Skip to main content
. 2020 Jul 14;13:199–215. doi: 10.2147/PGPM.S254677

Table 3.

VIP Variants Within the Pharmacogenes in Chechen Compared to HapMap Populations

SNP ID Populations
CHE ASW CEU CHB CDX GBR GIH JPT LWK MXL TSI YRI ACB
rs3918290 0.003a 0.008a 0.005a 0.00a 0.00a 0.00a 0.146a 0.00a 0.00a 0.00a 0.005a 0.00a 0.00a
0.54b 0.13b 0.62b 0.56b 0.55b 2.3b 0.63b 0.60b 0.39b 0.09b 0.65b 0.57b
0.46c 0.71c 0.43c 0.45c 0.45c 0.13c 0.43c 0.44c 0.53c 0.75c 0.42c 0.45c
rs689466 0.11a 0.13a 0.19a 0.47a 0.52a 0.20a 0.13a 0.44a 0.03a 0.26a 0.20a 0.07a 0.10a
0.34b 6.6b N/Ab N/Ab 7.2b 0.26b N/Ab 10.9b 15.3b 7.5b 2.1b 0.1b
0.56c 0.01c N/Ac N/Ac 0.01c 0.60c N/Ac 1e-3c 1e-4c 0.01c 0.14c 0.79c
rs1805124 0.25a 0.26a 0.18a 0.12a 0.07a 0.22a 0.20a 0.13a 0.30a 0.16a 0.23a 0.32a 0.28a
0.04b 3.5b 12.5b 26.2b 0.49b 1.7b 10.9b 1.6b 4.1b 0.26b 3.7b 0.5b
0.84c 0.06c 4e-4c 3e-7c 0.48c 0.19c 1e-3c 0.21c 0.04c 0.61c 0.05c 0.47c
rs3814055 0.33a 0.29a 0.34a 0.27a 0.15a 0.40a 0.42a 0.25a 0.30a 0.33a 0.36a 0.27a 0.39a
0.62b 0.01b 2.3b 19.2b 33.2b 3.8b 3.8b 0.55b 0.001b 0.37b 2.2b 2.0b
0.42c 0.92c 0.12c 1e-5c 1e-8c 0.05c 0.05c 0.45c 0.97c 0.54c 0.13c 0.15c
rs1065776 0.01a 0.20a 0.05a 0.03a 0.02a 0.02a 0.10a 0.07a 0.21a 0.05a 0.03a 0.22a 0.20a
N/Ab 10.43b 4.3b 0.52b 1.4b 25.7b 15.7b N/Ab 6.9b 4.1b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.001c 0.04c 0.46c 0.22c 3.9e-7c 7e-5c N/Ac 0.01c 0.04c N/Ac N/Ac
rs701265 0.17a 0.67a 0.17a 0.28a 0.19a 0.13a 0.21a 0.27a 0.80a 0.20a 0.16a 0.81a 0.72a
N/Ab 0.001b 11.1b 0.42b 1.0b 1.6b 9.1b N/Ab 0.89b 0.004b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.97c 0.001c 0.51c 0.31c 0.21c 0.002c N/Ac 0.34c 0.95c N/Ac N/Ac
rs975833 0.24a 0.25a 0.24a 0.79a 0.75a 0.24a 0.49a 0.80a 0.19a 0.13a 0.27a 0.30a 0.28a
0.08b 0.001b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 1.7b 6.5b 0.6b 2.4b 0.79b
0.77c 0.97c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 0.19c 0.01c 0.43c 0.12c 0.37c
rs2066702 0.01a 0.20a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.14a 0.03a 0.00a 0.28a 0.19a
N/Ab 2.4b 2.5b 2.3b 2.2b 2.5b 2.5b N/Ab 1.9b 2.6b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.12c 0.11c 0.13c 0.14c 0.11c 0.11c N/Ac 0.16c 0.11c N/Ac N/Ac
rs1229984 0.12a 0.00a 0.02a 0.71a 0.63a 0.01a 0.02a 0.73a 0.00a 0.08a 0.05a 0.00a 0.01a
16.5b
5e-5c
19.1b
1e-5c
N/Ab
N/Ac
N/Ab
N/Ac
21.8b
3e-6c
16.0b
6e-5c
N/Ab
N/Ac
26.5b
2.6e-7c
1.3b
0.25c
7.8b
0.005c
28.8b
8e-8c
20.6b
6e-6c
rs698 0.27a 0.14a 0.47a 0.05a 0.11a 0.44a 0.28a 0.07a 0.14a 0.28a 0.31a 0.07a 0.11a
8.1b 23.7b N/Ab 16.9b 15.9b 0.14b 31.2b 11.3b 0.10b 1.1b 33.1b 18.1b
