Skip to main content
. 2020 Apr 27;51(3):1279–1287. doi: 10.1007/s42770-020-00262-9

Table 2.

The oligonucleotides used for determination of the presence of the bacteriocin encoding gene (Omar et al. [26])

Plantaricin coding genes Primer Amplicon size (bp) Annealing temp. (°C)
plnA

F: GTA CAG TAC TAA TGG GAG

R: CTT ACG CCA ATC TAT ACG

450 53
plnB

F: TTC AGA GCA AGC CTA AAT GAC

R: GCC ACT GTA ACA CCA TGA C

165 51.5
plnC

F: AGC AGA TGA AAT TCG GCA G

R: ATA ATC CAA CGG TGC AAT CC

108 49.5
plnD

F: TGA GGA CAA ACA GAC TGG AC

R: GCA TCG GAA AAA TTG CGG ATA C

414 53
plnEF

F: GGC ATA GTT AAA ATT CCC CCC

R: CAG GTT GCC GCA AAA AAA G

428 53.2
plnI

F: CTC GAC GGT GAA ATT AGG TGT AAG

R: CGT TTA TCC TAT CCT CTA AGC ATT GG

450 52.5
plnj

F: TAA CGA CGG ATT GCT CTG 51475

R: AAT CAA GGA ATT ATC ACA TTA GTC

475 51
plnk

F: CTG TAA GCA TTG CTA ACC AAT C

R: ACT GCT GAC GCT GAA AAG

246 52.9
plnG

F: TGC GGT TAT CAG TAT GTC AAA G

R: CCT CGA AAC AAT TTC CCC C

453 52.8
plnN

F: ATT GCC GGG TTA GGT ATC G

R: CCT AAA CCA TGC CAT GCA C

146 51.9
plnNC8

F: GGTCTGCGTATAAGCATCGC

R:AAATTGAACATATGGGTGCTTTAAATTCC

207 60
plnS

F:GCCTTACCAGCGTAATGCCC

R:CTGGTGATGCAATCGTTAGTTT

320 60
plnW

F:TCACACGAAATATTCCA

R:GGCAAGCGTAAGAAATAAATGAG

165 55