Table 1.

Details of three two-locus disease models.

MAF		0.05				0.10				0.20				0.50
	AA	Aa	aa		AA	Aa	aa		AA	Aa	aa		AA	Aa	aa
Model 1 (P(D) = 0.1, h2 = 0.005)
BB	0.098	0.098	0.098	BB	0.096	0.096	0.096	BB	0.092	0.092	0.092	BB	0.078	0.078	0.078
Bb	0.098	0.299	0.522	Bb	0.096	0.197	0.282	Bb	0.092	0.145	0.181	Bb	0.078	0.105	0.122
bb	0.098	0.522	0.912	Bb	0.096	0.282	0.408	Bb	0.092	0.181	0.227	Bb	0.078	0.122	0.142
Model 2 (P(D) = 0.1, h2 = 0.02)
BB	0.096	0.096	0.096	BB	0.092	0.092	0.092	BB	0.084	0.084	0.084	BB	0.052	0.052	0.052
Bb	0.096	0.533	0.533	Bb	0.092	0.319	0.319	Bb	0.084	0.210	0.210	Bb	0.052	0.138	0.138
bb	0.096	0.533	0.533	Bb	0.092	0.319	0.319	Bb	0.084	0.210	0.210	Bb	0.052	0.138	0.138
Model 3 (P(D) = 0.1, h2 = 0.02)
BB	0.080	0.192	0.192	BB	0.072	0.164	0.164	BB	0.061	0.146	0.146	BB	0.067	0.155	0.155
Bb	0.192	0.080	0.080	Bb	0.164	0.072	0.072	Bb	0.146	0.061	0.061	Bb	0.155	0.067	0.067
bb	0.192	0.080	0.080	Bb	0.164	0.072	0.072	Bb	0.146	0.061	0.061	Bb	0.155	0.067	0.067