0.004c 1e-6c N/Ac 4e-5c 7e-5c 0.71c 2e-8c 0.001c 0.75c 0.29c 1e-8c 2e-5c
rs17244841 0.03a 0.10a 0.01a 0.00a 0.00a 0.03a 0.00a 0.02a 0.08a 0.04a 0.03a 0.09a 0.10a
9.8b 0.87b 5.8b 5.2b N/Ab 5.2b 0.39b 8.7b 0.38b 0.11b 10.7b 13.3b
0.002c 0.35c 0.02 0.02c N/Ac 0.02c 0.53c 0.003c 0.53c 0.74c 0.001c 3e-4c
rs3846662 0.43a 0.13a 0.57a 0.48 0.49a 0.55a 0.34a 0.47a 0.03a 0.56a 0.57a 0.04a 0.11a
N/Ab 0.04b 3.3b 2.5b 0.14b 26.1b 7.1b N/Ab 0.005b 0.008b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.83c 0.06c 0.12c 0.17c 3.2e-7c 0.008c N/Ac 0.94c 0.93c N/Ac N/Ac
rs17238540 0.03a 0.10a 0.01a 0.00a 0.00a 0.02a 0.00a 0.00a 0.09a 0.04a 0.03a 0.10a 0.09a
7.9b 1.5b 6.9b 6.3b 0.5b 6.9b 7.0b 8.0b 0.09b 0.001b 9.7b 8.5b
0.005c 0.21c 0.008c 0.01c 0.47c 0.008c 0.008c 0.004c 0.76c 0.97c 0.002c 0.003c
rs1042713 0.37a 0.54a 0.35a 0.55a 0.58a 0.42a 0.43a 0.44a 0.49a 0.48a 0.37a 0.53a 0.51a
11.3a 0.33b 15.8b 20.7b 0.96b 1.8b 2.5b 7.0b 4.1b 0.01b 13.4b 9.3b
0.001c 0.56c 7e-5c 5e-6c 0.32 0.18c 0.11c 0.008c 0.04c 0.92c 0.0002c 0.002c
rs1042714 0.31a 0.12a 0.46a 0.11a 0.10a 0.39a 0.23a 0.06a 0.21a 0.14a 0.14a 0.12a 0.16a
16.7b 12.1b 30.2b 29.3b 3.5b 4.6b N/Ab 6.3b 14.1b 3.6b 27.0b 14.6b
4e-5c 5e-4c 4e-8c 6e-8c 0.06c 0.03c N/Ac 0.01c 2e-4c 0.06c 2.1e-7c 1e-4c
rs1800888 0.003a 0.00a 0.02a 0.00a 0.00a 0.02a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.01a 0.00a 0.00a
0.36b 2.4b 0.62b 0.56b 4.3b 0.62b 0.62b 0.59b 0.38b 2.2b 0.65b 0.57b
0.54c 0.11c 0.43c 0.45c 0.04c 0.43c 0.42c 0.44c 0.53c 0.14c 0.42c 0.45c
rs2066853 0.13a 0.34a 0.09a 0.37a 0.26a 0.09a 0.12a 0.46a 0.48a 0.13a 0.09a 0.45a 0.47a
28.0b 1.5b N/Ab 14.4b 0.87b 0.11b N/Ab N/Ab 0.03b 1.02b N/Ab N/Ab
1.2e-7c 0.21c N/Ac 2e-4c 0.35c 0.73c N/Ac N/Ac 0.85c 0.31c N/Ac N/Ac
rs3815459 0.27a 0.42a 0.20a 0.71a 0.56a 0.15a 0.35a 0.80a 0.39a 0.39a 0.23a 0.33a 0.31a
9.5b 3.2b N/Ab 6.6b 8.5b 3.2b N/Ab 8.6b 7.6b 0.74b 2.8b 1.5b
0.002c 0.07c N/Ac 0.01c 0.003c 0.07c N/Ac 0.003c 0.006c 0.39c 0.09c 0.22c
rs3807375 0.63a 0.27a 0.65a 0.25a 0.26a 0.70a 0.61a 0.20a 0.20a 0.43a 0.66a 0.23a 0.26a
N/Ab 0.33b N/Ab N/Ab 3.1b 1.0b N/Ab N/Ab N/Ab 0.59b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.56c N/Ac N/Ac 0.08c 0.31c N/Ac N/Ac N/Ac 0.44c N/Ac N/Ac
rs5219 0.46a 0.14a
N/Ab
0.38a
3.2b
0.38a
3.7b
0.23a
28.7b
0.26a
19.7b
0.42a
1.1b
0.33a
9.2b
0.01a
N/Ab
0.41a
1.24b
0.29a
17.4b
0.00a
N/Ab
0.06a
N/Ab
N/Ac 0.07c 0.05c 8e-8c 1e-5c 0.29c 0.002c N/Ac 0.26c 3e-5c N/Ac N/Ac
rs4149056 0.04a 0.06a 0.15a 0.14a 0.14a 0.14a 0.02a 0.12a 0.02a 0.08a 0.21a 0.01a 0.02a
0.38b 3.0b 2.19b 2.4b 2.6b 8.5b 1.1b 7.9b 0.05b 11.0b 13.3b 7.6b
0.53c 0.08c 0.14c 0.12c 0.10c 0.004c 0.29c 0.004c 0.82c 0.001c 3e-4c 0.01c
