410 Chr1:20481133–20,483,811 5529 256 9.24
033 CsaV3_1G009900 Chr1:6174783–6,178,372 6920 551 5.6
034 CsaV3_2G001440 Chr2:370393–376,506 1545 543 8.37
035 CsaV3_1G031920 Chr1:18957508–18,969,046 2275 242 5.03
036 CsaV3_7G004510 Chr7:3234760–3,236,331 1320 211 6.77
037 CsaV3_4G034440 Chr4:24394485–24,395,550 3489 239 7.1
038 CsaV3_4G029740 Chr4:19342473–19,344,831 5460 253 6.17
039 CsaV3_3G000950 Chr3:733695–738,681 1011 773 5.11
040 CsaV3_2G026610 Chr2:18201502–18,202,748 2627 240 7.26
041 CsaV3_1G040580 Chr1:25826012–25,829,490 1816 492 7.03
042 CsaV3_6G037080 Chr6:20849605–20,855,801 4137 651 5.91
043 CsaV3_6G041730 Chr6:24304724–24,306,996 1246 235 6.42
044 CsaV3_1G003910 Chr1:2423148–2,424,832 2711 266 6.87
045 CsaV3_3G013690 Chr3:10293079–10,294,740 2245 191 8.64
046 CsaV3_1G006280 Chr1:4002735–4,008,902 4367 566 9.01
047 CsaV3_1G002260 Chr1:1450554–1,451,954 1411 261 6.16
048 CsaV3_3G039100 Chr3:32125102–32,130,846 2115 370 5.74
049 CsaV3_5G033600 Chr5:26846039–26,850,063 5332 571 6.09
050 CsaV3_1G006650 Chr1:4277323–4,279,125 2566 279 6.1
051 CsaV3_6G001900 Chr6:1303975–1,307,218 4986 248 9.26
052 CsaV3_1G037610 Chr1:23567571–23,568,986 1928 309 4.78
053 CsaV3_6G037070 Chr6:20836169–20,845,986 5647 263 6.08
054 CsaV3_2G026190 Chr2:17969523–17,971,339 1844 330 5.15
055 CsaV3_3G034600 Chr3:29292016–29,296,383 2259 695 5.24
056 CsaV3_3G044120 Chr3:35995420–35,997,451 4852 272 5.09
057 CsaV3_2G005070 Chr2:2751170–2,752,663 3663 318 5.74
058 CsaV3_2G014750 Chr2:12321166–12,324,655 1661 343 6.2
059 CsaV3_7G027630 Chr7:17195587–17,199,883 1509 317 6
060 CsaV3_2G025890 Chr2:17778099–17,780,726 3295 342 6.26
061 CsaV3_2G030500 Chr2:20027274–20,029,389 2181 372 4.71
062 CsaV3_3G015900 Chr3:11810548–11,813,843 2822 547 6.88
063 CsaV3_7G000080 Chr7:185656–189,146 2627 457 5.85
064 CsaV3_1G000190 Chr1:132006–133,915 2323 276 7.03
065 CsaV3_3G028610 Chr3:25161463–25,169,489 3059 540 5.7
066 CsaV3_2G003660 Chr2:1833037–1,837,221 6474 422 6.1
067 CsaV3_4G002800 Chr4:1745825–1,749,669 8026 168 7.65
068 CsaV3_1G045830 Chr1:31650489–31,656,184 4367 395 6.39
069 CsaV3_4G026430 Chr4:15704947–15,706,451 3065 196 6.51
070 CsaV3_3G007090 Chr3:6381666–6,383,510 5744 359 5.94
071 CsaV3_3G049050 Chr3:40003473–40,010,806 1802 322 7.73
072 CsaV3_1G005810 Chr1:3727778–3,731,264 2031 443 9.02
073 CsaV3_2G026540 Chr2:18154564–18,158,701 3855 380 5.01
074 CsaV3_4G035310 Chr4:24884098–24,888,333 2900 403 5.7
075 CsaV3_3G020750 Chr3:16961726–16,964,548 7333 248 7.09
076 CsaV3_5G018750 Chr5:14293739–14,297,926 3510 534 5.2
077 CsaV3_4G034660 Chr4:24537693–24,539,435 1700 409 6.38
078 CsaV3_7G026520 Chr7:16047841–16,051,016 3844 490 6.04
079 CsaV3_1G001960 Chr1:1286661–1,290,828 5186 196 7.64
080 CsaV3_5G040480 Chr5:31836009–31,840,665 2228 245 5.67
081 CsaV3_6G002130 Chr6:1472037–1,473,566 1504 161 5.12
082 CsaV3_1G028780 Chr1:15708212–15,711,935 2358 423 6.34
083 CsaV3_5G024030 Chr5:18711066–18,713,891 3741 285 6.21
084 CsaV3_4G000380 Chr4:228607–230,307 5797 342 4.89
085 CsaV3_4G034980 Chr4:24696914–24,698,535 1065 245 6.18
086 CsaV3_3G014190 Chr3:10642450–10,643,959 1742 203 7.81
087 CsaV3_7G035000 Chr7:22142359–22,144,409 1621 394 6.54
