Table 2. The non-synonymous (Ka) and synonymous substitution rate (Ks) for orthologous CCD gene pairs between B. napus and A. thaliana.

Orthologous gene pairs		Ka	Ks	Ka/Ks	Duplication date (MYA)
AtCCD1	BnCCD1a	0.08151	0.36209	0.22510	12.07
AtCCD1	BnCCD1b	0.04122	0.32012	0.12875	10.67
AtCCD1	BnCCD1c	0.03384	0.28852	0.11730	9.62
AtCCD1	BnCCD1d	0.05913	0.38774	0.15250	12.92
AtCCD1	BnCCD1e	0.07611	0.35530	0.21422	11.84
AtNCED2	BnNCED2a	0.06843	0.46502	0.14716	15.50
AtNCED2	BnNCED2b	0.04285	0.41304	0.10374	13.77
AtNCED2	BnNCED2c	0.06108	0.47780	0.12784	15.93
AtNCED2	BnNCED2d	0.04606	0.43371	0.10620	14.46
AtNCED3	BnNCED3a	0.04945	0.56001	0.08829	18.67
AtNCED3	BnNCED3b	0.05042	0.55742	0.09045	18.58
AtNCED3	BnNCED3c	0.05052	0.51718	0.09768	17.24
AtNCED3	BnNCED3d	0.04962	0.52187	0.09509	17.40
AtNCED3	BnNCED3e	0.05472	0.45159	0.12116	15.05
AtNCED3	BnNCED3f	0.05271	0.58288	0.09043	19.43
AtNCED3	BnNCED3g	0.04581	0.51353	0.08921	17.12
AtNCED3	BnNCED3h	0.05693	0.55439	0.10268	18.48
AtCCD4	BnCCD4a	0.07819	0.59005	0.13252	19.67
AtCCD4	BnCCD4b	0.06912	0.50381	0.13720	16.79
AtCCD4	BnCCD4c	0.07461	0.60924	0.12246	20.31
AtNCED5	BnNCED5a	0.04001	0.38163	0.10484	12.72
AtNCED5	BnNCED5b	0.03847	0.40056	0.09605	13.35
AtNCED6	BnNCED6a	0.08570	0.57248	0.14970	19.08
AtNCED6	BnNCED6b	0.09078	0.57371	0.15824	19.12
AtCCD7	BnCCD7a	0.07106	0.45309	0.15683	15.10
AtCCD7	BnCCD7b	0.07166	0.42570	0.16834	14.19
AtCCD8	BnCCD8a	0.05711	0.42701	0.13374	14.23
AtCCD8	BnCCD8b	0.09405	0.49007	0.19191	16.34
AtNCED9	BnNCED9a	0.07262	0.61567	0.11796	20.52
AtNCED9	BnNCED9b	0.06799	0.65433	0.10391	21.81