rs7294 0.38a 0.48a 0.31a 0.04a 0.17a 0.42a 0.67a 0.09a 0.43a 0.35a 0.34a 0.51a 0.46a
N/Ab 14.5b 0.64b 0.98b 15.2b 0.02b 2.9b N/Ab 23.4b 10.7b N/Ab N/Ab
N/Ac 1e-4c 0.42c 0.32c 1e-4c 0.89c 0.09c N/Ac 1e-6c 0.001c N/Ac N/Ac
rs9934438 0.41a 0.15a 0.43a 0.96a 0.82a 0.36a 0.17a 0.90a 0.04a 0.47a 0.48a 0.03a 0.06a
27.3b 0.19b N/Ab N/Ab 1.4b 32.2b N/Ab N/Ab 1.3b 2.4b N/Ab N/Ab
1.7e-7c 0.65c N/Ac N/Ac 0.24c 1e-8c N/Ac N/Ac 0.25c 0.12c N/Ac N/Ac
rs12659 0.49a 0.40a 0.42a 0.49a 0.53a 0.39a 0.36a 0.54a 0.53a 0.34a 0.44a 0.48a 0.55a
2.8b 2.5b 0.02b 0.81b 4.8b 8.3b 1.4b 0.77b 8.1b 1.2b 0.05b 1.8b
0.09c 0.10c 0.90c 0.37c 0.03c 0.004c 0.23c 0.38c 0.004c 0.28c 0.83c 0.18c
rs1051266 0.48a 0.43a 0.57a 0.52a 0.46a 0.60a 0.60a 0.46a 0.31a 0.65a 0.55a 0.33a 0.31a
0.79b 3.9b 0.92b 0.17b 4.6b 7.9b 0.31b 15.2b 10.3b 2.5b 12.4b 14.1b
0.37c 0.05c 0.33c 0.68c 0.01c 0.005c 0.58c 1e-4c 0.001c 0.11c 4e-4c 2e-4c
rs1131596 0.47a 0.38a 0.57a 0.52a 0.46a 0.60a 0.61a 0.46a 0.24a 0.65a 0.55a 0.28a 0.28a
3.1b 5.1b 1.5b 0.03b 7.8b 9.6b 0.09b 28.3b 11.8b 3.5b 201b 19.0b
0.08c 0.02c 0.22c 0.87c 0.005c 0.001c 0.77c 1.1e-7c 0.001c 0.06c 1e-5c 1e-5c
rs4124874 0.44a 0.22a 0.57a 0.72a 0.55a 0.62a 0.39a 0.69a 0.11a 0.48a 0.56a 0.09a 0.22a
47.3b 7.8b 42.7b 5.6b 15.4b 1.1b 31.5b 63.9b 0.74b 7.04b 74.6b 0.9b
N/Ac 0.005c N/AC 0.02c 9e−5 c 0.28c 2e−8 c N/Ac 0.38c 008e−3 c N/A c 0.3c
rs10929302 0.35a 0.33a 0.30a 0.11a 0.15a 0.23a 0.44a 0.18a 0.36a 0.34a 0.24a 0.64a 0.30a
0.183b 0.95b 37.5b 23.4b 7.7b 4.1b 18.5b 0.05 b 0.01b 7.7b 0.08b 0.9b
0.67c 0.33c N/Ac 2e−6 c 5e−3 c 0.04c 2e−5 c 0.83c 0.91c 6e−3 c 0.78c 0.32c
rs4148323 0.0a 0.01a 0.0a 0.23a 0.10a 0.0a 0.02a 0.13a 0.0a 0.02a 0.0a 0.0a 0.0a
2.7b N/Ab 82.9b 35.2b N/Ab 6.4b 45.3b N/Ab 7.8b N/Ab N/Ab N/Ab
0.09c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 0.01c N/Ac N/Ab 5e−3 c N/Ac N/Ac N/Ac
rs4680 0.50a 0.27a 0.46a 0.31a 0.26a 0.52a 0.43a 0.28a 0.28a 0.39a 0.45a 0.30a 0.36a
19.0b 0.6b 17.6b 26.1b 0.3b 2.0b 24.5b 22.8b 3.8b 1.1b 20.2b 15.4b
1e−5 c 0.43c 3e-5 c 3.1e-7 c 0.55c 0.15c 7.2e-7 c 1e-6c 0.05c 0.28c 6e-6 c 8e-5 c
rs1695 0.30a 0.45a
10.2b
0.39a
5.1b
0.18a
8.6b
0.22a
3.6b
0.31a
0.2b
0.31a
0.01b
0.10a
28.7b
0.51a
23.7b
0.56a
27.6b
0.29a
23.7b
0.39a
5.8b
0.43a
10.3b
0.001c 0.02c 0.003c 0.05c 0.62c 0.76c 8e-8 c 1e-6 c 1.5e-7c 1e-6 c 0.01c 0.001c
rs1138272 0.10a 0.00a 0.09a 0.00a 0.00a 0.05a 0.08a 0.00a 0.01a 0.05a 0.05a 0.00a 0.001a
6.4b N/A 21.1b 19.1b 2.6b 0.2b N/Ab 13.2b 2.07b 3.6b 22.1b 17.1b
0.01c N/A 4e-6c 1e-5c 0.1c 0.58c N/Ac 3e-4c 0.15c 0.05c 2e-6c 3e-5c
rs890293 0.07a 0.16a 0.05a 0.04a 0.02a 0.05a 0.05a 0.02a 0.14a 0.03a 0.05a 0.15a 0.10a