088 CsaV3_2G016810 Chr2:14091802–14,092,813 4235 216 9.77
089 CsaV3_6G012850 Chr6:8973920–8,976,038 2826 262 9.23
090 CsaV3_5G031540 Chr5:25725825–25,732,273 1729 679 7.3
091 CsaV3_2G011050 Chr2:8296805–8,299,080 1004 496 5.5
092 CsaV3_2G013060 Chr2:10626443–10,627,763 5030 280 9.14
093 CsaV3_3G048260 Chr3:39394424–39,397,324 4187 326 4.94
094 CsaV3_1G039160 Chr1:24662874–24,666,933 2825 359 5.94
095 CsaV3_7G008580 Chr7:5322491–5,324,405 2588 254 7.22
096 CsaV3_2G029940 Chr2:19575197–19,577,442 4258 308 6.01
097 CsaV3_3G011010 Chr3:8707121–8,711,973 6448 382 5.08
098 CsaV3_3G021970 Chr3:19073471–19,076,098 2460 377 5.08
099 CsaV3_6G028530 Chr6:16812784–16,815,830 2030 207 11.79
100 CsaV3_6G037460 Chr6:21181685–21,184,516 4024 299 5.66
101 CsaV3_4G029750 Chr4:19361035–19,364,776 2871 211 9.21
102 CsaV3_6G033930 Chr6:18737868–18,742,274 1923 333 5.71
103 CsaV3_6G036240 Chr6:20141242–20,142,683 4656 97 9.18
104 CsaV3_3G012210 Chr3:9421374–9,425,037 4979 227 5.7
105 CsaV3_3G022870 Chr3:20405212–20,408,271 3243 236 6.13
106 CsaV3_3G042970 Chr3:34884792–34,886,594 1529 244 8.4
107 CsaV3_6G018830 Chr6:13512926–13,515,085 1667 253 7.06
108 CsaV3_2G030310 Chr2:19895721–19,897,132 4390 240 9.2
109 CsaV3_1G002670 Chr1:1668618–1,674,219 2118 359 8.65
110 CsaV3_3G045440 Chr3:37108680–37,112,535 1645 430 6.69
111 CsaV3_5G012430 Chr5:7900420–7,905,450 2159 451 6.33
112 CsaV3_1G011460 Chr1:7106592–7,110,120 3046 360 4.75
113 CsaV3_7G008090 Chr7:5057906–5,059,973 4406 255 6.11
114 CsaV3_5G026380 Chr5:21538651–21,541,239 4345 173 9.15
115 CsaV3_UNG229040 scaffold115:93241–95,547 1441 274 9.42
116 CsaV3_3G027730 Chr3:24067204–24,073,678 9817 529 5.88
117 CsaV3_7G003870 Chr7:2853486–2,854,424 6196 313 5.32
118 CsaV3_3G016560 Chr3:12365460–12,367,641 2831 253 8.6
119 CsaV3_1G012350 Chr1:7668571–7,671,887 2272 205 6.16
120 CsaV3_5G003430 Chr5:2204438–2,205,442 3080 256 7.75
121 CsaV3_6G047120 Chr6:27815147–27,818,761 2674 337 6.13
122 CsaV3_1G042640 Chr1:27559193–27,563,048 2452 438 7.72
123 CsaV3_3G005540 Chr3:4716554–4,722,201 1766 439 6.41
124 CsaV3_6G046660 Chr6:27537459–27,541,954 1725 357 8.44
125 CsaV3_5G003420 Chr5:2191536–2,193,265 1497 261 5.59
126 CsaV3_5G003410 Chr5:2180337–2,183,163 4495 252 7.01
127 CsaV3_6G049510 Chr6:28902722–28,905,982 3614 405 5.35
128 CsaV3_4G003860 Chr4:2368080–2,373,266 3260 357 8.51
129 CsaV3_7G031270 Chr7:19779388–19,783,470 749 420 8.28
130 CsaV3_3G039080 Chr3:32107556–32,110,621 3490 367 9.16
131 CsaV3_6G045070 Chr6:26672336–26,673,833 938 229 10.26
132 CsaV3_6G051560 Chr6:29996501–29,997,250 1571 250 5.66
133 CsaV3_7G027460 Chr7:17033739–17,042,484 2825 692 5.66
134 CsaV3_5G037950 Chr5:30085680–30,087,603 1391 92 9.09
135 CsaV3_1G002240 Chr1:1440343–1,441,301 2067 93 9.09
136 CsaV3_5G032530 Chr5:26313766–26,315,796 1914 96 9.17
137 CsaV3_1G009880 Chr1:6153304–6,155,828 4261 373 6.61
138 CsaV3_7G033460 Chr7:21082838–21,087,117 3175 298 6.78
139 CsaV3_7G007860 Chr7:4913547–4,914,938 8745 211 6.35
140 CsaV3_4G010010 Chr4:7769516–7,771,744 4296 333 5.11
141 CsaV3_1G003270 Chr1:2026829–2,032,886 4082 619 9.19
142 CsaV3_5G031750 Chr5:25868912–25,871,372 4279 365 5.84