Krankheit/Funktionsstörung	Applizierte Probiotika
– Darminfektionen – Darmentzündungen – Akute virale Gastroenteritis – Akute bakterielle Gastroenteritis – Antibiotikaassoziierte Diarrhö – Reisediarrhö	– Laktobazillen – Bifidobakterien – Escherichia coli Nissle – Streptococcus thermophilus – Saccharomyces boulardii
Infektionen der oberen Atemwege (Otitis media, Tonsillitis)	Streptokokken, Laktobazillen
Neugeborenensepsis, nekrotisierende Enterokolitis	Bifidobakterien, Laktobazillen
Neurodermitis, Allergien (Prävention und Therapie)	Laktobazillen
Chronisch-entzündliche Darmerkrankungen, Pouchitis	Laktobazillen, Escherichia coli Nissle 1917, VSL#3 (Mischung aus verschiedenen Milchsäurebakterien)
Reizdarmsyndrom („irritable bowel syndrome“)	Laktobazillen, VSL#3
Chronische Bauchschmerzen	Lactobacillus plantarum
Laktoseintoleranz, Laktasemangel	Bifidobakterien, Lactobacillus bulgaricus, Streptococcus thermophilus
Vaginitis (durch Candida spp.)	Lactobacillus acidophilus
Karies	Laktobazillen