10.1b 0.5b 1.2b 6.5b 0.6b 0.4b 4.8b 7.3b 2.1b 0.5b 10.8b 2.3b
0.001c 0.46c 0.27C 0.01c 0.44 c 0.54c 0.02 c 0.007c 0.14c 0.47 c 0.001 c 0.12c
rs10264272 0.0a 0.05a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.00a 0.0a 0.24a 0.02a 0.01a 0.17a 0.11a
16.5b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 7.8b 1.6b N/Ab N/Ab
5e−5 c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 0.005c 0.21c N/Ac N/Ac
rs776746 0.03a 0.68a 0.04a 0.31a 0.31a 0.05a 0.28a 0.25a 0.88a 0.23a 0.05a 0.83a 0.75a
N/Ab 0.4b N/Ab N/Ab 1.9b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 1.5b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.52c N/Ac N/Ac 0.16c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 0.21c N/Ac N/Ac
rs4986913 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.005a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a
N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 1.6b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab
N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 0.20c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac
rs4986910 0.0a 0.0a 0.01a 0.0a 0.0a 0.01a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a
N/Ab 3.6b N/Ab N/Ab 3.6b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab
N/Ac 0.06c N/Ac N/Ac 0.06c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac
rs2740574 0.004a 0.67a 0.02a 0.0a 0.0a 0.03a 0.08a 0.0a 0.83a 0.07a 0.03a 0.76a 0.66a
N/Ab 2.4b 0.6b 0.6b 7.8b 23.2b 0.6b N/Ab 19.7b 6.4b N/Ab N/Ab
N/Ac 0.12c 0.43c 0.45c 0.005c 1.4e-6b 0.43c N/Ac 1e-5c 0.01c N/Ac N/Ac
rs4986893 0.0a 0.0a 0.0a 0.04a 0.07a 0.0a 0.0a 0.07a 0.01a 0.0a 0.0a 0.0a 0.005a
N/Ab N/Ab 14.7b 25.6b N/Ab N/Ab 30.8b 3.4b N/Ab N/Ab N/Ab 1.7b
N/Ac N/Ac 1.4e-4c 4e-7c N/Ac N/Ac 3e-8c 0.07c N/Ac N/Ac N/Ac 0.19c
rs4244285 0.09a 0.14a 0.13a 0.33a 0.26a 0.14a 0.33a 0.32a 0.21a 0.12a 0.09a 0.17a 0.15a
2.3b 2.2b N/Ab 27.6b 3.3b N/Ab N/Ab 15.7b 1.2b 0.02b 7.2b 4.5b
0.12c 0.13c N/Ac 1.5e-7c 0.07c N/Ac N/Ac 8e-5c 0.27c 0.9c 0.007c 0.03c
rs1799853 0.02a 0.04a 0.15a 0.0a 0.0a 0.08a 0.05a 0.0a 0.0a 0.10a 0.15a 0.0a 0.03a
0.9b 30.3b 5.0b 4.5b 10.7b 2.3b 5.1b 4.8b 12.7b 31.7b 5.2b 0.02b
0.34c 4e-8c 0.02c 0.03c 0.001c 0.12c 0.02c 0.02c 4e-4c 2e-8c 0.02c 0.89c
rs28399454 0.0a 0.07a
24.9b
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.06a
18.8b
0.0a
N/Ab
0.0a
N/Ab
0.13a
N/Ab
0.15a
N/Ab
5.8e-7c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 1e-5c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac
rs1801272 0.0a 0.01a 0.04a 0.0a 0.0a 0.03a 0.01a 0.0a 0.0a 0.0a 0.05a 0.0a 0.0a
2.7b 11.8b N/Ab N/Ab 9.2b 3.2b N/Ab N/Ab N/Ab 15.8b N/Ab N/Ab
