Table 6.
Primer sequences used in real-time qPCR.
Gene | Forward primer | Reverse primer |
---|---|---|
COX1 | 5′-atcctaccaggcttcggaat-3′ | 5′-cggaggtgaaatatgctcgt-3′ |
ND4 | 5′-cctgactcctacccctcaca-3′ | 5′-atcgggtgatgatagccaag-3′ |
ATP6 | 5′-gccctagcccacttcttacc-3′ | 5′-gcgtttccaattaggtgcat-3′ |
APP | 5′-cacagagagaaccaccagca-3′ | 5′-acatccgccgtaaaagaatg-3′ |
VAV3 | 5′-ctgcatttctggctgttcaa-3′ | 5′-ctgggaagaacagctcttgg-3′ |
ADM2 | 5′-gctaagcgcttcagagagga-3′ | 5′-gttgtgcatgagagcaggaa-3′ |
KLF11 | 5′-tctttttggaatcggacctg-3′ | 5′-gcccagtggctcatgttact-3′ |
PACS2 | 5′-caagaaagcgaaggacaagg-3′ | 5′-gccagctggaagaacttgac-3′ |
CIDEC | 5′-gccttctctaccccaagtcc-3′ | 5′-caggaagaagggcttgtctg-3′ |
HIP1R | 5′-ccaggaactgaaacccaaga-3′ | 5′-tcatcaggtctgtgcaggag-3′ |
RASSF4 | 5′-caccgttgtgatgtcagtcc-3′ | 5′-ctgctcctgaccaggcttac-3′ |
STK10 | 5′-accccaactgtgcctgatag-3′ | 5′-ttcgcaaacaggagaggact-3′ |
SNCAIP | 5′-cgcaaaacgaagacagatca-3′ | 5′-tgctgtgaggctacgtgaac-3′ |
SPON2 | 5′-acggtgaccgagataacgtc-3′ | 5′-ggaactgaggcgctgtctac-3′ |
GPNMB | 5′-actggcctgtttgtttccac-3′ | 5′-tcctggggtgtttgaatcat-3′ |
MGP | 5′-cacgagctcaatagggaagc-3′ | 5′-gctgctacagggggatacaa-3′ |
KRT15 | 5′-gagaactcactggccgagac-3′ | 5′-ctgaagaggcttccctgatg-3′ |
GPM6B | 5′-cgaaattgacgctgacaaga-3′ | 5′-atggctggcttcataccatc-3′ |
JADE2 | 5′-gttcattgcacacacccaag-3′ | 5′-acgttttccatgctggtttc-3′ |
PLXNA1 | 5′-gacagacatccacgagctga-3′ | 5′-tcagcgacttctccacattg-3′ |
EPCAM | 5′-gctggtgtgtgaacactgct-3′ | 5′-acgcgttgtgatctccttct-3′ |
KCNAB2 | 5′-tggtcatgtgctcctagctg-3′ | 5′-agtcatgggcacagaaaacc-3′ |
KRT13 | 5′-gtcttcagcacccagaggag-3′ | 5′-ttgcagaaaggcaggaaact-3′ |
ULK1 | 5′-cagaactaccagcgcattga-3′ | 5′-tccacccagagacatcttcc-3′ |
HAPLN2 | 5′-ctgctacgccgagaattagg-3′ | 5′-gagggtcacctctgcatctc-3′ |
LBH | 5′-agtggtggaacccacagaag-3′ | 5′-acaattgcggctcactctct-3′ |
EDN2 | 5′-agctctgctggaagaactgc-3′ | 5′-aagaactctggggagggaaa-3′ |
IGFBP7 | 5′-aagtaactggctgggtgctg-3′ | 5′-tatagctcggcaccttcacc-3′ |
EFEMP1 | 5′-caggacaccgaagaaaccat-3′ | 5′-gtttcctgctgaggctgttc-3′ |
NUB1 | 5′-ttggcattaaaggaccttgc-3′ | 5′-caatcgggtctccaacaagt-3′ |
CNN2 | 5′-ggcaaggacagtggagagag-3′ | 5′-gcttagccccaacaactcag-3′ |
PADI2 | 5′-gctcttccgagagaagcaga-3′ | 5′-tctgtcagtcccagctcctt-3′ |
RIMS3 | 5′-gggctacccataccctcatt-3′ | 5′-atagtggagtggcccaactg-3′ |
HMOX1 | 5′-tccgatgggtccttacactc-3′ | 5′-taaggaagccagccaagaga-3′ |
KLF5 | 5′-cccttgcacatacacaatgc-3′ | 5′-agttaactggcagggtggtg-3′ |
VEGFA | 5′-cccactgaggagtccaacat-3′ | 5′-tttcttgcgctttcgttttt-3′ |
CXCL8 | 5′-tagcaaaattgaggccaagg-3′ | 5′-aaaccaaggcacagtggaac-3′ |
NFKB1A | 5′-gcaaaatcctgacctggtgt-3′ | 5′-gctcgtcctctgtgaactcc-3′ |
PIM3 | 5′-gcacacacaatgcaagtcct-3′ | 5′-agaggcagactgctcagagg-3′ |
JMY | 5′-ctctcccaggtgctcttcac-3′ | 5′-agctccaccatgctctctgt-3′ |
UACA | 5′-gcaatgcgaactttctgtga-3′ | 5′-aagggcaagaaaatgggtct-3′ |
CHAC1 | 5′-ggtggctacgataccaagga-3′ | 5′-ccagacgcagcaagtattca-3′ |
SPIRE1 | 5′-ctccaaaattcctgcccata-3′ | 5′-taagagcgaggcattccact-3′ |
KRT19 | 5′-tttgagacggaacaggctct-3′ | 5′-aatccacctccacactgacc-3′ |
SPRR2A | 5′-tatttggctcacctcgttcc-3′ | 5′-ccaggacttcctttgctcag-3′ |
RBM47 | 5′-cgcacttctgagtccaaaca-3′ | 5′-agccaccagctcctctatca-3′ |
ZBTB1 | 5′-cagctccctccagttttgag-3′ | 5′-ttgaacttggctctgcacac-3′ |
MAPK81P2 | 5′-agtttcgagggtttccctgt-3′ | 5′-gacgaaggctcctgtgagtc-3′ |
NOVA1 | 5′-caccccactcctgaaacagt-3′ | 5′-atgtgatgggaagctggaag-3′ |
FTL | 5′-agaagatgggtgaccacctg-3′ | 5′-catttggtccaaggcttgtt-3′ |
FTH1 | 5′-tgacaaaaatgacccccatt-3′ | 5′-cagggtgtgcttgtcaaaga-3′ |
AMPD3 | 5′-acatcctggctctcatcacc-3′ | 5′-cagcagatgcttttggttca-3′ |
MBNL2 | 5′-gagcttcataccccaccaaa-3′ | 5′-ggcaactggatggtgagttt-3′ |
GAPDH | 5′-ctctgctcctcctgttcgac-3′ | 5′-acgaccaaatccgttgactc-3′ |
GAPDH gene was used as an internal control.