Table 4.

Genotyping error rate of six bi-parental populations.

Pop	Line	All loci		Homozygous loci		Heterozygous loci
		Unimputed (%)	Imputed (%)	Unimputed (%)	Imputed (%)	Unimputed (%)	Imputed (%)
Pop3	DTPC9F104	0.85	0.57	0.30	0.05	0.55	0.52
	CML491	0.87	0.31	0.25	0.12	0.62	0.19
	F1	8.21	10.42	3.38	0.68	4.83	9.74
Pop4	CKL09001	0.82	0.25	0.27	0.11	0.55	0.14
	CML444	0.67	0.18	0.18	0.08	0.49	0.10
Pop5	CLWN201	0.85	0.39	0.14	0.04	0.71	0.35
	CML494	0.61	0.33	0.09	0.07	0.52	0.26
	F1	7.97	5.74	2.43	0.38	5.54	5.36
Pop6	LPSC7F64	0.63	0.46	0.07	0.08	0.56	0.38
	CML495	1.06	0.74	0.17	0.09	0.89	0.65
Pop7	B73	0.56	0.38	0.16	0.19	0.40	0.19
	CML247	0.51	0.38	0.06	0.06	0.45	0.32
Pop8	B73	0.56	0.38	0.16	0.19	0.40	0.19
	Mo17	0.53	0.35	0.10	0.13	0.43	0.22
Average	Total	1.76	1.49	0.55	0.16	1.21	1.33
	Parents	0.70	0.45	0.16	0.11	0.54	0.33
	F1	8.09	8.08	2.91	0.53	5.19	7.55