Table 2.
Predicted CTL epitopes for A3 super type obtained from NetCTL 1.2 server.
| S. No. | SARS-CoV-2 protein | Position | Allele supertype | CTL epitopes | Score |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Spike Glycoprotein | 30 | A3 | NSFTRGVYY | 0.9914 |
| 41 | A3 | KVFRSSVLH | 1.3419 | ||
| 69 | A3 | HVSGTNGTK | 1.1575 | ||
| 89 | A3 | GVYFASTEK | 1.4615 | ||
| 142 | A3 | GVYYHKNNK | 1.3335 | ||
| 162 | A3 | SANNCTFEY | 0.8377 | ||
| 187 | A3 | KNLREFVFK | 0.7504 | ||
| 270 | A3 | LQPRTFLLK | 1.0511 | ||
| 296 | A3 | LSETKCTLK | 0.8213 | ||
| 302 | A3 | TLKSFTVEK | 1.3483 | ||
| 311 | A3 | GIYQTSNFR | 1.1119 | ||
| 349 | A3 | SVYAWNRKR | 1.1423 | ||
| 357 | A3 | RISNCVADY | 1.1734 | ||
| 361 | A3 | CVADYSVLY | 1.1344 | ||
| 370 | A3 | NSASFSTFK | 1.3454 | ||
| 372 | A3 | ASFSTFKCY | 0.8899 | ||
| 378 | A3 | KCYGVSPTK | 1.2722 | ||
| 409 | A3 | QIAPGQTGK | 1.0483 | ||
| 454 | A3 | RLFRKSNLK | 1.7563 | ||
| 458 | A3 | KSNLKPFER | 0.9792 | ||
| 529 | A3 | KSTNLVKNK | 0.9809 | ||
| 550 | A3 | GVLTESNKK | 0.9827 | ||
| 559 | A3 | FLPFQQFGR | 0.8186 | ||
| 604 | A3 | TSNQVAVLY | 1.1959 | ||
| 725 | A3 | EILPVSMTK | 1.2271 | ||
| 733 | A3 | KTSVDCTMY | 0.8544 | ||
| 757 | A3 | GSFCTQLNR | 1.0783 | ||
| 787 | A3 | QIYKTPPIK | 1.4526 | ||
| 817 | A3 | FIEDLLFNK | 0.8027 | ||
| 827 | A3 | TLADAGFIK | 1.2451 | ||
| 925 | A3 | NQFNSAIGK | 1.0796 | ||
| 939 | A3 | SSTASALGK | 1.0678 | ||
| 956 | A3 | AQALNTLVK | 1.0252 | ||
| 975 | A3 | SVLNDILSR | 0.9214 | ||
| 1020 | A3 | ASANLAATK | 1.2193 | ||
| 1039 | A3 | RVDFCGKGY | 0.7565 | ||
| 1065 | A3 | VTYVPAQEK | 1.3960 | ||
| 1099 | A3 | GTHWFVTQR | 1.0342 | ||
| 1237 | A3 | MTSCCSCLK | 1.3360 | ||
| 1264 | A3 | VLKGVKLHY | 0.9774 | ||
| 2. | Nucleocapsid | 229 | A3 | QLESKMSGK | 1.1019 |
| 249 | A3 | KSAAEASKK | 1.4421 | ||
| 311 | A3 | ASAFFGMSR | 1.0610 | ||
| 361 | A3 | KTFPPTEPK | 1.4314 | ||
| 379 | A3 | TQALPQRQK | 0.9357 | ||
| 3. | Envelope | 30 | A3 | TLAILTALR | 1.1790 |
| 45 | A3 | NIVNVSLVK | 0.9921 | ||
| 55 | A3 | SFYVYSRVK | 1.0275 | ||
| 61 | A3 | RVKNLNSSR | 1.0581 |