Table 2.
Characteristic of ESBL-Eb strains detected in fish from lagoon of Bizerte.
| Isolates | Sampling | Fish species | ESBL | Resistance to non-β-lactam | Resistance genes | Phylogenetic group | Virulence factor |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EC 138 | SC | S. salpa | CTX-M-1+OXA-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrB | D | — |
| EC 155 | G | T. trachurus | CTX-M-1+OXA-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, qnrB | D | — |
| EC 159 | SC | T. trachurus | CTX-M-1+OXA-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrB | D | — |
| EC 163 | G | T. trachurus | CTX-M-1+OXA-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrB | D | — |
| EC 71 | SC | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrB | B2 | fimA |
| EC 80 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, aac(6′)ib-cr | D | fimA |
| EC 87 | SC | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrB | D | fimA |
| EC 94 | SC | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, aac(6′)ib-cr | D | — |
| EC 98 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, qnrA | B2 | fimA |
| EC 101 | SC | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, qnrA | D | fimA |
| EC 105 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, aac(6′)ib-cr | D | fimA |
| EC 109 | SC | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrA | D | — |
| EC 113 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, qnrA | D | — |
| EC 119 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, qnrA | D | — |
| EC 129 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, aac(6′)ib-cr, qnrB | D | — |
| EC 131 | G | S. salpa | CTX-M-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, qnrB | D | — |
| EC 182 | G | P. saltatrix | CTX-M-1 | TET, STR | tet A | D | — |
| EC 319 | SC | M. surmuletus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | — | A | — |
| EC 61 | SC | S. salpa | CTX-M-15 | TET, NAL, SUL | tet A, qnrA | D | fimA |
| EC 62 | G | S. salpa | CTX-M-15 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 2, aac(6′)ib-cr | D | fimA |
| EC 68 | G | S. salpa | CTX-M-15 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, qnrB | D | fimA |
| K. p 286 | SC | T. trachurus | CTX-M-1+TEM-1-a | CN, TOB, SUL | — | ||
| K. p 291 | G | T. trachurus | CTX-M-1+TEM-1-a | CN, TOB, SUL | — | ||
| K. p 282 | G | T. trachurus | CTX-M-15+TEM-1-a | CN, TOB, SUL, STR | — | ||
| K. p 135 | SC | S. salpa | CTX-M-1+OXA-1 | TET, NAL, SUL | tet A, sul 1, aac(6′)ib | ||
| K. p 206 | G | D. labrax | CTX-M-1+OXA-1 | CN, TOB | — | ||
| K. p 246 | SC | Ch. labrosus | CTX-M-1+OXA-1 | CN, TOB | — | ||
| K. p 216 | G | D. labrax | CTX-M-15+OXA-1 | CN, TOB | — | ||
| K. p 211 | SC | D. labrax | CTX-M-1 | CN, TOB | — | ||
| K. p 222 | SC | D. labrax | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | — | ||
| K. p 234 | G | Ch. labrosus | CTX-M-1 | C, CN, TOB | — | ||
| K. p 243 | G | Ch. labrosus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | sul 2 | ||
| K. p 249 | G | Ch. labrosus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | sul 2 | ||
| K. p 254 | SC | Ch. labrosus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | sul 1 | ||
| K. p 257 | G | Ch. labrosus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | — | ||
| K. p 263 | SC | T. trachurus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | — | ||
| K. p 219 | G | D. labrax | CTX-M-15 | CN, TOB | — | ||
| C342 | G | T. trachurus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | sul 2 | ||
| C66 | SC | S. salpa | CTX-M-9 | — | — | ||
| C79 | SC | S. salpa | CTX-M-9 | — | — | ||
| C225 | G | D. labrax | CTX-M-9 | SUL | sul 1 | ||
| SH278 | SC | T. trachurus | CTX-M-15+TEM-1-a | CN, TOB, SUL | — | ||
| SH260 | SC | Ch. labrosus | CTX-M-1 | CN, TOB, SUL | — | ||
| SH273 | G | T. trachurus | CTX-M-15 | CN, TOB, SUL | — | ||
| SH307 | G | M. surmuletus | CTX-M-15 | CN, TOB, SUL | — | ||
| SH315 | G | M. surmuletus | CTX-M-15 | CN, TOB | — |
SC: stomach content analysis; G: gills; EC: Escherichia coli; K. p: Klebsiella pneumoniae; CF: Citrobacter freundii; (SH): Shigella boydii; T: Thermococcus; S. salpa: Sarpa salpa; T. trachurus: Trachurus trachurus; P. saltatrix: Pomatomus saltatrix; M. surmuletus: Mullus surmuletus; D. labrax: Dicentrarchus labrax; Ch. labrosus: Chelon labrosus; TET: tetracycline; Nal: nalidixic acid; TOB: tobramycin; SUL: sulfonamide; CN: gentamicin; STR; streptomycin; C: chloramphenicol.