TABLE 4.

Codon content of amino acid and stop codon of 8 species.

		C. sichuanensis	A. compactum	A. oxyphylla	W. villosa	Z. officinale	K. galanga	S. involucratus	L. tsaoko
Amino acid	Codon				RSCUa
Ala	GCA	1.31	1.29	1.29	1.29	1.25	1.29	1.32	1.29
Ala	GCC	0.56	0.54	0.55	0.55	0.58	0.56	0.55	0.56
Ala	GCG	0.32	0.34	0.31	0.34	0.32	0.32	0.32	0.33
Ala	GCU	1.81	1.83	1.85	1.83	1.86	1.83	1.81	1.82
Cys	UGC	0.54	0.55	0.53	0.55	0.5	0.54	0.56	0.55
Cys	UGU	1.45	1.45	1.47	1.45	1.5	1.46	1.44	1.45
Asp	GAC	0.35	0.37	0.38	0.37	0.36	0.37	0.36	0.38
Asp	GAU	1.65	1.63	1.62	1.63	1.64	1.63	1.64	1.62
Glu	GAA	1.49	1.5	1.52	1.5	1.49	1.51	1.5	1.51
Glu	GAG	0.51	0.5	0.48	0.5	0.51	0.49	0.51	0.49
Phe	UUC	0.71	0.7	0.68	0.71	0.71	0.69	0.71	0.7
Phe	UUU	1.29	1.3	1.32	1.29	1.29	1.31	1.29	1.3
Gly	GGA	1.59	1.61	1.6	1.59	1.59	1.6	1.6	1.59
Gly	GGC	0.34	0.33	0.33	0.34	0.36	0.36	0.34	0.34
Gly	GGG	0.67	0.65	0.63	0.67	0.61	0.62	0.67	0.68
Gly	GGU	1.4	1.41	1.44	1.4	1.43	1.42	1.39	1.39
His	CAC	0.43	0.42	0.41	0.42	0.45	0.44	0.44	0.43
His	CAU	1.57	1.58	1.59	1.58	1.55	1.56	1.56	1.57
Ile	AUA	0.97	0.96	0.98	0.97	0.96	0.98	0.97	0.99
Ile	AUC	0.55	0.55	0.53	0.55	0.53	0.53	0.56	0.54
Ile	AUU	1.48	1.48	1.49	1.48	1.51	1.49	1.47	1.48
Lys	AAA	1.47	1.47	1.47	1.47	1.5	1.5	1.47	1.43
Lys	AAG	0.53	0.53	0.53	0.53	0.5	0.5	0.53	0.57
Leu	CUA	0.8	0.79	0.8	0.8	0.76	0.8	0.8	0.84
Leu	CUC	0.41	0.41	0.41	0.41	0.4	0.39	0.4	0.4
Leu	CUG	0.38	0.38	0.36	0.37	0.37	0.36	0.4	0.38
Leu	CUU	1.24	1.24	1.24	1.26	1.23	1.23	1.24	1.27
Leu	UUA	1.86	1.89	1.93	1.88	1.94	1.95	1.84	1.83
Leu	UUG	1.31	1.3	1.26	1.29	1.3	1.25	1.31	1.28
Met	AUG	1	1	1	1	1	1	1	1
Asn	AAC	0.47	0.46	0.46	0.46	0.45	0.47	0.48	0.48
Asn	AAU	1.53	1.54	1.54	1.54	1.55	1.53	1.52	1.52
Pro	CCA	1.18	1.2	1.19	1.18	1.18	1.15	1.18	1.19
Pro	CCC	0.73	0.75	0.77	0.74	0.77	0.76	0.73	0.73
Pro	CCG	0.48	0.47	0.44	0.47	0.48	0.49	0.48	0.48
Pro	CCU	1.62	1.58	1.6	1.6	1.57	1.6	1.61	1.59
Gln	CAA	1.52	1.51	1.52	1.51	1.51	1.52	1.52	1.52
Gln	CAG	0.48	0.49	0.48	0.49	0.49	0.48	0.48	0.48
Arg	AGA	1.9	1.88	1.89	1.9	1.94	1.88	1.87	1.93
Arg	AGG	0.75	0.74	0.7	0.73	0.71	0.7	0.78	0.75
Arg	CGA	1.25	1.27	1.27	1.27	1.24	1.29	1.24	1.24
Arg	CGC	0.35	0.34	0.33	0.34	0.34	0.35	0.34	0.35
Arg	CGG	0.46	0.47	0.42	0.47	0.41	0.42	0.47	0.45
Arg	CGU	1.3	1.3	1.38	1.28	1.36	1.36	1.3	1.28
Ser	AGC	0.35	0.35	0.36	0.35	0.35	0.35	0.36	0.36
Ser	AGU	1.23	1.22	1.3	1.22	1.34	1.31	1.22	1.2
Ser	UCA	1.18	1.15	1.15	1.16	1.16	1.17	1.17	1.19
Ser	UCC	0.99	0.99	0.95	0.97	0.97	0.95	1	0.97
Ser	UCG	0.55	0.58	0.54	0.57	0.54	0.53	0.56	0.59
Ser	UCU	1.69	1.71	1.7	1.72	1.64	1.69	1.69	1.7
Thr	ACA	1.28	1.28	1.28	1.28	1.25	1.29	1.27	1.28
Thr	ACC	0.72	0.69	0.69	0.7	0.67	0.69	0.71	0.7
Thr	ACG	0.47	0.46	0.45	0.47	0.43	0.44	0.46	0.46
Thr	ACU	1.54	1.58	1.58	1.55	1.64	1.58	1.56	1.57
Val	GUA	1.48	1.51	1.49	1.49	1.5	1.48	1.5	1.47
Val	GUC	0.49	0.49	0.45	0.49	0.48	0.47	0.5	0.48
Val	GUG	0.57	0.55	0.57	0.57	0.56	0.56	0.57	0.58
Val	GUU	1.46	1.45	1.49	1.45	1.46	1.49	1.44	1.46
Trp	UGG	1	1	1	1	1	1	1	1
Tyr	UAC	0.44	0.43	0.43	0.43	0.43	0.44	0.43	0.44
Tyr	UAU	1.56	1.57	1.57	1.57	1.57	1.56	1.57	1.56
Stop*	UAA	1.28	1.23	1.3	1.28	1.43	1.33	1.26	1.22
Stop*	UAG	0.91	0.94	0.91	0.93	0.83	0.92	0.9	1
Stop*	UGA	0.81	0.83	0.79	0.8	0.75	0.76	0.83	0.78

^aRelative synonymous codon usage; * Stop codon.