0.09c 6e-4c N/Ac N/Ac 0.002c 0.07c N/Ac N/Ac N/Ac 7e-5c N/Ac N/Ac
rs28399433 0.09a 0.06a 0.05a 0.27a 0.18a 0.04a 0.19a 0.28a 0.09a 0.10a 0.06a 0.10a 0.06a
0.2b 3.0b 28.7b 8.0b 3.9b 10.5b 32.2b 0.002b 0.1b 1.2b 0.1b 1.4b
0.64c 0.08c 8e-8c 0.01c 0.04c 0.001c 1e-8c 0.96c 0.75c 0.27c 0.70c 0.23c
rs3745274 0.31a 0.35a 0.28a 0.27a 0.33a 0.23a 0.23a 0.22a 0.36a 0.31a 0.30a 0.40a 0.38a
0.05b 0.6b 15.5b 0.1b 3.8b 4.6b 5.3b 1.2b N/Ab 0.04b 4.7b 2.5b
0.82c 0.40c 8.4e-5c 0.71c 0.05c 0.03c 0.02c 0.27c N/Ac 0.83c 0.03c 0.11c
rs28399499 0.0a 0.1a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.06a 0.08a 0.0a 0.12a 0.05a
33.5b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 20.6b 2.5b N/Ab N/Ab 32.2b
1e-8c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 6e-6c 0.11c N/Ac N/Ac 1e-8c
rs59421388 0.0a 0.04a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.09a 0.0a 0.0a 0.11a 0.08a
13.7b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab
2e-4c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac
rs28371725 0.14a 0.02a 0.12a 0.03a 0.08a 0.07a 0.15a 0.01a 0.03a 0.02a 0.14a 0.01a 0.05a
14.8b 0.5b 16.8b 4.4b 5.9b 0.002b 30.1b 17.6b 15.8b N/Ab 28.7b 11.8b
1e-4c 0.46c 4e-5c 0.03c 0.01c 0.96c 4e-8c 3e-5c 7e-5c N/Ac 8e-8c 6e-4c
rs61736512 0.0a 0.04a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.17a 0.0a 0.0a 0.11a 0.09a
13.7b N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab 32.2b
2e-4c N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac 1e-8c
rs28371706 0.0a 0.15a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.0a 0.19a 0.0a 0.0a 0.25a 0.20a
N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab N/Ab
N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac N/Ac
rs5030656 0.0a 0.01a 0.02a 0.0a 0.0a 0.04a 0.0a 0.0a 0.0a 0.01a 0.01a 0.0a 0.0a
2.7b 6.8b N/Ab N/Ab 13.0b N/Ab N/Ab N/Ab 2.6b 11.0b N/Ab N/Ab
0.99c 0.01c N/Ac N/Ac 3e-4c N/Ac N/Ac N/Ac 0.11c 0.001c N/Ac N/Ac

Notes: aMinor allele frequency, bChi-square value, cp-value, when p-value < 0.05 is considered a significant difference. CHE: Chechens from Jordan, ASW: African ancestry in Southwest USA, CEU: Utah, USA residents with Northern and Western European ancestry from the CEPH collection, CHB: Han Chinese in Beijing, China, CDX: Chinese Dai in Xishuangbanna, China, GIH: Gujarati Indians in Houston, Texas, USA, GBR: British in England and Scotland, JPT: Japanese in Tokyo, Japan, LWK: Luhya in Webuye, Kenya, MXL: Mexican ancestry in Los Angeles, California, USA, TSI: Toscani in Italy, YRI: Yoruba in Ibadan, Nigeria, ACB; African Caribbeans in Barbados.

Abbreviation: N/A, not applicable.